More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13519 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13519  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1038    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100718 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1296  cell envelope-related transcriptional attenuator  61.45 
 
 		 414 aa  420  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  38.93 
 
 		 522 aa  309  8e-83  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8771  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.52 
 
 		 547 aa  290  6e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.02 
 
 		 732 aa  287  2e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7119  cell envelope-related transcriptional attenuator  50.45 
 
 		 382 aa  282  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1912  cell envelope-related transcriptional attenuator  41.94 
 
 		 664 aa  259  6e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.91 
 
 		 567 aa  251  2e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.76 
 
 		 538 aa  247  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1318  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.55 
 
 		 490 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1335  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.55 
 
 		 490 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962054  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1354  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.55 
 
 		 490 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0429862  normal  0.395159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1299  cell envelope-related transcriptional attenuator  46.65 
 
 		 340 aa  243  6e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.18 
 
 		 410 aa  243  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.64 
 
 		 496 aa  241  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13296  CPSA-related protein  37.81 
 
 		 497 aa  239  9e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.47 
 
 		 517 aa  239  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.2 
 
 		 493 aa  233  8.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06070  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  42.41 
 
 		 514 aa  223  6e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.974325  normal  0.0563121 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.37 
 
 		 493 aa  223  7e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1852  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  37.95 
 
 		 676 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.84 
 
 		 521 aa  189  7e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 491 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.85 
 
 		 520 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.6 
 
 		 497 aa  134  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.47 
 
 		 625 aa  132  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.79 
 
 		 512 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.94 
 
 		 504 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.14 
 
 		 573 aa  128  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.58 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.64 
 
 		 509 aa  126  8.000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.29 
 
 		 486 aa  126  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.48 
 
 		 516 aa  123  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  29 
 
 		 481 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.46 
 
 		 506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.43 
 
 		 549 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.6 
 
 		 521 aa  120  4.9999999999999996e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.19 
 
 		 468 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.8 
 
 		 526 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  28.28 
 
 		 505 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.85 
 
 		 540 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.15 
 
 		 520 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.22 
 
 		 468 aa  117  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.6 
 
 		 481 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3559  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.29 
 
 		 352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.56 
 
 		 618 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.24 
 
 		 393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.17 
 
 		 487 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.33 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  26.22 
 
 		 530 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  29.9 
 
 		 684 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.32 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.29 
 
 		 551 aa  105  2e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.81 
 
 		 545 aa  104  3e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.3 
 
 		 377 aa  104  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.77 
 
 		 480 aa  104  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.77 
 
 		 478 aa  103  9e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.59 
 
 		 560 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.81 
 
 		 584 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  32.19 
 
 		 395 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.33 
 
 		 414 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.76 
 
 		 585 aa  101  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  32.74 
 
 		 307 aa  99.8  9e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.81 
 
 		 406 aa  99.8  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.84 
 
 		 320 aa  99  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.01 
 
 		 409 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.01 
 
 		 311 aa  97.8  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5903  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.78 
 
 		 508 aa  97.1  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.667474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.67 
 
 		 466 aa  97.4  6e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0287  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.92 
 
 		 412 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.33 
 
 		 649 aa  97.4  6e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.55 
 
 		 404 aa  96.7  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  26.85 
 
 		 395 aa  96.3  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3214  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.26 
 
 		 443 aa  96.3  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235319 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.75 
 
 		 379 aa  95.9  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.66 
 
 		 311 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.66 
 
 		 311 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.89 
 
 		 336 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0249  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.27 
 
 		 461 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176246  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.18 
 
 		 643 aa  94.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3959  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.12 
 
 		 463 aa  94.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.97 
 
 		 499 aa  94.4  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.07 
 
 		 699 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.07 
 
 		 699 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.07 
 
 		 701 aa  94  6e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.14 
 
 		 362 aa  93.6  8e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  26.52 
 
 		 420 aa  93.2  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0589  putative transcriptional regulator  24.85 
 
 		 498 aa  93.2  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.581304 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  29.43 
 
 		 373 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  27.66 
 
 		 365 aa  93.2  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1996  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.75 
 
 		 527 aa  92  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  29.14 
 
 		 417 aa  91.3  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.2 
 
 		 381 aa  90.5  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.21 
 
 		 407 aa  90.1  8e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.48 
 
 		 411 aa  89.7  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.52 
 
 		 307 aa  89  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0588  putative transcriptional regulator  23.32 
 
 		 432 aa  88.6  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.952975 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.44 
 
 		 434 aa  89.4  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.2 
 
 		 442 aa  88.6  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.53 
 
 		 389 aa  88.2  3e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>