215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1585 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  84.14 
 
 		 372 aa  662    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  100 
 
 		 372 aa  761    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  62.5 
 
 		 401 aa  498  1e-140  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  63.61 
 
 		 375 aa  498  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  55.91 
 
 		 370 aa  435  1e-121  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  56.99 
 
 		 379 aa  436  1e-121  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  55.5 
 
 		 368 aa  428  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  56.03 
 
 		 368 aa  428  1e-119  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  55.76 
 
 		 368 aa  427  1e-118  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  56.03 
 
 		 368 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  56.03 
 
 		 368 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  56.03 
 
 		 368 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  56.03 
 
 		 368 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  56.03 
 
 		 368 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  56.03 
 
 		 368 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  56.03 
 
 		 368 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  54.55 
 
 		 368 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  54.18 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  47.99 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  45.58 
 
 		 366 aa  338  9.999999999999999e-92  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  47.71 
 
 		 366 aa  325  7e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  47.71 
 
 		 366 aa  325  7e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  44.03 
 
 		 385 aa  320  3e-86  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  35.66 
 
 		 396 aa  251  2e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  34.95 
 
 		 363 aa  204  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  33.96 
 
 		 363 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.46 
 
 		 379 aa  192  5e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  31.38 
 
 		 710 aa  190  2.9999999999999997e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  29.76 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  30.91 
 
 		 376 aa  175  9e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  29.4 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  31.48 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  30.77 
 
 		 604 aa  161  2e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  28.73 
 
 		 357 aa  153  4e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.88 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  27.18 
 
 		 361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  28.76 
 
 		 401 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  27.11 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  27.1 
 
 		 314 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  26.45 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  28.85 
 
 		 260 aa  54.7  0.000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3396  GTP-binding  27.68 
 
 		 330 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  29.81 
 
 		 307 aa  53.5  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  27.1 
 
 		 311 aa  53.1  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3629  GTP-binding protein HSR1-related  29.87 
 
 		 320 aa  53.1  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1388  GTP-binding  29.3 
 
 		 316 aa  53.1  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  28.07 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2662  small GTP-binding protein  29.94 
 
 		 453 aa  52.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.144738  hitchhiker  0.00576403 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  25.81 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1312  GTP-binding protein, HSR1-related  27.68 
 
 		 319 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3656  tRNA modification GTPase TrmE  37.86 
 
 		 460 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  40.66 
 
 		 462 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02701  ribosomal biogenesis GTPase  27.59 
 
 		 287 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0776649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3634  ribosomal biogenesis GTPase  26.55 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  24.71 
 
 		 560 aa  50.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1561  ribosomal biogenesis GTPase  27.59 
 
 		 287 aa  50.1  0.00007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  41.79 
 
 		 447 aa  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  25.3 
 
 		 313 aa  50.1  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  29.63 
 
 		 463 aa  49.7  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  30.52 
 
 		 277 aa  49.7  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  25.1 
 
 		 319 aa  49.7  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  25.27 
 
 		 544 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.71 
 
 		 386 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4081  tRNA modification GTPase TrmE  43.06 
 
 		 441 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0162579 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1029  tRNA modification GTPase TrmE  40.28 
 
 		 434 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.111023  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  25.1 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  31.25 
 
 		 299 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  40 
 
 		 460 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  26.45 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2587  tRNA modification GTPase TrmE  39.13 
 
 		 448 aa  48.9  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.147171 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2758  GTP-binding protein, HSR1-related  29.88 
 
 		 329 aa  49.3  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0145905 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  26.63 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7891  GTPase EngC  28.15 
 
 		 349 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2407  tRNA modification GTPase TrmE  42.03 
 
 		 433 aa  48.1  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0100  tRNA modification GTPase TrmE  35.42 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.651435  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  28.1 
 
 		 319 aa  48.5  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  26.75 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  23.89 
 
 		 597 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  26.51 
 
 		 312 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  30.47 
 
 		 299 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  30.25 
 
 		 449 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  28.93 
 
 		 322 aa  47.8  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  30.25 
 
 		 449 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  40.28 
 
 		 455 aa  47.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  25.9 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30770  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.44 
 
 		 333 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.117356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2254  tRNA modification GTPase TrmE  35.29 
 
 		 436 aa  47  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.9716  normal  0.222751 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  25.29 
 
 		 443 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  23.46 
 
 		 281 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1580  tRNA modification GTPase TrmE  43.06 
 
 		 444 aa  47  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.183316 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3472  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 		 442 aa  46.6  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  27.44 
 
 		 287 aa  46.6  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  35.62 
 
 		 428 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1582  tRNA modification GTPase TrmE  35.29 
 
 		 462 aa  46.6  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  36.73 
 
 		 428 aa  46.6  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0750  GTP-binding protein EngA  29.48 
 
 		 451 aa  46.6  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524371  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  46.15 
 
 		 442 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  25.81 
 
 		 313 aa  46.6  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  23.4 
 
 		 521 aa  46.2  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0717  tRNA modification GTPase TrmE  42.03 
 
 		 550 aa  46.2  0.0009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>