More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0712 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 573 aa  1153    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  56.89 
 
 		 625 aa  571  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  48.28 
 
 		 516 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  45.61 
 
 		 545 aa  348  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  46.22 
 
 		 520 aa  339  8e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.57 
 
 		 486 aa  313  7.999999999999999e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  49 
 
 		 512 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.8 
 
 		 526 aa  308  2.0000000000000002e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5903  cell envelope-related transcriptional attenuator  45.45 
 
 		 508 aa  260  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.667474 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.78 
 
 		 491 aa  231  2e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.4 
 
 		 509 aa  227  4e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.9 
 
 		 560 aa  226  1e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.23 
 
 		 521 aa  225  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.01 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.39 
 
 		 390 aa  214  3.9999999999999995e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.75 
 
 		 549 aa  212  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.62 
 
 		 468 aa  209  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  33.76 
 
 		 505 aa  202  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.21 
 
 		 481 aa  196  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.44 
 
 		 478 aa  195  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  34.11 
 
 		 530 aa  194  3e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.2 
 
 		 480 aa  193  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.38 
 
 		 468 aa  193  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  34 
 
 		 504 aa  192  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.48 
 
 		 522 aa  188  3e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.05 
 
 		 517 aa  183  9.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.11 
 
 		 732 aa  182  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.94 
 
 		 618 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1852  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  29.87 
 
 		 676 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  32.35 
 
 		 481 aa  179  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.75 
 
 		 506 aa  179  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1354  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.29 
 
 		 490 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0429862  normal  0.395159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.78 
 
 		 1336 aa  175  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1318  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.29 
 
 		 490 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940107  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.26 
 
 		 567 aa  174  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1335  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.29 
 
 		 490 aa  174  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962054  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.73 
 
 		 453 aa  174  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  35.74 
 
 		 420 aa  174  5e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.04 
 
 		 493 aa  171  2e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.09 
 
 		 414 aa  170  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.18 
 
 		 307 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.21 
 
 		 496 aa  169  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.57 
 
 		 493 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.72 
 
 		 466 aa  167  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.86 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.44 
 
 		 584 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.1 
 
 		 520 aa  162  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  36.88 
 
 		 349 aa  161  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  36.84 
 
 		 307 aa  161  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.96 
 
 		 409 aa  160  8e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.35 
 
 		 311 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.67 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.48 
 
 		 551 aa  158  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.35 
 
 		 311 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.21 
 
 		 306 aa  158  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.46 
 
 		 465 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.35 
 
 		 311 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.33 
 
 		 619 aa  156  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13296  CPSA-related protein  29.54 
 
 		 497 aa  155  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.34 
 
 		 434 aa  154  5e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.2 
 
 		 393 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.39 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.11 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.3 
 
 		 643 aa  151  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1808  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.63 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.9 
 
 		 400 aa  151  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  28.32 
 
 		 734 aa  149  1.0000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.68 
 
 		 336 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  40.09 
 
 		 296 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13519  hypothetical protein  26.21 
 
 		 512 aa  148  3e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.98 
 
 		 410 aa  148  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1395  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.07 
 
 		 404 aa  148  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.97 
 
 		 379 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2595  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.47 
 
 		 313 aa  147  8.000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  33.75 
 
 		 417 aa  147  8.000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1165  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  36.47 
 
 		 363 aa  145  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.41 
 
 		 521 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  34.98 
 
 		 395 aa  145  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2384  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.69 
 
 		 303 aa  144  5e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174416  hitchhiker  0.00797054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 		 382 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.44 
 
 		 406 aa  144  5e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.77 
 
 		 538 aa  143  8e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.46 
 
 		 487 aa  143  8e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.63 
 
 		 394 aa  143  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.71 
 
 		 540 aa  141  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  35.96 
 
 		 326 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.25 
 
 		 381 aa  139  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.86 
 
 		 377 aa  139  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3034  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.1 
 
 		 379 aa  138  3.0000000000000003e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.63975 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8771  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.01 
 
 		 547 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.62 
 
 		 448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.742286  normal  0.880699 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  28.31 
 
 		 684 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.85 
 
 		 407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.01 
 
 		 499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.96 
 
 		 699 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.96 
 
 		 699 aa  131  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4652  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.98 
 
 		 717 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.66 
 
 		 649 aa  131  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3959  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.46 
 
 		 463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.05 
 
 		 701 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>