258 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_11650 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_11650  aminomethyltransferase  100 
 
 
466 aa  954    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2861  aminomethyltransferase  67.74 
 
 
466 aa  678    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6553  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  61.42 
 
 
467 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0277028  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5560  glycine cleavage system T protein aminomethyltransferase  51.69 
 
 
472 aa  494  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2404  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  52.59 
 
 
462 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1565  aminomethyltransferase  50.76 
 
 
457 aa  466  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.287343  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0192  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  48.14 
 
 
462 aa  422  1e-117  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000184996  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33030  aminomethyltransferase  47.51 
 
 
450 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0209  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  46.62 
 
 
450 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000425405  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1944  aminomethyltransferase, putative  36.53 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000857452 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24920  glycine cleavage system T protein (aminomethyltransferase)  29.72 
 
 
460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.852439  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0320  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.79 
 
 
469 aa  140  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1756  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  28.31 
 
 
362 aa  90.5  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.971274  normal  0.141351 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11173  aminomethyltransferase  25.74 
 
 
360 aa  87  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.324081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0426  glycine cleavage system T protein  26.19 
 
 
372 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.473658  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1804  glycine cleavage system T protein  27.36 
 
 
375 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.280258  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1914  glycine cleavage system T protein  27.5 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180377 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1269  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25 
 
 
400 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2285  glycine cleavage system T protein  25.86 
 
 
370 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010894 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0232  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.84 
 
 
368 aa  83.2  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3364  glycine cleavage system T protein  29.78 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2824  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.3 
 
 
369 aa  81.3  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23440  glycine cleavage system T protein  25.57 
 
 
357 aa  80.9  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000137386  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2751  aminomethyltransferase  25.75 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4039  glycine cleavage system T protein  25.3 
 
 
365 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000142158  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13330  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.1 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0737  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.75 
 
 
364 aa  80.1  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2005  glycine cleavage system T protein  29.17 
 
 
350 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1496  glycine cleavage system T protein  26.17 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2461  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.83 
 
 
380 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0469  glycine cleavage system T protein  26.36 
 
 
371 aa  79.7  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5660  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.8 
 
 
365 aa  78.2  0.0000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0713  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.54 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1526  glycine cleavage system T protein  25 
 
 
371 aa  77  0.0000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.293085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3845  glycine cleavage system T protein  27.16 
 
 
369 aa  75.1  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2562  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.01 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4550  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.53 
 
 
360 aa  74.3  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.669623 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0961  glycine cleavage system T protein  26.45 
 
 
364 aa  72.4  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.132468  normal  0.780252 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0716  glycine cleavage system T protein  23.51 
 
 
365 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1587  glycine cleavage system T protein  25.88 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0720  glycine cleavage system T protein  23.57 
 
 
364 aa  72  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0470  aminomethyltransferase  23.57 
 
 
440 aa  71.2  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000173433  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0767  glycine cleavage system T protein  23.57 
 
 
442 aa  71.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0094  glycine cleavage system T protein  24.37 
 
 
401 aa  70.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2522  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.91 
 
 
360 aa  70.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.167801 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0396  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.19 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1885  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.22 
 
 
363 aa  70.5  0.00000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4416  glycine cleavage system T protein  24.92 
 
 
364 aa  70.1  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4305  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.35 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3981  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.35 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1595  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.29 
 
 
363 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0825414  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0488  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  23.42 
 
 
1003 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0417  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.18 
 
 
362 aa  69.7  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0998  sarcosine oxidase, alpha subunit  23.68 
 
 
1002 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4082  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.87 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4358  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.35 
 
 
366 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.51819  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1628  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.29 
 
 
363 aa  69.7  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0764  aminomethyltransferase  24.2 
 
 
401 aa  69.3  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.214671  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4828  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  24.35 
 
 
1003 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.527733  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3463  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  24.62 
 
 
830 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0339  glycine cleavage system T protein  25.23 
 
 
363 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000293484  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2063  FAD dependent oxidoreductase  25.96 
 
 
806 aa  68.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5067  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.42 
 
 
1003 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.844501  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1656  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.31 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.200164  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2915  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.55 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.75153  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3506  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.42 
 
 
1003 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2351  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  26.75 
 
 
372 aa  67.4  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.417081  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5130  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.42 
 
 
1003 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.907469 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3218  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.42 
 
 
1003 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.6611  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5149  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.42 
 
 
1003 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.685714  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1817  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25.53 
 
 
363 aa  67  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000448698  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00490  aminomethyltransferase  24.61 
 
 
381 aa  67  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.155954 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0901  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.88 
 
 
366 aa  67  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.281219  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1952  sarcosine oxidase, alpha subunit, heterotetrameric  22.74 
 
 
1002 aa  67  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2020  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  25 
 
 
403 aa  67  0.0000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.436876 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4131  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.88 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3971  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.88 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0393  putative sarcosine oxidase alpha subunit  22.74 
 
 
1002 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4449  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.88 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.268637  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4247  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  24.88 
 
 
366 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2361  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.9 
 
 
364 aa  66.6  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.365627  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0892  sarcosine oxidase, alpha subunit, truncation  22.94 
 
 
889 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1860  sarcosine oxidase, alpha subunit  22.74 
 
 
1002 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.769627  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4350  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
816 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248836 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3331  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.76 
 
 
999 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.967331 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0045  glycine cleavage system T protein  25 
 
 
379 aa  65.9  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1245  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.91 
 
 
360 aa  65.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1173  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  25.09 
 
 
380 aa  66.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113377  normal  0.236681 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4544  sarcosine oxidase alpha subunit family protein  23.1 
 
 
1003 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3603  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  27.65 
 
 
761 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0599  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.77 
 
 
362 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.611166 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4141  glycine cleavage system T protein  22.05 
 
 
366 aa  65.5  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1818  glycine cleavage T protein (aminomethyl transferase)  26.26 
 
 
403 aa  65.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2360  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  27.85 
 
 
365 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0807615  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4021  FAD dependent oxidoreductase  27.68 
 
 
816 aa  65.1  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0048  sarcosine oxidase subunit alpha  23.86 
 
 
1028 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.416697 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1945  aminomethyltransferase  25.48 
 
 
366 aa  65.1  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000285507 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1892  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  23.72 
 
 
363 aa  65.1  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.323877 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0214  glycine cleavage system aminomethyltransferase T  22.84 
 
 
364 aa  64.7  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1712  glycine cleavage system T protein  27.73 
 
 
351 aa  64.3  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.304402  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>