More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4529 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4529  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 365 aa  722    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.25457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4976  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.32 
 
 		 551 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37600  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  35.58 
 
 		 619 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.760055  normal  0.249296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3920  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  33.06 
 
 		 734 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10837  hypothetical protein  35.53 
 
 		 684 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000372154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1666  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.04 
 
 		 649 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6814  cell envelope-related transcriptional attenuator  39.18 
 
 		 1336 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4513  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.01 
 
 		 699 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4600  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.01 
 
 		 699 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5087  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.88 
 
 		 687 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4896  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.01 
 
 		 701 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0784  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.43 
 
 		 400 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0411  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.84 
 
 		 520 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.118906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1167  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  36.14 
 
 		 417 aa  155  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1166  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  34.17 
 
 		 395 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0030  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.11 
 
 		 506 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2956  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.78 
 
 		 453 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.482149  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4745  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.22 
 
 		 584 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.22 
 
 		 468 aa  145  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  34.52 
 
 		 481 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.97 
 
 		 509 aa  142  9e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7619  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.07 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2526  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.71 
 
 		 478 aa  136  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0412  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.67 
 
 		 491 aa  136  6.0000000000000005e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.245301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0934  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.7 
 
 		 480 aa  136  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0202033 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  35 
 
 		 442 aa  135  8e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3844  cell envelope-related protein transcriptional attenuator  33.11 
 
 		 373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4096  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.03 
 
 		 468 aa  132  6.999999999999999e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4114  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.55 
 
 		 549 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3302  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.45 
 
 		 406 aa  130  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0160587  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30000  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  32.04 
 
 		 395 aa  129  6e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0126  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.04 
 
 		 499 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5020  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.78 
 
 		 414 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.417569  hitchhiker  0.000783217 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.78 
 
 		 618 aa  126  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08570  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  33.78 
 
 		 365 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.671315  normal  0.595892 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0624  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.79 
 
 		 481 aa  126  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.6 
 
 		 497 aa  125  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1965  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.97 
 
 		 487 aa  125  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000312518 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4510  transcription attenuator LytR  31.06 
 
 		 420 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  34.17 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.783991  normal  0.393457 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.84 
 
 		 389 aa  124  3e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1348  Transcriptional regulator-like protein  31.55 
 
 		 505 aa  123  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.958942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0935  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.25 
 
 		 465 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0761113 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4461  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.4 
 
 		 390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7618  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.13 
 
 		 643 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.71 
 
 		 504 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2228  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.5 
 
 		 521 aa  119  7e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000756142  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1307  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.84 
 
 		 520 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.386656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  31.15 
 
 		 530 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.66 
 
 		 319 aa  116  5e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1248  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.77 
 
 		 512 aa  116  5e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.375848  normal  0.0192244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7541  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.32 
 
 		 540 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.371514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2100  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.91 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0589  putative transcriptional regulator  31.58 
 
 		 498 aa  114  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.581304 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09330  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  31.11 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1864  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.44 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.383316  normal  0.036217 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1558  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.06 
 
 		 545 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.931439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6827  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.61 
 
 		 516 aa  111  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.66 
 
 		 573 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3496  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.1 
 
 		 486 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.625789  normal  0.409021 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1145  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.74 
 
 		 543 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6386  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.18 
 
 		 382 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3214  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.11 
 
 		 443 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235319 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2257  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.65 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5205  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.06 
 
 		 560 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0714783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.08 
 
 		 374 aa  106  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1025  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.58 
 
 		 434 aa  106  6e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.11457  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03580  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  30.15 
 
 		 448 aa  106  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.742286  normal  0.880699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1399  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.71 
 
 		 414 aa  104  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3629  transcription attenuator LytR  31.1 
 
 		 378 aa  103  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.142384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5038  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.92 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5126  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.92 
 
 		 311 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.94 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.43 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5418  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.98 
 
 		 311 aa  103  6e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.710746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4011  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.48 
 
 		 380 aa  103  7e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.66 
 
 		 307 aa  102  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5665  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.06 
 
 		 306 aa  102  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.304907  normal  0.0393509 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1142  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.32 
 
 		 409 aa  101  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.671395  normal  0.110733 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1865  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.97 
 
 		 434 aa  100  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0368682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5903  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.46 
 
 		 508 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.667474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0172  cell envelope-related function transcriptional attenuator, LytR/CpsA family  31.65 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  35.53 
 
 		 372 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.57 
 
 		 563 aa  99.4  8e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1499  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.25 
 
 		 329 aa  99.4  9e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000186761  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.11 
 
 		 625 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06080  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  28.84 
 
 		 538 aa  98.6  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.832186  normal  0.188153 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  33.49 
 
 		 377 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08920  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.55 
 
 		 381 aa  97.8  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.667016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0136  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.62 
 
 		 466 aa  98.2  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  33.02 
 
 		 377 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  35.03 
 
 		 375 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  35.03 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  35.03 
 
 		 374 aa  97.4  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  35.03 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.73 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20880  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain  32.65 
 
 		 296 aa  97.4  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  29.59 
 
 		 333 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>