24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH03160 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006693  CNH03160  conserved hypothetical protein  100 
 
 
433 aa  902    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.661561  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03000  conserved hypothetical protein  72.34 
 
 
394 aa  633  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.472148  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06051  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G09620)  46.73 
 
 
410 aa  351  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4033  Phytanoyl-CoA dioxygenase  45.24 
 
 
396 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.436862 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26210  Phytanoyl-CoA dioxygenase protein  45.38 
 
 
398 aa  344  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3772  Phytanoyl-CoA dioxygenase  44.88 
 
 
395 aa  331  1e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561015  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1813  phytanoyl-CoA dioxygenase  42.71 
 
 
393 aa  323  3e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.864664 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2406  Phytanoyl-CoA dioxygenase  42.59 
 
 
398 aa  320  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1428  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.35 
 
 
382 aa  320  3.9999999999999996e-86  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.809947 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3531  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.42 
 
 
393 aa  319  5e-86  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2769  Phytanoyl-CoA dioxygenase  42.44 
 
 
395 aa  315  7e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4205  Phytanoyl-CoA dioxygenase  45.66 
 
 
404 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.351992 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3484  Phytanoyl-CoA dioxygenase  44.02 
 
 
395 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.660208 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2885  phytanoyl-CoA dioxygenase  42.59 
 
 
398 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.971655  hitchhiker  0.000000189088 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3967  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.7 
 
 
400 aa  308  8e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2614  phytanoyl-CoA dioxygenase  44.85 
 
 
387 aa  307  3e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1851  phytanoyl-CoA dioxygenase  42.55 
 
 
391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1278  phytanoyl-CoA dioxygenase  43.39 
 
 
389 aa  303  5.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0445475  normal  0.279697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3592  Phytanoyl-CoA dioxygenase  40.31 
 
 
399 aa  288  1e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0569  hypothetical protein  23.67 
 
 
284 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11097  conserved hypothetical protein  24.16 
 
 
320 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00013392  normal  0.168344 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2814  hypothetical protein  27.27 
 
 
289 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0110408  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 
288 aa  46.6  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6796  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.03 
 
 
291 aa  44.3  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.785476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>