19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2447 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2447  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 271 aa  563  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4809  Phytanoyl-CoA dioxygenase  60.31 
 
 		 273 aa  353  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00887466  normal  0.569054 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3622  hypothetical protein  57.14 
 
 		 279 aa  326  2.0000000000000001e-88  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3132  Phytanoyl-CoA dioxygenase  55.94 
 
 		 268 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3328  Phytanoyl-CoA dioxygenase  56.03 
 
 		 269 aa  313  9.999999999999999e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3795  phytanoyl-CoA dioxygenase  52.11 
 
 		 268 aa  295  6e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.39 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.92 
 
 		 273 aa  49.3  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5697  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.99 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  22.94 
 
 		 281 aa  47  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.2 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.2 
 
 		 263 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0114  hypothetical protein  29.32 
 
 		 221 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.715371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.76 
 
 		 239 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.27 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47506  predicted protein  26.14 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0187583  normal  0.27558 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.62 
 
 		 270 aa  43.9  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3838  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 		 272 aa  42.7  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.591246 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  25.86 
 
 		 304 aa  42.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>