More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1198 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 
585 aa  1185    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1996  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.92 
 
 
527 aa  256  8e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1714  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.24 
 
 
528 aa  233  7.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.603952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1700  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.1 
 
 
463 aa  233  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0287  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.25 
 
 
412 aa  187  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3186  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.36 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.689692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0249  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.1 
 
 
461 aa  177  5e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176246  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.77 
 
 
356 aa  166  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.51 
 
 
353 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4519  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.44 
 
 
505 aa  157  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0015  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.2 
 
 
503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348648  hitchhiker  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1876  cell envelope-related transcriptional attenuator  36 
 
 
455 aa  148  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000275813  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3226  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.04 
 
 
370 aa  146  9e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.501586 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0570  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.01 
 
 
377 aa  140  4.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  34.17 
 
 
377 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  34.17 
 
 
377 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3112  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.22 
 
 
419 aa  123  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.78 
 
 
383 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.5 
 
 
374 aa  121  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  34.17 
 
 
375 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
375 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
375 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  34.17 
 
 
375 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  34.17 
 
 
375 aa  120  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4851  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.48 
 
 
432 aa  120  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.73 
 
 
426 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.27 
 
 
563 aa  119  1.9999999999999998e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  32.92 
 
 
374 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  33.19 
 
 
372 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.95 
 
 
310 aa  114  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.74 
 
 
389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  28.77 
 
 
481 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1973  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.5 
 
 
418 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.554316  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  30.07 
 
 
313 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26120  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.95 
 
 
497 aa  111  4.0000000000000004e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.68 
 
 
506 aa  111  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.04 
 
 
405 aa  111  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.92 
 
 
443 aa  111  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0400  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.6 
 
 
308 aa  110  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000257107  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.06 
 
 
411 aa  110  6e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13519  hypothetical protein  27 
 
 
512 aa  109  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.100718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.38 
 
 
468 aa  108  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.21 
 
 
509 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.01 
 
 
362 aa  108  3e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  31 
 
 
374 aa  108  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0632  psr protein  30.61 
 
 
457 aa  108  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.513825  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4120  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.88 
 
 
445 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000955467  unclonable  0.000000000378568 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0489  transcription regulator  30.1 
 
 
450 aa  108  4e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3081  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.11 
 
 
531 aa  107  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.3 
 
 
335 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.03 
 
 
304 aa  107  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.69 
 
 
379 aa  107  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  27 
 
 
495 aa  107  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.27 
 
 
337 aa  106  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  31.82 
 
 
337 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8771  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.93 
 
 
547 aa  106  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  30 
 
 
390 aa  106  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0932  transcriptional regulator, putative  33.03 
 
 
329 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.9 
 
 
338 aa  105  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  30.77 
 
 
316 aa  105  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.62 
 
 
468 aa  104  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.69 
 
 
618 aa  104  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.62 
 
 
434 aa  104  4e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1851  transcriptional regulator  31.97 
 
 
392 aa  104  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  30.53 
 
 
338 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.44 
 
 
436 aa  103  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.73 
 
 
414 aa  103  6e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  30.53 
 
 
338 aa  103  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2378  cell envelope-related function transcriptional attenuator  28.12 
 
 
437 aa  103  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0983623  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  27.63 
 
 
505 aa  103  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  37.93 
 
 
490 aa  103  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.78 
 
 
521 aa  103  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.23 
 
 
414 aa  103  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1433  cell envelope-related transcriptional attenuator  31 
 
 
332 aa  102  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
337 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.68 
 
 
304 aa  102  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  30.69 
 
 
337 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.7 
 
 
567 aa  102  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.14 
 
 
319 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  31.44 
 
 
338 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.53 
 
 
333 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3629  transcription attenuator LytR  33.5 
 
 
378 aa  102  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.142384  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.57 
 
 
453 aa  101  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  30.69 
 
 
337 aa  102  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  30.69 
 
 
338 aa  102  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3295  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  26.28 
 
 
345 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.189328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  30.69 
 
 
333 aa  101  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  27.9 
 
 
365 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5387  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.51 
 
 
299 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1295  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.03 
 
 
407 aa  101  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.865299 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4011  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.07 
 
 
380 aa  101  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1057  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.19 
 
 
333 aa  101  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0371332  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  31.53 
 
 
333 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
333 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  31.53 
 
 
333 aa  100  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0638  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.93 
 
 
294 aa  100  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  31.53 
 
 
333 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6384  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.48 
 
 
352 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
335 aa  100  6e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4511  transcription attenuator LytR  33.04 
 
 
358 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>