12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_41583 on replicon NC_011700
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011700  PHATRDRAFT_41583  predicted protein  100 
 
 		 432 aa  899    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.531916  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34628  predicted protein  98.55 
 
 		 214 aa  414  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00394186  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87319  predicted protein  33.61 
 
 		 280 aa  131  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.132379  decreased coverage  0.000311139 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48742  predicted protein  35 
 
 		 304 aa  117  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.526159  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15487  predicted protein  31.88 
 
 		 326 aa  96.7  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320595  decreased coverage  0.000298049 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46716  predicted protein  34.85 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.269942  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  31.11 
 
 		 566 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.09 
 
 		 265 aa  46.6  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31394  predicted protein  25.98 
 
 		 314 aa  45.4  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.7 
 
 		 260 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.04 
 
 		 260 aa  44.3  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10130  dioxygenase  25 
 
 		 256 aa  43.5  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00000187903  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>