More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0399 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0399  threonine dehydratase, biosynthetic  100 
 
 		 288 aa  589  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3411  threonine dehydratase  98.26 
 
 		 517 aa  581  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4344  threonine dehydratase  85.47 
 
 		 545 aa  511  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3611  threonine dehydratase  85.81 
 
 		 536 aa  513  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4125  threonine dehydratase  85.81 
 
 		 531 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4006  threonine dehydratase  85.81 
 
 		 531 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3931  threonine dehydratase  85.81 
 
 		 531 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0365  threonine dehydratase  85.47 
 
 		 557 aa  511  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3661  threonine dehydratase  85.47 
 
 		 557 aa  511  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0359  threonine dehydratase  85.47 
 
 		 547 aa  512  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4028  threonine dehydratase  85.47 
 
 		 531 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.640825  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0446  threonine dehydratase  84.21 
 
 		 516 aa  505  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0425  threonine dehydratase  83.04 
 
 		 523 aa  504  9.999999999999999e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0293  threonine dehydratase  83.51 
 
 		 516 aa  500  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0349  threonine dehydratase  82.81 
 
 		 516 aa  501  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4161  threonine dehydratase  84.91 
 
 		 516 aa  503  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3278  threonine dehydratase  82.59 
 
 		 531 aa  487  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4056  threonine dehydratase  64.79 
 
 		 514 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0486  threonine dehydratase  64.79 
 
 		 514 aa  385  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.824799  normal  0.345078 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0158  threonine dehydratase  64.79 
 
 		 514 aa  385  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4011  threonine dehydratase  64.08 
 
 		 515 aa  381  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0184686 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4217  threonine dehydratase  65.14 
 
 		 514 aa  382  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4028  threonine dehydratase  64.79 
 
 		 514 aa  381  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.749661  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3772  threonine dehydratase  63.16 
 
 		 514 aa  378  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.450956  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4756  threonine dehydratase  63.51 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.547271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2492  threonine dehydratase  62.32 
 
 		 510 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4187  threonine dehydratase  63.51 
 
 		 514 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0142  threonine dehydratase  63.51 
 
 		 514 aa  377  1e-103  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5206  threonine dehydratase  63.51 
 
 		 514 aa  375  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4139  threonine dehydratase  63.51 
 
 		 515 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0936158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4236  threonine dehydratase  63.51 
 
 		 514 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4284  threonine dehydratase  63.51 
 
 		 514 aa  375  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.976418  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4147  threonine dehydratase  63.51 
 
 		 514 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0052  threonine dehydratase  61.05 
 
 		 510 aa  375  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.954999  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4115  threonine dehydratase  63.51 
 
 		 514 aa  374  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03650  threonine dehydratase  63.51 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00482179  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4204  threonine dehydratase, biosynthetic  63.51 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.806906  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4130  threonine dehydratase  63.51 
 
 		 514 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4847  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  60.75 
 
 		 522 aa  371  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0309858  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4230  threonine dehydratase  63.51 
 
 		 515 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3989  threonine dehydratase  63.51 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03599  hypothetical protein  63.51 
 
 		 514 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00379045  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4295  threonine dehydratase  63.16 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00414  threonine dehydratase  61.4 
 
 		 515 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002037  threonine dehydratase biosynthetic  60.7 
 
 		 515 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4249  threonine dehydratase, biosynthetic  61.07 
 
 		 516 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.423735  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3338  threonine dehydratase, biosynthetic  61.19 
 
 		 511 aa  362  4e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0183  threonine dehydratase  58.8 
 
 		 511 aa  355  3.9999999999999996e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0549  threonine dehydratase, biosynthetic  58.1 
 
 		 504 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.597687  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0354  threonine dehydratase  59.01 
 
 		 509 aa  352  5e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04016  threonine dehydratase  57.34 
 
 		 515 aa  352  5e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2666  threonine dehydratase  57.99 
 
