23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1647 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1647  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 323 aa  676    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6245  Phytanoyl-CoA dioxygenase  45.92 
 
 		 320 aa  282  6.000000000000001e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.154868  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3969  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.05 
 
 		 382 aa  251  2e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1767  phytanoyl-CoA dioxygenase  39.66 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2379  phytanoyl-CoA dioxygenase  39.66 
 
 		 350 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5063  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.53 
 
 		 305 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15519  normal  0.353724 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5986  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.57 
 
 		 344 aa  103  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0323  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.88 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.46 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1946  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.35 
 
 		 372 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.29 
 
 		 286 aa  50.4  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.100196  normal  0.282498 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.02 
 
 		 254 aa  47.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  26.13 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3472  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.26 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0454164  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4561  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.93 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0463237 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.86 
 
 		 300 aa  43.5  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  25.15 
 
 		 281 aa  43.1  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7153  hypothetical protein  25 
 
 		 304 aa  43.1  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.32 
 
 		 270 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.24 
 
 		 271 aa  42.7  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  24.89 
 
 		 304 aa  42.7  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  28.49 
 
 		 296 aa  42.4  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>