More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08570 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  100 
 
 		 365 aa  733    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  54.35 
 
 		 396 aa  345  1e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.393457 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  48.5 
 
 		 389 aa  314  9.999999999999999e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  51.31 
 
 		 442 aa  309  5e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  46.03 
 
 		 417 aa  287  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  46.5 
 
 		 395 aa  288  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1864  cell envelope-related transcriptional attenuator  46.15 
 
 		 391 aa  286  5.999999999999999e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.036217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  46.87 
 
 		 373 aa  279  5e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3214  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.58 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235319 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0589  putative transcriptional regulator  35.65 
 
 		 498 aa  238  1e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.581304 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.98 
 
 		 506 aa  229  5e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.54 
 
 		 478 aa  223  3e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.81 
 
 		 379 aa  222  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1025  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.47 
 
 		 434 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11457  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  39.29 
 
 		 395 aa  209  6e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1026  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.64 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.999724  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.3 
 
 		 400 aa  206  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.49 
 
 		 480 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.32 
 
 		 468 aa  199  7e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.05 
 
 		 453 aa  189  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  40.53 
 
 		 481 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.65 
 
 		 540 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.73 
 
 		 468 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00540  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  41.01 
 
 		 357 aa  182  7e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.916603  normal  0.105126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.29 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.3 
 
 		 618 aa  175  9e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.41 
 
 		 481 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  33.52 
 
 		 530 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.46 
 
 		 520 aa  170  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.56 
 
 		 584 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.92 
 
 		 643 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.44 
 
 		 465 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.35 
 
 		 549 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.56 
 
 		 521 aa  152  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.56 
 
 		 487 aa  150  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.39 
 
 		 497 aa  150  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.63 
 
 		 512 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.15 
 
 		 504 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.11 
 
 		 509 aa  143  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  32.6 
 
 		 505 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.43 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.43 
 
 		 336 aa  137  4e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.15 
 
 		 491 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.23 
 
 		 486 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.94 
 
 		 619 aa  132  7.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.13 
 
 		 499 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.4 
 
 		 551 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.72 
 
 		 393 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4529  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.78 
 
 		 365 aa  126  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.6 
 
 		 414 aa  124  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.51 
 
 		 573 aa  123  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.55 
 
 		 520 aa  122  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.94 
 
 		 625 aa  121  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  32.66 
 
 		 420 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.31 
 
 		 311 aa  115  8.999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.31 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.31 
 
 		 311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.43 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  28.47 
 
 		 734 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.15 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.94 
 
 		 545 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.9 
 
 		 320 aa  112  9e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.44 
 
 		 516 aa  112  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.48 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.94 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.04 
 
 		 563 aa  112  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.04 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  29.63 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  30 
 
 		 687 aa  110  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  30.82 
 
 		 349 aa  109  8.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.58 
 
 		 404 aa  107  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.6 
 
 		 649 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  30.25 
 
 		 684 aa  108  2e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.92 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.16 
 
 		 407 aa  107  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  31 
 
 		 699 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  31 
 
 		 699 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  31 
 
 		 701 aa  106  7e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.57 
 
 		 409 aa  106  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.53 
 
 		 374 aa  106  8e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.8 
 
 		 560 aa  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.57 
 
 		 466 aa  104  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.1 
 
 		 496 aa  104  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1808  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.31 
 
 		 424 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.37 
 
 		 732 aa  103  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1996  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.59 
 
 		 527 aa  102  8e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.06 
 
 		 538 aa  102  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.86 
 
 		 567 aa  102  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.8 
 
 		 1336 aa  100  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.34 
 
 		 517 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  28.62 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.91 
 
 		 521 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.79 
 
 		 410 aa  100  6e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.15 
 
 		 493 aa  100  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.19 
 
 		 585 aa  99.8  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  28.66 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.34 
 
 		 493 aa  99  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13296  CPSA-related protein  29.71 
 
 		 497 aa  99  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1700  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.75 
 
 		 463 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1395  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.45 
 
 		 404 aa  97.4  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>