More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1700 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1700  cell envelope-related transcriptional attenuator  100 
 
 		 463 aa  917    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1996  cell envelope-related transcriptional attenuator  51.55 
 
 		 527 aa  357  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1714  cell envelope-related transcriptional attenuator  51.79 
 
 		 528 aa  322  9.000000000000001e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.603952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0287  cell envelope-related transcriptional attenuator  43.7 
 
 		 412 aa  265  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3186  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.85 
 
 		 451 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.689692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1198  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.01 
 
 		 585 aa  246  8e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0249  cell envelope-related transcriptional attenuator  42.51 
 
 		 461 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176246  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4519  cell envelope-related transcriptional attenuator  44.19 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0187  cell envelope-related transcriptional attenuator  27.18 
 
 		 563 aa  154  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.234515 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1876  cell envelope-related transcriptional attenuator  36 
 
 		 455 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000275813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0015  cell envelope-related transcriptional attenuator  40.85 
 
 		 503 aa  146  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0348648  hitchhiker  0.0000779954 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0570  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.89 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3226  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.9 
 
 		 370 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.501586 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4851  cell envelope-related transcriptional attenuator  35.74 
 
 		 432 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0369  cell envelope-related transcriptional attenuator  37.44 
 
 		 356 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.117824  normal  0.3088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0131  cell envelope-related transcriptional attenuator  36.53 
 
 		 353 aa  134  5e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.763008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13390  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.17 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.557039  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5047  LytR family transcription antiterminator  32.55 
 
 		 375 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4877  LytR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 375 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4892  LytR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 375 aa  131  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5432  LytR family transcription antiterminator  32.55 
 
 		 375 aa  131  3e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5288  transcription antiterminator, LytR family  32.55 
 
 		 375 aa  131  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000327862 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5364  transcription antiterminator, LytR family  32.55 
 
 		 377 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5319  transcription antiterminator, LytR family  32.55 
 
 		 374 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4992  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.53 
 
 		 374 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5306  LytR family transcription antiterminator  32.16 
 
 		 377 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5640  transcription antiterminator, LytR family  32.55 
 
 		 372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000247251 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3735  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.2 
 
 		 383 aa  123  6e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2366  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.03 
 
 		 319 aa  121  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000181907  unclonable  0.00000001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0728  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.3 
 
 		 618 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0188197 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4335  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.15 
 
 		 521 aa  119  7.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0591559  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01960  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  27.25 
 
 		 490 aa  117  3.9999999999999997e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00481524  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1893  transcriptional regulator, putative  29.71 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3385  membrane-bound transcriptional regulator LytR  28.09 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0893  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.44 
 
 		 453 aa  112  9e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.301121  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0732  transcription antiterminator, LytR family  31.49 
 
 		 338 aa  113  9e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0572  LytR family transcription antiterminator  31.91 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0643  transcription antiterminator, LytR family  33.33 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.849345  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0661  transcription antiterminator, LytR family  31.91 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34714e-25 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4695  transcription antiterminator, LytR family  33.33 
 
 		 338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.541641  hitchhiker  0.0000000308245 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0516  LytR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0605  LytR family transcription antiterminator  31.91 
 
 		 333 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0523  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.27 
 
 		 337 aa  111  3e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3877  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.6 
 
 		 497 aa  111  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0519  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.34 
 
 		 338 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0673  LytR family transcription antiterminator  31.06 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2383  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.86 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0868762  hitchhiker  0.00772059 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5566  membrane-bound transcriptional regulator LytR  33.03 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0516  LytR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 337 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3243  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.13 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3272  membrane-bound transcriptional regulator LytR  31.08 
 
 		 310 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000512755  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3000  cell envelope-related transcriptional attenuator  23.69 
 
 		 495 aa  110  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1360  cell envelope-related transcriptional attenuator  34.35 
 
 		 436 aa  109  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4947  membrane-bound transcriptional regulator LytR  32.11 
 
 		 304 aa  108  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0889022  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9260  Transcriptional regulator-like protein  28.15 
 
 		 481 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1352  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.57 
 
 		 488 aa  107  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00278352  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08290  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  27.51 
 
 		 443 aa  108  3e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.154905  normal  0.235154 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08810  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.45 
 
 		 374 aa  107  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.155806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5902  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.81 
 
 		 625 aa  107  5e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1363  Transcriptional regulator-like protein  26.29 
 
 		 530 aa  107  6e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.640186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3046  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.39 
 
 		 322 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.634845  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0803  cell envelope-related transcriptional attenuator  25.8 
 
 		 317 aa  106  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01650  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  29.73 
 
 		 512 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.475151  hitchhiker  0.0000000000510123 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2008  transcription antiterminator, LytR family  28.93 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.0610299999999994e-43 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01950  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  31.21 
 
 		 516 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000132864  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1830  LytR family transcription antiterminator  28.93 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.241912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1804  LytR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00220424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1787  LytR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 335 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1973  LytR family transcription antiterminator  28.93 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3514  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.06 
 
 		 468 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4100  cell envelope-related transcriptional attenuator  32.08 
 
 		 426 aa  104  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000199964  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3347  transcriptional regulator LytR, attenuator for lytABC and lytR expression  30.1 
 
 		 345 aa  104  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000255205  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2056  LytR family transcription antiterminator  28.93 
 
 		 333 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00905786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3352  transcription antiterminator, LytR family  28.62 
 
 		 335 aa  103  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000199263  hitchhiker  0.0000000000000086496 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2594  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.15 
 
 		 442 aa  103  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3613  transcription antiterminator, LytR family  28.48 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000276906  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3605  LytR family transcription antiterminator  27.24 
 
 		 345 aa  103  7e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0149783  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3698  transcription antiterminator, LytR family  27.6 
 
 		 345 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00180581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1975  transcription antiterminator, LytR family  28.52 
 
 		 333 aa  103  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.258453  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1838  cell envelope-related transcriptional attenuator  30.74 
 
 		 333 aa  103  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00343174  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0838  transcription antiterminator, LytR family  30.45 
 
 		 399 aa  103  8e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00382216  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0746  LytR family transcription antiterminator  32.58 
 
 		 398 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0694  LytR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 398 aa  103  9e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0354301  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0783  LytR family transcription antiterminator  32.58 
 
 		 398 aa  103  9e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0878  transcription antiterminator, LytR family  32.58 
 
 		 398 aa  103  9e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78734e-21 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2542  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.62 
 
 		 509 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1540  cell envelope-related transcriptional attenuator  38.03 
 
 		 328 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.112437  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1619  transcription antiterminator, LytR family  27.24 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00116574  hitchhiker  0.0000348163 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0946  transcription antiterminator, LytR family  27.55 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000012569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2095  cell envelope-related transcriptional attenuator  31.76 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4498  transcription antiterminator, LytR family  30 
 
 		 399 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000182536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0717  cell envelope-related transcriptional attenuator  26.08 
 
 		 504 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0100935 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2078  transcription antiterminator, LytR family  28.57 
 
 		 333 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000542577  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0712  cell envelope-related transcriptional attenuator  29.38 
 
 		 573 aa  101  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0174  transcriptional regulator  28.22 
 
 		 374 aa  102  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0565386  hitchhiker  0.0000000000000158467 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2334  cell envelope-related transcriptional attenuator  28.29 
 
 		 318 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.591324  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2377  transcription attenuator LytR  28.29 
 
 		 318 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16350  cell envelope-related transcriptional attenuator  33.8 
 
 		 307 aa  102  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0716913  normal  0.935262 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0680  LytR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08560  cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain protein  32.48 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.511519  normal  0.633257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>