More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6814 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 1336 aa  2561    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  49.59 
 
 		 619 aa  350  1e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  37.96 
 
 		 734 aa  337  7.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.2 
 
 		 699 aa  294  7e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.2 
 
 		 699 aa  294  7e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.05 
 
 		 701 aa  294  9e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  36.88 
 
 		 684 aa  282  3e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.5 
 
 		 687 aa  282  4e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.58 
 
 		 649 aa  274  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.61 
 
 		 551 aa  241  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.14 
 
 		 497 aa  181  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4529  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.18 
 
 		 365 aa  179  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.07 
 
 		 468 aa  173  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.58 
 
 		 478 aa  171  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  33.83 
 
 		 530 aa  166  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.38 
 
 		 509 aa  166  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.49 
 
 		 512 aa  163  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.29 
 
 		 491 aa  163  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  30.22 
 
 		 505 aa  162  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.42 
 
 		 506 aa  161  7e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.47 
 
 		 516 aa  159  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.94 
 
 		 486 aa  160  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.36 
 
 		 573 aa  159  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.11 
 
 		 468 aa  159  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  31.03 
 
 		 481 aa  156  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.88 
 
 		 618 aa  156  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.18 
 
 		 560 aa  154  8.999999999999999e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  36.75 
 
 		 395 aa  150  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.06 
 
 		 453 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.79 
 
 		 400 aa  149  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.02 
 
 		 520 aa  149  4.0000000000000006e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.16 
 
 		 549 aa  147  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.97 
 
 		 625 aa  147  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.92 
 
 		 390 aa  146  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  37.5 
 
 		 417 aa  147  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.61 
 
 		 584 aa  145  3e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.64 
 
 		 504 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.73 
 
 		 406 aa  144  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4652  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.87 
 
 		 717 aa  142  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.09 
 
 		 481 aa  142  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.24 
 
 		 480 aa  141  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.63 
 
 		 545 aa  140  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.72 
 
 		 526 aa  135  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.5 
 
 		 521 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.47 
 
 		 521 aa  132  5.0000000000000004e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.27 
 
 		 520 aa  130  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.49 
 
 		 487 aa  129  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.14 
 
 		 442 aa  125  4e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.69 
 
 		 499 aa  125  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.45 
 
 		 379 aa  124  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.16 
 
 		 643 aa  122  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  34.19 
 
 		 395 aa  120  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0589  putative transcriptional regulator  29.51 
 
 		 498 aa  120  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.581304 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5903  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.62 
 
 		 508 aa  120  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.667474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.71 
 
 		 466 aa  119  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1852  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  27.05 
 
 		 676 aa  119  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.84 
 
 		 465 aa  118  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  33.91 
 
 		 307 aa  117  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.53 
 
 		 414 aa  117  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.13 
 
 		 567 aa  116  3e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1864  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.05 
 
 		 391 aa  114  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.036217 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.38 
 
 		 382 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  29.47 
 
 		 420 aa  110  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.46 
 
 		 522 aa  108  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.42 
 
 		 381 aa  108  7e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.09 
 
 		 396 aa  107  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.393457 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  32 
 
 		 349 aa  105  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.97 
 
 		 434 aa  103  2e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  32.65 
 
 		 326 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4511  transcription attenuator LytR  32.91 
 
 		 358 aa  103  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.85 
 
 		 540 aa  103  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  31 
 
 		 393 aa  102  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  31.21 
 
 		 373 aa  102  5e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  29.88 
 
 		 296 aa  102  6e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.57 
 
 		 493 aa  102  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.95 
 
 		 496 aa  101  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.99 
 
 		 404 aa  101  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.16 
 
 		 389 aa  100  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.56 
 
 		 409 aa  100  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.8 
 
 		 365 aa  99  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.77 
 
 		 517 aa  98.2  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.4 
 
 		 538 aa  98.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.23 
 
 		 414 aa  97.8  1e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3034  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 		 379 aa  97.8  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.63975 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.02 
 
 		 419 aa  97.8  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0762  transcriptional regulator  29.11 
 
 		 489 aa  95.9  4e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  27.24 
 
 		 434 aa  95.9  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.42 
 
 		 407 aa  95.9  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.95 
 
 		 362 aa  95.1  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.93 
 
 		 410 aa  94.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.67 
 
 		 307 aa  93.6  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5021  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.26 
 
 		 312 aa  93.2  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.61 
 
 		 336 aa  93.2  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1395  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.34 
 
 		 404 aa  92.4  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330473  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.94 
 
 		 306 aa  92.4  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.48 
 
 		 320 aa  91.7  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.74 
 
 		 311 aa  90.1  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.74 
 
 		 311 aa  90.1  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.74 
 
 		 311 aa  89.7  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.19 
 
 		 493 aa  90.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>