More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3496 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 486 aa  968    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  63.44 
 
 		 512 aa  498  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  50.71 
 
 		 625 aa  318  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.14 
 
 		 573 aa  299  7e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  46.7 
 
 		 545 aa  295  1e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.18 
 
 		 560 aa  264  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  48.05 
 
 		 491 aa  262  8e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.27 
 
 		 516 aa  257  3e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  46.76 
 
 		 520 aa  256  7e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.77 
 
 		 526 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.83 
 
 		 390 aa  208  2e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5903  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.12 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.667474 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.03 
 
 		 497 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.36 
 
 		 393 aa  187  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.2 
 
 		 509 aa  186  6e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  37.87 
 
 		 481 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  38.1 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.26 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.62 
 
 		 468 aa  177  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.2 
 
 		 506 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.26 
 
 		 478 aa  173  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  34.16 
 
 		 530 aa  173  6.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  37.55 
 
 		 307 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.45 
 
 		 480 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.32 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  36.36 
 
 		 619 aa  170  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.25 
 
 		 504 aa  170  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.84 
 
 		 453 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.2 
 
 		 468 aa  169  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.75 
 
 		 549 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.68 
 
 		 466 aa  167  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.78 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.26 
 
 		 481 aa  166  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  34.22 
 
 		 505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.09 
 
 		 567 aa  164  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.58 
 
 		 521 aa  163  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.54 
 
 		 732 aa  162  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.87 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  35.48 
 
 		 395 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.68 
 
 		 320 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  33.74 
 
 		 349 aa  160  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.89 
 
 		 618 aa  159  1e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.3 
 
 		 307 aa  158  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.29 
 
 		 1336 aa  158  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.91 
 
 		 584 aa  158  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.88 
 
 		 520 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  34.94 
 
 		 417 aa  158  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.04 
 
 		 643 aa  154  2.9999999999999998e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.46 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.53 
 
 		 434 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  33.14 
 
 		 734 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.46 
 
 		 311 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.46 
 
 		 311 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.45 
 
 		 409 aa  153  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  34.55 
 
 		 296 aa  152  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.66 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.69 
 
 		 404 aa  150  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1852  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  31.43 
 
 		 676 aa  150  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.86 
 
 		 389 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.93 
 
 		 382 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.3 
 
 		 407 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.07 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.41 
 
 		 538 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.08 
 
 		 522 aa  146  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1395  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.47 
 
 		 404 aa  146  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330473  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  33.7 
 
 		 395 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0762  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 489 aa  145  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.4 
 
 		 336 aa  145  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.73 
 
 		 487 aa  145  2e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.2 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1808  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.98 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.07 
 
 		 306 aa  144  3e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.59 
 
 		 493 aa  144  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2384  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.47 
 
 		 303 aa  143  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174416  hitchhiker  0.00797054 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.21 
 
 		 493 aa  143  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.08 
 
 		 521 aa  143  7e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.39 
 
 		 517 aa  142  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.46 
 
 		 465 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.95 
 
 		 377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.13 
 
 		 442 aa  140  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  33.69 
 
 		 684 aa  139  7.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1318  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.79 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1335  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.79 
 
 		 490 aa  139  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962054  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1354  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.79 
 
 		 490 aa  139  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0429862  normal  0.395159 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13296  CPSA-related protein  32.19 
 
 		 497 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1165  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  34.95 
 
 		 363 aa  137  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35 
 
 		 374 aa  137  5e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.91 
 
 		 410 aa  136  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.92 
 
 		 551 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.9 
 
 		 448 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.742286  normal  0.880699 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.8 
 
 		 499 aa  134  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.23 
 
 		 365 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  37.25 
 
 		 326 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3034  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.96 
 
 		 379 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.63975 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2595  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.51 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.93 
 
 		 540 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1864  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.21 
 
 		 391 aa  129  9.000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.036217 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.84 
 
 		 396 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.393457 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.17 
 
 		 496 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7119  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.24 
 
 		 382 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>