More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24920 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_24920  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  100 
 
 
460 aa  964    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.852439  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0320  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  41.18 
 
 
469 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1944  aminomethyltransferase, putative  35.78 
 
 
425 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000857452 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6553  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.68 
 
 
467 aa  201  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0277028  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33030  aminomethyltransferase  31.88 
 
 
450 aa  199  6e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0192  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  31.4 
 
 
462 aa  196  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000184996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0209  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.16 
 
 
450 aa  196  1e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000425405  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1565  aminomethyltransferase  30.77 
 
 
457 aa  192  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.287343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11650  aminomethyltransferase  29.72 
 
 
466 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2404  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.77 
 
 
462 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2861  aminomethyltransferase  30.3 
 
 
466 aa  180  5.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5560  glycine cleavage system T protein aminomethyltransferase  27.78 
 
 
472 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1847  aminomethyltransferase, putative  44.09 
 
 
131 aa  99.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000160694  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.87 
 
 
400 aa  98.2  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  27.17 
 
 
1002 aa  97.1  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.36 
 
 
366 aa  97.1  7e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3618  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  32.45 
 
 
767 aa  95.9  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.21581  normal  0.0424125 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2881  sarcosine oxidase, alpha subunit family  32.09 
 
 
955 aa  96.3  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3316  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.19 
 
 
789 aa  96.3  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.84 
 
 
366 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.62 
 
 
761 aa  94.4  4e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  26.45 
 
 
1002 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  26.45 
 
 
889 aa  94  5e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  26.45 
 
 
1002 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  26.45 
 
 
1002 aa  94  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.6 
 
 
366 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.6 
 
 
366 aa  93.6  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.6 
 
 
366 aa  93.6  6e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.6 
 
 
366 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.83 
 
 
789 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.6 
 
 
366 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.6 
 
 
366 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.6 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  26.72 
 
 
1003 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.6 
 
 
366 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.27 
 
 
789 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.81 
 
 
1003 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  27.31 
 
 
1003 aa  92.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  31.35 
 
 
993 aa  91.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1349  aminomethyltransferase  22.73 
 
 
961 aa  91.7  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0486795  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.54 
 
 
1003 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.54 
 
 
1003 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.54 
 
 
1003 aa  91.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  30.81 
 
 
993 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.3 
 
 
1003 aa  90.9  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18830  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  31.41 
 
 
925 aa  90.5  6e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  31.35 
 
 
993 aa  90.5  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  25.82 
 
 
1000 aa  90.1  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  25.72 
 
 
1000 aa  90.1  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2480  sarcosine oxidase, alpha subunit  29.73 
 
 
1007 aa  89.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4034  sarcosine oxidase, alpha subunit  29.73 
 
 
1007 aa  89.7  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  30.11 
 
 
999 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  30.11 
 
 
1028 aa  88.6  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2496  aminomethyltransferase  30.66 
 
 
977 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0949  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.34 
 
 
433 aa  88.2  3e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6206  sarcosine oxidase subunit alpha  29.19 
 
 
1005 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71500  sarcosine oxidase alpha subunit  29.19 
 
 
1005 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4882  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.26 
 
 
1005 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.815421  normal  0.441482 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1103  sarcosine oxidase subunit alpha  29.57 
 
 
1003 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0428535 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0458  sarcosine oxidase, alpha subunit  29.19 
 
 
1006 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4129  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.41 
 
 
1005 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  26.34 
 
 
1003 aa  87.4  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4715  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  29.19 
 
 
1006 aa  87  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764897  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0325  sarcosine oxidase, alpha subunit family  29.73 
 
 
1004 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.0259905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0348  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.73 
 
 
1004 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.223565  normal  0.24512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.73 
 
 
1004 aa  87  7e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584295  normal  0.398352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5205  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  28.65 
 
 
1005 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0352677 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.6 
 
 
364 aa  86.7  9e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.11 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2879  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.04 
 
 
821 aa  84.7  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  27.31 
 
 
350 aa  84  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.8 
 
 
380 aa  83.6  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113377  normal  0.236681 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3593  sarcosine oxidase, alpha subunit family  29.69 
 
 
980 aa  83.6  0.000000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1696  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.97 
 
 
963 aa  83.2  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3391  sarcosine oxidase, alpha subunit family  29.57 
 
 
995 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.782992  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2758  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  27.81 
 
 
1010 aa  82.8  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  26.54 
 
 
357 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0439  aminomethyltransferase  25 
 
 
372 aa  82  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.525568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18850  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  25 
 
 
819 aa  81.6  0.00000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.303857  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3702  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.17 
 
 
984 aa  81.3  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2450  sarcosine oxidase, alpha subunit  25.25 
 
 
968 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0353624  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3474  aminomethyltransferase  24.24 
 
 
965 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2102  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.96 
 
 
967 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3858  sarcosine oxidase alpha subunit  30.53 
 
 
937 aa  80.5  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0454194  normal  0.0206575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2222  aminomethyltransferase  24.07 
 
 
968 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.282485  normal  0.38236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1947  sarcosine oxidase, alpha subunit  29.41 
 
 
992 aa  80.9  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.861688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1843  hypothetical protein  52.31 
 
 
74 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2485  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  29.57 
 
 
995 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269886  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0971  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  27.89 
 
 
1011 aa  80.1  0.00000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19710  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  24.01 
 
 
425 aa  80.1  0.00000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.207697  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0764  aminomethyltransferase  24.44 
 
 
401 aa  79.3  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.214671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0943  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.33 
 
 
974 aa  79.7  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.535106  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  27.81 
 
 
1009 aa  79  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1000  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  27.57 
 
 
1019 aa  79  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.99192  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1934  sarcosine oxidase, alpha subunit family  25.33 
 
 
1008 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.857913  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1202  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  21.86 
 
 
752 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  28.49 
 
 
1003 aa  77.8  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  20.85 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.08 
 
 
830 aa  77.4  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7231  sarcosine oxidase, alpha subunit family  24.76 
 
 
985 aa  77  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118066  normal  0.098262 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>