14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_46716 on replicon NC_011679
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011679  PHATR_46716  predicted protein  100 
 
 		 282 aa  586  1e-166  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.269942  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31394  predicted protein  29.29 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92828  predicted protein  33.33 
 
 		 566 aa  67  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_41583  predicted protein  34.85 
 
 		 432 aa  66.6  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.531916  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45338  predicted protein  27.27 
 
 		 893 aa  53.5  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.506696  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_87319  predicted protein  30.51 
 
 		 280 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.132379  decreased coverage  0.000311139 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48742  predicted protein  28 
 
 		 304 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.526159  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1020  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.29 
 
 		 296 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.01 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2409  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.53 
 
 		 230 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00937335 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15487  predicted protein  25.53 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.320595  decreased coverage  0.000298049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0752  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.13 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06818  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00480)  27.94 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.434401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  21.79 
 
 		 280 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>