More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0728 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 618 aa  1253    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  52.82 
 
 		 530 aa  509  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  47.89 
 
 		 468 aa  355  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.4 
 
 		 478 aa  335  1e-90  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.34 
 
 		 468 aa  325  1e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  45.3 
 
 		 481 aa  318  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.72 
 
 		 481 aa  317  5e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.71 
 
 		 506 aa  290  5.0000000000000004e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.85 
 
 		 480 aa  277  3e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.11 
 
 		 453 aa  254  3e-66  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.65 
 
 		 584 aa  242  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  47.43 
 
 		 379 aa  241  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.82 
 
 		 520 aa  235  2.0000000000000002e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.11 
 
 		 465 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.9 
 
 		 509 aa  217  4e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 521 aa  218  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.99 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  40.07 
 
 		 395 aa  207  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.87 
 
 		 497 aa  204  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.31 
 
 		 487 aa  201  3.9999999999999996e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.82 
 
 		 540 aa  200  6e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.14 
 
 		 549 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  35.53 
 
 		 395 aa  194  4e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.71 
 
 		 491 aa  194  5e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  33.26 
 
 		 505 aa  192  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.58 
 
 		 406 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.77 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.393457 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.87 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  33.52 
 
 		 417 aa  180  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.85 
 
 		 516 aa  177  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.5 
 
 		 365 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.59 
 
 		 625 aa  174  2.9999999999999996e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.27 
 
 		 389 aa  173  9e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.9 
 
 		 643 aa  173  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.14 
 
 		 442 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.77 
 
 		 551 aa  170  6e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  29.17 
 
 		 734 aa  170  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.86 
 
 		 1336 aa  170  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1864  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.85 
 
 		 391 aa  170  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.036217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.18 
 
 		 619 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.39 
 
 		 573 aa  169  1e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.24 
 
 		 512 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.34 
 
 		 504 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.32 
 
 		 390 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.47 
 
 		 486 aa  165  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.07 
 
 		 522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.52 
 
 		 567 aa  163  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  28.87 
 
 		 684 aa  160  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  34.32 
 
 		 373 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0589  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 		 498 aa  159  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.581304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.57 
 
 		 701 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.48 
 
 		 699 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.48 
 
 		 699 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.91 
 
 		 520 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.62 
 
 		 336 aa  156  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.62 
 
 		 521 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.48 
 
 		 649 aa  153  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.17 
 
 		 687 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.13 
 
 		 545 aa  148  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.47 
 
 		 393 aa  147  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.35 
 
 		 732 aa  147  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.27 
 
 		 320 aa  146  8.000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1025  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.86 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11457  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3214  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.5 
 
 		 443 aa  143  8e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  34.52 
 
 		 326 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1318  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.21 
 
 		 490 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1335  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.21 
 
 		 490 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962054  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1354  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.21 
 
 		 490 aa  141  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0429862  normal  0.395159 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.22 
 
 		 307 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5903  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.55 
 
 		 508 aa  139  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.667474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.29 
 
 		 493 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.93 
 
 		 409 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.3 
 
 		 517 aa  136  9e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1808  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.98 
 
 		 424 aa  136  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.84 
 
 		 526 aa  135  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.21 
 
 		 404 aa  135  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.49 
 
 		 493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 466 aa  134  5e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.87 
 
 		 311 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.87 
 
 		 311 aa  134  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.87 
 
 		 311 aa  134  6e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.33 
 
 		 407 aa  133  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1296  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.04 
 
 		 414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.75 
 
 		 394 aa  132  2.0000000000000002e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.49 
 
 		 414 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.07 
 
 		 306 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.91 
 
 		 434 aa  130  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13296  CPSA-related protein  27.87 
 
 		 497 aa  130  6e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.23 
 
 		 410 aa  130  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.25 
 
 		 381 aa  130  8.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.62 
 
 		 434 aa  130  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.58 
 
 		 405 aa  129  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.33 
 
 		 538 aa  128  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  32.45 
 
 		 420 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1395  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.34 
 
 		 404 aa  127  6e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330473  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.78 
 
 		 495 aa  127  7e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  31.02 
 
 		 296 aa  127  8.000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4529  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.78 
 
 		 365 aa  126  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.21 
 
 		 496 aa  125  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0762  transcriptional regulator  32.21 
 
 		 489 aa  125  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>