22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3328 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3328  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 269 aa  554  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638889 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3132  Phytanoyl-CoA dioxygenase  68.91 
 
 		 268 aa  401  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3795  phytanoyl-CoA dioxygenase  68.91 
 
 		 268 aa  401  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3622  hypothetical protein  61.45 
 
 		 279 aa  342  4e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2447  Phytanoyl-CoA dioxygenase  56.03 
 
 		 271 aa  313  9.999999999999999e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4809  Phytanoyl-CoA dioxygenase  50.97 
 
 		 273 aa  292  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00887466  normal  0.569054 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5697  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.55 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.578788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.12 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.12 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_37164  predicted protein  25.74 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.14 
 
 		 293 aa  50.4  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.57 
 
 		 301 aa  49.3  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.96 
 
 		 320 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  22.5 
 
 		 263 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.23 
 
 		 270 aa  48.5  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  23.56 
 
 		 281 aa  45.8  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  21.74 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.49 
 
 		 275 aa  45.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  24.49 
 
 		 304 aa  44.3  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  21.43 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.6 
 
 		 288 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  23.85 
 
 		 300 aa  42.7  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>