274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8771 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8771  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 547 aa  1102    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1912  cell envelope-related transcriptional attenuator  60.26 
 
 		 664 aa  459  9.999999999999999e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1296  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.12 
 
 		 414 aa  300  5e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13519  hypothetical protein  39.38 
 
 		 512 aa  293  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100718 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.54 
 
 		 522 aa  242  2e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.64 
 
 		 538 aa  238  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.11 
 
 		 493 aa  236  6e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.5 
 
 		 732 aa  235  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.1 
 
 		 517 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.36 
 
 		 496 aa  233  5e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7119  cell envelope-related transcriptional attenuator  46.15 
 
 		 382 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13296  CPSA-related protein  33.27 
 
 		 497 aa  221  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1354  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.11 
 
 		 490 aa  216  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0429862  normal  0.395159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1318  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.11 
 
 		 490 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1335  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.11 
 
 		 490 aa  216  7e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962054  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.21 
 
 		 567 aa  216  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.07 
 
 		 493 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1299  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.69 
 
 		 340 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1852  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  40.11 
 
 		 676 aa  200  5e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.92 
 
 		 410 aa  198  2.0000000000000003e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.52 
 
 		 521 aa  187  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06070  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.98 
 
 		 514 aa  179  9e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.974325  normal  0.0563121 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.11 
 
 		 491 aa  151  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.77 
 
 		 468 aa  140  7e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  28.09 
 
 		 481 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  26.22 
 
 		 734 aa  127  7e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  26.71 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.2 
 
 		 618 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.93 
 
 		 481 aa  120  7e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.8 
 
 		 497 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.56 
 
 		 478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.95 
 
 		 573 aa  118  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.19 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  31.28 
 
 		 395 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.83 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.2 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.5 
 
 		 521 aa  114  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.03 
 
 		 625 aa  114  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  27.46 
 
 		 530 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.61 
 
 		 506 aa  113  9e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.17 
 
 		 504 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  28.09 
 
 		 420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.04 
 
 		 486 aa  110  5e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.85 
 
 		 585 aa  110  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.25 
 
 		 516 aa  110  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.56 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.89 
 
 		 509 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  27.4 
 
 		 395 aa  109  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.33 
 
 		 336 aa  109  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.42 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.54 
 
 		 549 aa  107  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.84 
 
 		 545 aa  106  8e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.97 
 
 		 499 aa  106  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.83 
 
 		 512 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.79 
 
 		 379 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.52 
 
 		 393 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.39 
 
 		 649 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.05 
 
 		 701 aa  103  9e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.86 
 
 		 699 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.86 
 
 		 699 aa  101  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.02 
 
 		 468 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.39 
 
 		 643 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.28 
 
 		 320 aa  97.1  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.21 
 
 		 687 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3559  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.71 
 
 		 352 aa  95.5  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.9 
 
 		 453 aa  94.7  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.24 
 
 		 306 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.27 
 
 		 409 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.67 
 
 		 307 aa  92.8  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.91 
 
 		 404 aa  92.4  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.43 
 
 		 551 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3959  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.21 
 
 		 463 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1996  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.31 
 
 		 527 aa  91.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.05 
 
 		 311 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.05 
 
 		 311 aa  91.7  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.05 
 
 		 311 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.03 
 
 		 434 aa  90.5  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  26.18 
 
 		 684 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.14 
 
 		 377 aa  90.1  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  29.61 
 
 		 326 aa  90.1  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.32 
 
 		 540 aa  90.1  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.85 
 
 		 520 aa  89.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.32 
 
 		 560 aa  89  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.21 
 
 		 584 aa  89  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.32 
 
 		 406 aa  89  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.93 
 
 		 419 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1714  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.3 
 
 		 528 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603952 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  26.45 
 
 		 307 aa  88.2  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.1 
 
 		 466 aa  88.6  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.72 
 
 		 394 aa  88.2  3e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.2 
 
 		 407 aa  87.4  5e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3034  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.34 
 
 		 379 aa  87.4  7e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.63975 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.43 
 
 		 389 aa  86.3  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0588  putative transcriptional regulator  24.6 
 
 		 432 aa  84  0.000000000000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.952975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  25.43 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3226  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.55 
 
 		 370 aa  82.4  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.501586 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1808  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.02 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.15 
 
 		 480 aa  82.8  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4511  transcription attenuator LytR  28.28 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.57 
 
 		 465 aa  80.1  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>