More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_33030 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_33030  aminomethyltransferase  100 
 
 
450 aa  930    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0209  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  62.86 
 
 
450 aa  580  1e-164  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000425405  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0192  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  61.2 
 
 
462 aa  545  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000184996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1565  aminomethyltransferase  58.24 
 
 
457 aa  533  1e-150  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.287343  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6553  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  50.87 
 
 
467 aa  478  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0277028  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2404  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  50.33 
 
 
462 aa  445  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2861  aminomethyltransferase  49.24 
 
 
466 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11650  aminomethyltransferase  47.51 
 
 
466 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5560  glycine cleavage system T protein aminomethyltransferase  42.89 
 
 
472 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1944  aminomethyltransferase, putative  38.68 
 
 
425 aa  279  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000857452 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24920  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  31.88 
 
 
460 aa  199  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.852439  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0320  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  28.71 
 
 
469 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  29.37 
 
 
362 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  28 
 
 
364 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  29.54 
 
 
372 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  24.76 
 
 
357 aa  89.7  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.96 
 
 
380 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  26.09 
 
 
440 aa  87.8  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  26.09 
 
 
442 aa  87.4  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  27.21 
 
 
371 aa  87.4  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.44 
 
 
400 aa  87.4  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.42 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.53 
 
 
364 aa  85.5  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.24 
 
 
364 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  28.57 
 
 
369 aa  84.3  0.000000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.82 
 
 
363 aa  84.3  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  24.43 
 
 
366 aa  84  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  26.54 
 
 
381 aa  83.6  0.000000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  25.68 
 
 
365 aa  82.8  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  27.04 
 
 
360 aa  82.8  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.8 
 
 
364 aa  81.6  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  25.76 
 
 
381 aa  82  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  25.17 
 
 
369 aa  80.5  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1892  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.37 
 
 
363 aa  80.5  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0469  glycine cleavage system T protein  28.57 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.5 
 
 
360 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2689  putative sarcosine oxidase, alpha subunit  26.58 
 
 
993 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1347  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.25 
 
 
993 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0394007 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.88 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.25 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2054  glycine cleavage system T protein  25.75 
 
 
374 aa  77.4  0.0000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  24.75 
 
 
370 aa  76.3  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  26.22 
 
 
401 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1874  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.3 
 
 
993 aa  75.9  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.25 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.25 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.95 
 
 
380 aa  74.7  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113377  normal  0.236681 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1847  aminomethyltransferase  24.91 
 
 
386 aa  74.7  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.674665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.43 
 
 
364 aa  74.7  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0764  aminomethyltransferase  22.32 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.214671  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  24.17 
 
 
1003 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  23.84 
 
 
1003 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1800  glycine cleavage system T protein  23.32 
 
 
367 aa  73.2  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2868  glycine cleavage system T protein  24.27 
 
 
361 aa  72.8  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  23.17 
 
 
375 aa  72  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  24.08 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.84 
 
 
1003 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2186  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  25.94 
 
 
1009 aa  72  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.51 
 
 
999 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1403  glycine cleavage system T protein  25.81 
 
 
376 aa  70.9  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19710  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  21.79 
 
 
425 aa  70.9  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.207697  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0994  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  26.92 
 
 
998 aa  70.9  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.18 
 
 
1003 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.18 
 
 
1003 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.18 
 
 
1003 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6592  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.91 
 
 
789 aa  70.5  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00642843 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2714  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.78 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.84 
 
 
369 aa  70.5  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.45 
 
 
360 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  25.96 
 
 
379 aa  70.1  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  23.51 
 
 
889 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1598  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  23.84 
 
 
1000 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.898229  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  23.51 
 
 
1002 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  23.51 
 
 
1002 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  23.51 
 
 
1002 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.91 
 
 
360 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.6 
 
 
372 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5050  sarcosine oxidase, alpha subunit family  23.84 
 
 
1000 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.125712  normal  0.268825 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0867  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  27.18 
 
 
1003 aa  69.7  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  26.48 
 
 
365 aa  68.9  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  23.18 
 
 
1002 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5656  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  22.83 
 
 
789 aa  68.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.240642  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.51 
 
 
1003 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  25.35 
 
 
351 aa  68.2  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.67 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.77 
 
 
365 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0406  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.81 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.885714  normal  0.283909 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1983  aminomethyltransferase  23.39 
 
 
366 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00232491  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_56477  glycine decarboxylase t-protein  24.69 
 
 
854 aa  67.4  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.645348  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1538  glycine cleavage system T protein  22.17 
 
 
360 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.641003  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2620  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.45 
 
 
360 aa  67.8  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.398044  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  23.18 
 
 
1028 aa  67.4  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  23.58 
 
 
364 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  26.92 
 
 
350 aa  67  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  23.18 
 
 
1003 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0389  glycine cleavage system T protein  22.19 
 
 
363 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.65951 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  21.19 
 
 
364 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  21.98 
 
 
366 aa  65.1  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2115  sarcosine oxidase subunit alpha  24.92 
 
 
1000 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.98 
 
 
365 aa  64.7  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>