More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1363 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  100 
 
 		 530 aa  1078    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  54.32 
 
 		 618 aa  491  1e-137  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.56 
 
 		 468 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.52 
 
 		 481 aa  318  2e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.07 
 
 		 478 aa  311  2e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  43.38 
 
 		 481 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.8 
 
 		 468 aa  298  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.08 
 
 		 480 aa  267  2.9999999999999995e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.65 
 
 		 506 aa  262  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.36 
 
 		 584 aa  239  9e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.99 
 
 		 453 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.61 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.45 
 
 		 465 aa  225  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.32 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  39.46 
 
 		 395 aa  205  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.59 
 
 		 509 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.87 
 
 		 379 aa  201  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.8 
 
 		 520 aa  200  6e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.03 
 
 		 549 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.1 
 
 		 491 aa  196  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.32 
 
 		 521 aa  195  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.48 
 
 		 643 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.01 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.72 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  34.58 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.3 
 
 		 516 aa  188  2e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.54 
 
 		 406 aa  188  2e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.25 
 
 		 573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  36.27 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.56 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.393457 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.97 
 
 		 487 aa  182  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 499 aa  179  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.77 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1864  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.23 
 
 		 391 aa  177  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.036217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.59 
 
 		 625 aa  175  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.64 
 
 		 619 aa  174  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.52 
 
 		 365 aa  173  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.16 
 
 		 486 aa  172  1e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.4 
 
 		 520 aa  172  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.72 
 
 		 1336 aa  171  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.93 
 
 		 540 aa  170  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.57 
 
 		 512 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.95 
 
 		 504 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  30.95 
 
 		 505 aa  167  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.05 
 
 		 522 aa  162  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.53 
 
 		 526 aa  161  3e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.16 
 
 		 545 aa  160  7e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  31.83 
 
 		 373 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.26 
 
 		 732 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.84 
 
 		 521 aa  156  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  29.89 
 
 		 684 aa  156  9e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  28.2 
 
 		 734 aa  156  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.61 
 
 		 551 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.4 
 
 		 687 aa  152  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.51 
 
 		 649 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.14 
 
 		 414 aa  151  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5903  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.89 
 
 		 508 aa  150  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.667474 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.34 
 
 		 701 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  35.4 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.53 
 
 		 699 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.53 
 
 		 699 aa  146  1e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.26 
 
 		 567 aa  144  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.41 
 
 		 394 aa  143  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.49 
 
 		 517 aa  142  9.999999999999999e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.59 
 
 		 320 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.86 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.65 
 
 		 336 aa  141  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.47 
 
 		 362 aa  140  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  35.32 
 
 		 307 aa  139  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3214  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.99 
 
 		 443 aa  139  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235319 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.23 
 
 		 381 aa  138  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0762  transcriptional regulator  31.12 
 
 		 489 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.47 
 
 		 409 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.26 
 
 		 538 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 		 307 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1025  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.63 
 
 		 434 aa  134  5e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11457  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.85 
 
 		 404 aa  133  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  34.62 
 
 		 326 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.32 
 
 		 393 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  33.59 
 
 		 296 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.96 
 
 		 407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.02 
 
 		 434 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.03 
 
 		 434 aa  131  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0589  putative transcriptional regulator  28.52 
 
 		 498 aa  130  6e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.581304 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3034  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.23 
 
 		 379 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.63975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.03 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.55 
 
 		 405 aa  128  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4652  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.88 
 
 		 717 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.37 
 
 		 493 aa  127  5e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.97 
 
 		 560 aa  126  9e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  30.03 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.03 
 
 		 410 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.07 
 
 		 493 aa  125  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00540  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.44 
 
 		 357 aa  125  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.916603  normal  0.105126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1395  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.57 
 
 		 404 aa  124  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330473  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.42 
 
 		 306 aa  124  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0588  putative transcriptional regulator  31.64 
 
 		 432 aa  123  9e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.952975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.12 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.12 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.12 
 
 		 311 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>