18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3564 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3564  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  482  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3038  Phytanoyl-CoA dioxygenase  59.5 
 
 		 279 aa  284  7e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.729271  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  51.5 
 
 		 275 aa  238  6.999999999999999e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0218629 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.78 
 
 		 268 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25 
 
 		 283 aa  52  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6398  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.89 
 
 		 288 aa  50.4  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.04 
 
 		 260 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  30.52 
 
 		 300 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1922  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.1 
 
 		 390 aa  44.3  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.902766  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.59 
 
 		 303 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.59 
 
 		 303 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1343  ectoine hydroxylase  23.66 
 
 		 304 aa  43.5  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00503536 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.59 
 
 		 303 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.69 
 
 		 285 aa  43.5  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.93 
 
 		 270 aa  43.1  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.12 
 
 		 260 aa  42.4  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29154  predicted protein  30.61 
 
 		 305 aa  42.4  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.971691  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  24.43 
 
 		 296 aa  41.6  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>