More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1852 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1852  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  100 
 
 		 676 aa  1332    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1318  cell envelope-related transcriptional attenuator  53.26 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.940107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1335  cell envelope-related transcriptional attenuator  53.26 
 
 		 490 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.962054  normal  0.634397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1354  cell envelope-related transcriptional attenuator  53.05 
 
 		 490 aa  445  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0429862  normal  0.395159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1726  cell envelope-related transcriptional attenuator  49.3 
 
 		 493 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4737  cell envelope-related transcriptional attenuator  50.91 
 
 		 493 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.440107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1061  cell envelope-related transcriptional attenuator  49.11 
 
 		 567 aa  436  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13296  CPSA-related protein  51.22 
 
 		 497 aa  431  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000747689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28900  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  42.2 
 
 		 522 aa  343  5e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.385343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1037  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.94 
 
 		 732 aa  338  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6349  cell envelope-related transcriptional attenuator  53.09 
 
 		 410 aa  303  6.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06070  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  48.73 
 
 		 514 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.974325  normal  0.0563121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6348  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.49 
 
 		 517 aa  281  3e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352796  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  41.08 
 
 		 538 aa  279  1e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4212  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.85 
 
 		 496 aa  246  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.134321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.4 
 
 		 521 aa  243  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8771  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.11 
 
 		 547 aa  220  6e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13519  hypothetical protein  38.1 
 
 		 512 aa  218  2e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100718 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1296  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.6 
 
 		 414 aa  216  8e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1912  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.04 
 
 		 664 aa  204  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7119  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.77 
 
 		 382 aa  195  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.18 
 
 		 509 aa  178  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.2 
 
 		 491 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.74 
 
 		 497 aa  171  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.72 
 
 		 573 aa  171  5e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  35.44 
 
 		 505 aa  170  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.36 
 
 		 390 aa  168  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.82 
 
 		 512 aa  166  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.55 
 
 		 625 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.71 
 
 		 486 aa  158  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1299  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.33 
 
 		 340 aa  157  5.0000000000000005e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.56 
 
 		 549 aa  156  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.45 
 
 		 504 aa  153  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.25 
 
 		 466 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  31.59 
 
 		 481 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.67 
 
 		 545 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2567  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.73 
 
 		 404 aa  144  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.27 
 
 		 468 aa  144  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08470  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.75 
 
 		 394 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.282031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1591  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.4 
 
 		 336 aa  141  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.230007  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.11 
 
 		 481 aa  140  8.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  36.89 
 
 		 307 aa  140  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  31.53 
 
 		 734 aa  139  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.74 
 
 		 414 aa  139  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3959  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.64 
 
 		 463 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.64 
 
 		 311 aa  138  4e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09620  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  36.96 
 
 		 353 aa  138  4e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.369888 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.64 
 
 		 311 aa  138  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.3 
 
 		 468 aa  137  5e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  33.77 
 
 		 420 aa  137  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.81 
 
 		 520 aa  136  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.29 
 
 		 311 aa  136  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.11 
 
 		 307 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.23 
 
 		 362 aa  134  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  31 
 
 		 393 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.58 
 
 		 560 aa  134  7.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.01 
 
 		 487 aa  134  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.14 
 
 		 434 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.26 
 
 		 306 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.92 
 
 		 409 aa  133  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.62 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  30 
 
 		 516 aa  132  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0046  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.24 
 
 		 320 aa  130  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.57 
 
 		 382 aa  130  8.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  30.09 
 
 		 530 aa  129  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.72 
 
 		 521 aa  128  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.22 
 
 		 1336 aa  127  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0120  Transcriptional regulator-like protein  34.43 
 
 		 326 aa  126  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.224299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3901  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.89 
 
 		 407 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0120062 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.26 
 
 		 618 aa  126  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.3 
 
 		 499 aa  125  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.72 
 
 		 506 aa  125  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.07 
 
 		 478 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1808  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.93 
 
 		 424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292903  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  30.65 
 
 		 349 aa  122  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.61 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  28.57 
 
 		 684 aa  121  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.03 
 
 		 619 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.32 
 
 		 540 aa  119  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1395  cell envelope-related transcriptional attenuator  35 
 
 		 404 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.330473  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.98 
 
 		 406 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3559  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.16 
 
 		 352 aa  117  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153801  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.93 
 
 		 374 aa  115  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0711  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.55 
 
 		 526 aa  115  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.52 
 
 		 400 aa  114  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.51 
 
 		 453 aa  114  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.25 
 
 		 584 aa  114  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.56 
 
 		 434 aa  113  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.94 
 
 		 381 aa  112  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2384  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.05 
 
 		 303 aa  112  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174416  hitchhiker  0.00797054 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  30.79 
 
 		 417 aa  110  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.88 
 
 		 643 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1165  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  34.5 
 
 		 363 aa  110  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3228  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.51 
 
 		 377 aa  109  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0471557  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.69 
 
 		 687 aa  108  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  24.85 
 
 		 649 aa  108  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0588  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 		 432 aa  107  9e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.952975 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5903  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.77 
 
 		 508 aa  107  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.667474 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0762  transcriptional regulator  27.22 
 
 		 489 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.245721  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  29.91 
 
 		 395 aa  105  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>