47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II1704 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II1704  MmcH, putative  100 
 
 		 256 aa  532  1e-150  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.408123  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  34.33 
 
 		 284 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.77 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3772  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.69 
 
 		 285 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  27.6 
 
 		 271 aa  86.7  3e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.67 
 
 		 315 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.64 
 
 		 282 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3316  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.17 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.627312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.81 
 
 		 269 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  27.82 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  24.9 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2590  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.88 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2527  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.48 
 
 		 292 aa  58.9  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.08 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  25.29 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.05 
 
 		 281 aa  52.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.05 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.05 
 
 		 257 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2023  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.79 
 
 		 272 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.05 
 
 		 257 aa  50.8  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6790  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.08 
 
 		 292 aa  50.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  28.57 
 
 		 304 aa  48.1  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  24.19 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.19 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.19 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.19 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5239  hypothetical protein  27.19 
 
 		 259 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.768643  normal  0.611643 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.88 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.32 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  23.31 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  23.31 
 
 		 253 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  23.31 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.55 
 
 		 306 aa  47  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4330  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.14 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  0.0982563 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4440  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.14 
 
 		 292 aa  46.6  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.588314 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  20.27 
 
 		 267 aa  45.4  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1020  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.33 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0615  hypothetical protein  21.18 
 
 		 329 aa  44.3  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.25162  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  23.97 
 
 		 296 aa  44.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.63 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.69 
 
 		 257 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.62 
 
 		 288 aa  43.5  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.92 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.57 
 
 		 285 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.07 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  22.78 
 
 		 252 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.58 
 
 		 280 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>