More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1167 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  100 
 
 		 417 aa  839    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  45.57 
 
 		 395 aa  312  7.999999999999999e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  46.9 
 
 		 365 aa  296  4e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.78 
 
 		 442 aa  286  5.999999999999999e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  47.41 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  43.99 
 
 		 396 aa  269  7e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.393457 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.68 
 
 		 506 aa  256  6e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1025  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.78 
 
 		 434 aa  246  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11457  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  46.76 
 
 		 373 aa  246  6.999999999999999e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1864  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.89 
 
 		 391 aa  227  3e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.036217 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1026  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.78 
 
 		 402 aa  227  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.999724  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3214  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.5 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.4 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.84 
 
 		 453 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.58 
 
 		 480 aa  208  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  38.83 
 
 		 395 aa  209  1e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0589  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 498 aa  209  1e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.581304 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  41.87 
 
 		 481 aa  207  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.61 
 
 		 478 aa  207  3e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.68 
 
 		 468 aa  206  7e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.96 
 
 		 400 aa  202  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.9 
 
 		 584 aa  202  8e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  34.32 
 
 		 530 aa  188  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.37 
 
 		 406 aa  186  7e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00540  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  40.77 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.916603  normal  0.105126 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.61 
 
 		 520 aa  179  5.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  36.77 
 
 		 619 aa  178  2e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.71 
 
 		 618 aa  178  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.49 
 
 		 643 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.02 
 
 		 509 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.98 
 
 		 468 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.9 
 
 		 481 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.91 
 
 		 540 aa  171  3e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.82 
 
 		 487 aa  170  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.38 
 
 		 549 aa  169  9e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.98 
 
 		 521 aa  169  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.76 
 
 		 465 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  33.93 
 
 		 505 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.58 
 
 		 491 aa  162  1e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  32.89 
 
 		 734 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.63 
 
 		 497 aa  160  5e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.49 
 
 		 512 aa  159  9e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.94 
 
 		 486 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.12 
 
 		 504 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4529  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.14 
 
 		 365 aa  155  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.82 
 
 		 551 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.5 
 
 		 1336 aa  149  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.73 
 
 		 499 aa  143  7e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.08 
 
 		 573 aa  143  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.62 
 
 		 699 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.2 
 
 		 390 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.62 
 
 		 699 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.19 
 
 		 701 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  36.43 
 
 		 684 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.72 
 
 		 560 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.78 
 
 		 625 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.52 
 
 		 687 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 649 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.27 
 
 		 311 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.59 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.59 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  31.41 
 
 		 349 aa  126  6e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.67 
 
 		 520 aa  126  6e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.72 
 
 		 434 aa  122  9e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 516 aa  122  9e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  34.24 
 
 		 307 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.31 
 
 		 404 aa  120  3e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.66 
 
 		 307 aa  120  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.11 
 
 		 362 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.74 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.19 
 
 		 495 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.97 
 
 		 545 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.33 
 
 		 466 aa  117  5e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.49 
 
 		 563 aa  115  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.88 
 
 		 407 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.64 
 
 		 732 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  34.07 
 
 		 296 aa  114  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.09 
 
 		 526 aa  114  3e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.65 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.17 
 
 		 521 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.92 
 
 		 393 aa  113  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.33 
 
 		 306 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.96 
 
 		 356 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.18 
 
 		 336 aa  113  8.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.21 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.31 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  27.27 
 
 		 522 aa  110  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  26.18 
 
 		 512 aa  110  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.07 
 
 		 414 aa  110  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1852  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  31.1 
 
 		 676 aa  109  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  28.53 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.42 
 
 		 320 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5903  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.87 
 
 		 508 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.667474 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.08 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.88 
 
 		 434 aa  106  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01950  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.3 
 
 		 516 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000132864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0762  transcriptional regulator  29.39 
 
 		 489 aa  104  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0125  putative transcriptional regulator  34.11 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00440963  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.5 
 
 		 377 aa  103  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1395  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.47 
 
 		 404 aa  103  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>