 		 509 aa  351  5.9999999999999994e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1794  threonine dehydratase  56.89 
 
 		 514 aa  343  2e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.306428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2774  threonine dehydratase  56.34 
 
 		 506 aa  342  4e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199104  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1563  threonine dehydratase, biosynthetic  57.34 
 
 		 507 aa  336  1.9999999999999998e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0437  threonine dehydratase  56.03 
 
 		 503 aa  335  5.999999999999999e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3386  L-threonine ammonia-lyase  55.12 
 
 		 503 aa  333  3e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.334671 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47100  threonine dehydratase  57.6 
 
 		 515 aa  332  6e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1280  threonine dehydratase  55.12 
 
 		 505 aa  332  6e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4064  threonine dehydratase  57.6 
 
 		 515 aa  330  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3436  threonine dehydratase  54.23 
 
 		 511 aa  330  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5252  threonine dehydratase, biosynthetic  55.94 
 
 		 515 aa  328  8e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.871195  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0370  threonine dehydratase  53.17 
 
 		 507 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0704  threonine dehydratase  54.04 
 
 		 507 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0020  L-threonine ammonia-lyase  52.11 
 
 		 504 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.381683  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1177  threonine dehydratase  54.74 
 
 		 523 aa  326  3e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2363  L-threonine ammonia-lyase  54.93 
 
 		 505 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.088118 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48270  threonine dehydratase  54.58 
 
 		 504 aa  324  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2763  threonine dehydratase  53.33 
 
 		 507 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6064  threonine dehydratase  54.06 
 
 		 507 aa  323  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0423  threonine dehydratase  54.93 
 
 		 504 aa  323  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146858  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0562  threonine dehydratase  53.71 
 
 		 507 aa  323  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2654  threonine dehydratase  53.71 
 
 		 507 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2318  threonine dehydratase  55.99 
 
 		 519 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2736  threonine dehydratase  53.33 
 
 		 507 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3446  threonine dehydratase  55.99 
 
 		 530 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2124  threonine dehydratase  53.33 
 
 		 507 aa  323  3e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.619437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04320  threonine dehydratase  54.93 
 
 		 504 aa  323  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3269  threonine dehydratase  52.82 
 
 		 502 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.579031  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2787  threonine dehydratase  53.71 
 
 		 507 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0128  threonine dehydratase  52.46 
 
 		 503 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5381  threonine dehydratase  54.23 
 
 		 504 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653757 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2490  threonine dehydratase  56.29 
 
 		 519 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.138025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5149  threonine dehydratase  54.58 
 
 		 504 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.436778 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0549  threonine dehydratase  52.65 
 
 		 507 aa  319  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5056  threonine dehydratase  54.58 
 
 		 504 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.381788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5202  threonine dehydratase  54.58 
 
 		 504 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4123  threonine dehydratase  53.5 
 
 		 510 aa  319  3.9999999999999996e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1144  threonine dehydratase  52.84 
 
 		 535 aa  318  5e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.15844  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3288  threonine dehydratase, biosynthetic  54.17 
 
 		 514 aa  318  5e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172901  normal  0.134421 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0870  threonine dehydratase, biosynthetic  52.98 
 
 		 506 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0722  threonine ammonia-lyase, biosynthetic  52.98 
 
 		 506 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130399  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2231  threonine dehydratase  52.11 
 
 		 524 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.485473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0676  threonine dehydratase  51.06 
 
 		 503 aa  317  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.427964 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2929  threonine dehydratase  55.4 
 
 		 520 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.333132 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0840  threonine dehydratase  53 
 
 		 507 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2039  threonine dehydratase  52.11 
 
 		 524 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4054  threonine dehydratase  52.11 
 
 		 535 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.536214 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4221  threonine dehydratase  53.87 
 
 		 504 aa  317  1e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0316  threonine dehydratase  54.23 
 
 		 504 aa  317  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.167113 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>