271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1565 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0192  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  74.17 
 
 		 462 aa  685    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000184996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0209  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  73.23 
 
 		 450 aa  674    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000425405  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1565  aminomethyltransferase  100 
 
 		 457 aa  939    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.287343  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6553  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  60.74 
 
 		 467 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0277028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33030  aminomethyltransferase  58.24 
 
 		 450 aa  533  1e-150  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2861  aminomethyltransferase  54.03 
 
 		 466 aa  498  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2404  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  53.08 
 
 		 462 aa  496  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11650  aminomethyltransferase  50.76 
 
 		 466 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5560  glycine cleavage system T protein aminomethyltransferase  47.97 
 
 		 472 aa  426  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1944  aminomethyltransferase, putative  36.92 
 
 		 425 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000857452 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24920  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  30.77 
 
 		 460 aa  192  1e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.852439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0320  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  29.72 
 
 		 469 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.9 
 
 		 368 aa  100  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.39 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  26.48 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.2 
 
 		 363 aa  90.9  4e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0469  glycine cleavage system T protein  26.6 
 
 		 371 aa  89.7  1e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.81 
 
 		 370 aa  87.4  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  28.03 
 
 		 369 aa  87  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  28.34 
 
 		 372 aa  87  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  22.85 
 
 		 365 aa  85.9  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  24.65 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  24.65 
 
 		 442 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  23.91 
 
 		 366 aa  82  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  24.76 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  22.7 
 
 		 360 aa  79.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  22.15 
 
 		 374 aa  79.7  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  25 
 
 		 371 aa  79.7  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  24.67 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.48 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.16 
 
 		 364 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.17 
 
 		 364 aa  77  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.17 
 
 		 364 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  26.71 
 
 		 367 aa  76.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  24.55 
 
 		 357 aa  75.5  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.1 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.1 
 
 		 363 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0764  aminomethyltransferase  23.86 
 
 		 401 aa  74.7  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.214671  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  25.79 
 
 		 854 aa  74.7  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.1 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  25.62 
 
 		 379 aa  73.6  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  25.16 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22 
 
 		 360 aa  73.2  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  24.04 
 
 		 819 aa  73.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1892  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.82 
 
 		 363 aa  72  0.00000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  26.89 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3155  glycine cleavage system T protein  23.79 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.75 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16310  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.9 
 
 		 372 aa  69.3  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0622613  normal  0.221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.57 
 
 		 360 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  23.28 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  24.76 
 
 		 375 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.28 
 
 		 365 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  22.86 
 
 		 366 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  23.1 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0395  glycine cleavage system T protein  23.27 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.54 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  23.43 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  23.16 
 
 		 389 aa  68.2  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  22.03 
 
 		 364 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  21.37 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0389  glycine cleavage system T protein  23.02 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.65951 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  23.03 
 
 		 857 aa  67  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  23.33 
 
 		 381 aa  67  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25 
 
 		 380 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2675  glycine cleavage system T protein  24.44 
 
 		 366 aa  66.6  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.84 
 
 		 366 aa  66.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0341  glycine cleavage system T protein  22.09 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0253  glycine cleavage system T protein  25.48 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.94 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.52 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0339  glycine cleavage system T protein  23.57 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19710  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  22.53 
 
 		 425 aa  65.5  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.207697  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1481  FAD dependent oxidoreductase  20.32 
 
 		 801 aa  65.5  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.48 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  22.28 
 
 		 365 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.15 
 
 		 375 aa  65.1  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0971  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.13 
 
 		 1011 aa  65.1  0.000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1240  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.88 
 
 		 390 aa  64.3  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.199307 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3071  glycine cleavage system T protein  25.97 
 
 		 372 aa  64.3  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483432  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.19 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.19 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  25.96 
 
 		 993 aa  63.9  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.19 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.19 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1912  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  21.14 
 
 		 441 aa  63.9  0.000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000389017  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  23.46 
 
 		 806 aa  63.5  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2455  glycine cleavage system T protein  22.31 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.84 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  21.97 
 
 		 360 aa  63.2  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  25.24 
 
 		 815 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  25.48 
 
 		 993 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.19 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.65 
 
 		 372 aa  62  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.19 
 
 		 366 aa  62.4  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  21.53 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  23.22 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1403  glycine cleavage system T protein  21.66 
 
 		 376 aa  61.6  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  20.1 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>