24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1088 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1088  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 254 aa  520  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.326612 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  76.42 
 
 		 256 aa  389  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2701  phytanoyl-CoA dioxygenase  67.08 
 
 		 248 aa  341  8e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.963654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3404  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin, putative  28.69 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000622866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.88 
 
 		 265 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.07 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1305  hypothetical protein  25.19 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13664  hypothetical protein  29.12 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0231349 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0445  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.61 
 
 		 282 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  24.19 
 
 		 271 aa  54.3  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3882  phytanoyl-CoA dioxygenase  36.73 
 
 		 316 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11532  hypothetical protein  23.42 
 
 		 273 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.547495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2677  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.04 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0212  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.18 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.17 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0830  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.94 
 
 		 267 aa  46.6  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.509677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  27.59 
 
 		 284 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5186  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30 
 
 		 284 aa  43.5  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839073 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.16 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0983  hypothetical protein  35.16 
 
 		 220 aa  43.1  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0447531  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0067  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.81 
 
 		 271 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3752  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.23 
 
 		 259 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.263917 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3369  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.87 
 
 		 227 aa  42  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.78 
 
 		 260 aa  42  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>