More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0192 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0192  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  100 
 
 
462 aa  936    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000184996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0209  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  90.04 
 
 
450 aa  811    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000425405  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1565  aminomethyltransferase  74.17 
 
 
457 aa  685    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.287343  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33030  aminomethyltransferase  61.2 
 
 
450 aa  545  1e-154  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6553  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  54.92 
 
 
467 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0277028  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2404  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  50.99 
 
 
462 aa  464  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2861  aminomethyltransferase  50.99 
 
 
466 aa  457  1e-127  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11650  aminomethyltransferase  48.14 
 
 
466 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5560  glycine cleavage system T protein aminomethyltransferase  44.92 
 
 
472 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1944  aminomethyltransferase, putative  37.38 
 
 
425 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000857452 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24920  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  31.4 
 
 
460 aa  196  6e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.852439  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0320  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  30.88 
 
 
469 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.92 
 
 
370 aa  103  7e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.27 
 
 
400 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.48 
 
 
362 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.56 
 
 
368 aa  93.2  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  27.57 
 
 
440 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  27.57 
 
 
442 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.4 
 
 
364 aa  90.9  5e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.71 
 
 
364 aa  90.1  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.26 
 
 
364 aa  88.6  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  28.08 
 
 
375 aa  88.2  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19710  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  26.53 
 
 
425 aa  87  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.207697  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  27.99 
 
 
381 aa  86.3  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  25.48 
 
 
357 aa  86.3  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  27.39 
 
 
370 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  24.82 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  27.04 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  28.75 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1892  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.12 
 
 
363 aa  84  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  24.58 
 
 
374 aa  84  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  25.67 
 
 
365 aa  84  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0469  glycine cleavage system T protein  25.67 
 
 
371 aa  83.6  0.000000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  28.08 
 
 
369 aa  82.4  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  25 
 
 
371 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1102  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.16 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.547647  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3249  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 
831 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0784832  normal  0.220016 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3566  dimethylglycine dehydrogenase  25.84 
 
 
831 aa  81.6  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  22.86 
 
 
360 aa  80.9  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.32 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3299  glycine cleavage system T protein  27.36 
 
 
389 aa  80.9  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.212433  normal  0.550694 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.32 
 
 
363 aa  80.9  0.00000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  27.83 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.73 
 
 
360 aa  80.1  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  26.23 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  24.42 
 
 
366 aa  79  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1559  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.14 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.92 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.92 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.92 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.65 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.92 
 
 
366 aa  78.2  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  28.26 
 
 
379 aa  77.8  0.0000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  23 
 
 
364 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.92 
 
 
366 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25 
 
 
366 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.59 
 
 
366 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.88 
 
 
360 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.92 
 
 
366 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.61 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.92 
 
 
366 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  24.64 
 
 
351 aa  74.3  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.64 
 
 
365 aa  73.9  0.000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  28.16 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.65 
 
 
380 aa  72.8  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113377  normal  0.236681 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  21.49 
 
 
363 aa  72.4  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.3 
 
 
372 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  25.81 
 
 
854 aa  72.4  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  23.62 
 
 
361 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0764  aminomethyltransferase  24.13 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.214671  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  20.82 
 
 
359 aa  71.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  24.44 
 
 
366 aa  71.6  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0434  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 
819 aa  71.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3874  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.18 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  0.546163 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  22.97 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.18 
 
 
369 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.19 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4339  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.59 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.485786  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.08 
 
 
365 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  26.3 
 
 
366 aa  69.7  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  21.17 
 
 
360 aa  69.3  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0642  FAD dependent oxidoreductase  26.69 
 
 
815 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1627  glycine cleavage system T protein  21.79 
 
 
357 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  24.43 
 
 
365 aa  68.6  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  21.85 
 
 
369 aa  67.8  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.58 
 
 
380 aa  67.4  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12239  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.68 
 
 
379 aa  67.4  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0923739  normal  0.265533 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4740  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.67 
 
 
857 aa  67.4  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.38185  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2760  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.36 
 
 
376 aa  67.4  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1559  glycine cleavage system T protein  24.02 
 
 
359 aa  67  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.338769 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1240  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.52 
 
 
390 aa  66.6  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.199307 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3320  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.94 
 
 
364 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.095795 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3309  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.94 
 
 
364 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  20.56 
 
 
362 aa  66.2  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3371  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.94 
 
 
364 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.577029  normal  0.23112 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3574  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.63 
 
 
369 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0601666  normal  0.0493616 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2939  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.83 
 
 
369 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2594  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.26 
 
 
375 aa  65.5  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.26707 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.08 
 
 
360 aa  65.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.76 
 
 
360 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>