More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A3550 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3621  putative GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.355756  normal  0.900731 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3656  putative GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3550  putative GntR-family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.829972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3718  putative GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  427  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.510184  normal  0.423567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3549  putative GntR-family transcriptional regulator  99.52 
 
 		 209 aa  424  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  33.81 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0441  GntR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 233 aa  72.4  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  30 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3337  transcriptional regulator, GntR family  38.64 
 
 		 246 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0218222  normal  0.194173 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  32.35 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  47.37 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2971  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3042  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 228 aa  65.1  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3215  GntR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4674  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 242 aa  64.7  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0073  GntR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 232 aa  64.7  0.0000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6303  GntR family transcriptional regulator  34.24 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2737  transcriptional regulator, GntR family  41.57 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.224257 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1708  GntR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.882341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 219 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1285  GntR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6280  transcriptional regulator, GntR family  30.39 
 
 		 233 aa  62.8  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.00000068764  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 235 aa  62  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1564  transcriptional regulator, GntR family  34.12 
 
 		 238 aa  62  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000123193  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3738  GntR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0346  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2945  transcriptional regulator, GntR family  37.5 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000364354  hitchhiker  0.000119928 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  36.96 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 233 aa  61.6  0.000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 223 aa  61.2  0.000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2025  GntR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  31.71 
 
 		 222 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  36.84 
 
 		 233 aa  60.8  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2025  transcriptional regulator, GntR family  31.08 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  hitchhiker  0.0065159 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3628  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0316  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2168  GntR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0196493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3944  transcriptional regulator, GntR family  26.9 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  28.07 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 223 aa  60.1  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5240  transcriptional regulator, GntR family  28.65 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4139  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 255 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3588  transcriptional regulator, GntR family  38.1 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3643  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  34.48 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3824  GntR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  34.65 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  36.25 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4020  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4046  GntR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3123  transcriptional regulator, GntR family  32.24 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5075  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.686169  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2043  GntR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1439  transcriptional regulator, GntR family  28.06 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  30.28 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  43.28 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 256 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0665  transcriptional regulator, GntR family  37.04 
 
 		 249 aa  59.3  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0305272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4360  transcriptional regulator, GntR family  41.46 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1124  transcriptional regulator, GntR family  27.57 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3123  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 233 aa  58.9  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00780857  normal  0.194587 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  33.66 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  25 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0845  GntR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>