More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2228 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  76.54 
 
 		 487 aa  724    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 521 aa  1053    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  62.16 
 
 		 499 aa  566  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.96 
 
 		 540 aa  268  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.24 
 
 		 468 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.44 
 
 		 480 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.59 
 
 		 478 aa  219  1e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.73 
 
 		 400 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.46 
 
 		 453 aa  210  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.84 
 
 		 618 aa  209  7e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.35 
 
 		 379 aa  208  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  37.68 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.24 
 
 		 468 aa  203  7e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  30.54 
 
 		 530 aa  199  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  36 
 
 		 481 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.72 
 
 		 506 aa  192  1e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.81 
 
 		 481 aa  190  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.12 
 
 		 549 aa  184  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  33.04 
 
 		 734 aa  183  6e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.39 
 
 		 520 aa  181  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.64 
 
 		 584 aa  178  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.64 
 
 		 406 aa  171  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  30.9 
 
 		 417 aa  168  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.62 
 
 		 497 aa  166  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  32.24 
 
 		 395 aa  162  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.3 
 
 		 551 aa  161  3e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.89 
 
 		 465 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.96 
 
 		 504 aa  160  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.74 
 
 		 389 aa  159  1e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.6 
 
 		 643 aa  157  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.33 
 
 		 396 aa  156  7e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.393457 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.15 
 
 		 509 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.36 
 
 		 442 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.56 
 
 		 365 aa  151  2e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  32.44 
 
 		 505 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.18 
 
 		 701 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.12 
 
 		 516 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0589  putative transcriptional regulator  32.74 
 
 		 498 aa  151  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.581304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.1 
 
 		 699 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.1 
 
 		 699 aa  149  8e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.97 
 
 		 545 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3214  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.07 
 
 		 443 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235319 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.77 
 
 		 512 aa  146  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.94 
 
 		 619 aa  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.08 
 
 		 486 aa  144  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.53 
 
 		 649 aa  143  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  30.54 
 
 		 373 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.47 
 
 		 390 aa  140  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.33 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.59 
 
 		 687 aa  138  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  30.15 
 
 		 684 aa  137  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.38 
 
 		 491 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.9 
 
 		 573 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.38 
 
 		 377 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.06 
 
 		 1336 aa  134  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.03 
 
 		 625 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  33.23 
 
 		 349 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1864  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.69 
 
 		 391 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.036217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.62 
 
 		 520 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  25.31 
 
 		 522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13519  hypothetical protein  27.45 
 
 		 512 aa  129  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100718 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1025  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.46 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.24 
 
 		 526 aa  124  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.84 
 
 		 732 aa  122  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.31 
 
 		 567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.57 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.97 
 
 		 336 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  29.84 
 
 		 420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.46 
 
 		 410 aa  120  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4529  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.5 
 
 		 365 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.92 
 
 		 381 aa  119  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.35 
 
 		 393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.35 
 
 		 496 aa  116  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.47 
 
 		 521 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1852  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  28.8 
 
 		 676 aa  114  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8771  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.21 
 
 		 547 aa  113  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.44 
 
 		 362 aa  112  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.01 
 
 		 563 aa  111  3e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1296  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.44 
 
 		 414 aa  110  8.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5903  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.91 
 
 		 508 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.667474 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0762  transcriptional regulator  33.49 
 
 		 489 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.93 
 
 		 434 aa  108  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7119  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.9 
 
 		 382 aa  107  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.28 
 
 		 512 aa  105  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.19 
 
 		 409 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.1 
 
 		 320 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1912  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.95 
 
 		 664 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  24.58 
 
 		 538 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3034  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.34 
 
 		 379 aa  104  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.63975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1318  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.99 
 
 		 490 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1335  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.99 
 
 		 490 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962054  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1354  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.99 
 
 		 490 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0429862  normal  0.395159 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.6 
 
 		 407 aa  103  7e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  31.9 
 
 		 296 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.62 
 
 		 493 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1026  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.17 
 
 		 402 aa  101  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.999724  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.51 
 
 		 419 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00540  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.41 
 
 		 357 aa  100  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.916603  normal  0.105126 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.91 
 
 		 356 aa  100  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.91 
 
 		 434 aa  100  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>