101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0525 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  100 
 
 		 361 aa  722    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  30.36 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  30.25 
 
 		 370 aa  143  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  25.13 
 
 		 396 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  27.12 
 
 		 369 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  27.1 
 
 		 379 aa  136  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  27.37 
 
 		 369 aa  134  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  27.45 
 
 		 375 aa  134  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  26.68 
 
 		 372 aa  133  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  25.68 
 
 		 368 aa  132  6e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  25.68 
 
 		 368 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  25.68 
 
 		 368 aa  132  6e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  25.68 
 
 		 368 aa  132  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  25.68 
 
 		 368 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  25.68 
 
 		 368 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  25.68 
 
 		 368 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  27.18 
 
 		 372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  25.34 
 
 		 368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  25.41 
 
 		 368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  25.41 
 
 		 368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  25.27 
 
 		 368 aa  129  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  29.08 
 
 		 357 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  28.29 
 
 		 366 aa  126  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  28.29 
 
 		 366 aa  126  8.000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  25.54 
 
 		 385 aa  122  7e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  27.72 
 
 		 365 aa  117  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  25.19 
 
 		 401 aa  115  1.0000000000000001e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  27.63 
 
 		 363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  25.33 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  29.36 
 
 		 367 aa  110  5e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  27.08 
 
 		 376 aa  109  7.000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  27.78 
 
 		 365 aa  108  1e-22  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  25.88 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.27 
 
 		 391 aa  80.1  0.00000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  20.44 
 
 		 710 aa  73.6  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  19.39 
 
 		 604 aa  56.6  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  30.18 
 
 		 544 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3318  ribosome-associated GTPase  28.11 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00153777  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0630  GTPase EngC  31.01 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000140785  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4710  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 350 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.516507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4767  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 350 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.686105  normal  0.0608058 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4618  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 350 aa  50.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.766996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4627  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 350 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4746  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 350 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  27.67 
 
 		 384 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3829  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.33 
 
 		 350 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101292  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  27.85 
 
 		 374 aa  49.7  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3849  ribosome-associated GTPase  33.33 
 
 		 350 aa  49.7  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00200701  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4632  ribosome-associated GTPase  32.7 
 
 		 350 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000257441  normal  0.0538401 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10438  conserved hypothetical protein  20.2 
 
 		 634 aa  49.3  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.906693 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04031  ribosome-associated GTPase  32.7 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000932419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4404  ribosome-associated GTPase  32.7 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000234943  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4718  ribosome-associated GTPase  32.7 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000781883  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4693  ribosome-associated GTPase  32.7 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000151742  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5677  ribosome-associated GTPase  32.7 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.0000000100514  normal  0.953433 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03993  hypothetical protein  32.7 
 
 		 350 aa  49.3  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000592  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  28.57 
 
 		 379 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  27.67 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  29.01 
 
 		 260 aa  47.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  26.52 
 
 		 440 aa  47.4  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3482  ribosome-associated GTPase  29.69 
 
 		 342 aa  47  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.845882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3843  ribosome small subunit-dependent GTPase A  28.65 
 
 		 296 aa  47  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338646  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2639  ribosome-associated GTPase  27.07 
 
 		 344 aa  46.6  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.014804  hitchhiker  0.000000658007 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  22.12 
 
 		 401 aa  46.2  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  28.42 
 
 		 597 aa  46.2  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4380  ribosome-associated GTPase  31.45 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0789  ribosome-associated GTPase  29.6 
 
 		 352 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.106685  hitchhiker  0.00135027 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.69 
 
 		 316 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1078  ribosome-associated GTPase  28.35 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1553  putative sigma-54 interacting protein  30.99 
 
 		 367 aa  45.1  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000818297  normal  0.17654 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3288  ribosome-associated GTPase  30.69 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0810  ribosome small subunit-dependent GTPase A  41.27 
 
 		 374 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0254422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1159  GTP-binding protein EngA  25.45 
 
 		 436 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.427593  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07460  ribosome-associated GTPase  23.9 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0591  ribosome-associated GTPase  30.95 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3213  ribosome-associated GTPase  28 
 
 		 353 aa  44.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106203  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1269  ribosome-associated GTPase  26.4 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1735  GTPase EngC  36.47 
 
 		 367 aa  44.3  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.216603  normal  0.355658 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0626  ribosome-associated GTPase  25.25 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.749766 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  27.56 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1651  GTP-binding protein EngA  31.58 
 
 		 443 aa  43.9  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00113  ribosome-associated GTPase  27.56 
 
 		 372 aa  43.9  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3901  ribosome-associated GTPase  27.13 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.047373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3718  ribosome-associated GTPase  27.13 
 
 		 354 aa  43.5  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0590  ribosome-associated GTPase  29.79 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155455 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3440  ribosome-associated GTPase  29.79 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0550  ribosome-associated GTPase  27.66 
 
 		 340 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00144595  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3775  ribosome-associated GTPase  27.13 
 
 		 354 aa  43.5  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0597624  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3662  ribosome-associated GTPase  25.48 
 
 		 350 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000216302  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0709  ribosome-associated GTPase  25.48 
 
 		 350 aa  43.5  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.547116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3809  ribosome-associated GTPase  25.48 
 
 		 350 aa  43.5  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000110208  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4694  ribosome-associated GTPase  24.49 
 
 		 343 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1159  GTP-binding protein HSR1-related  22.41 
 
 		 322 aa  43.5  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0589  ribosome-associated GTPase  29.79 
 
 		 354 aa  43.1  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235355 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0558  ribosome-associated GTPase  28.8 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.806165  normal  0.213457 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01420  ribosome small subunit-dependent GTPase A  26.72 
 
 		 324 aa  43.1  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2727  GTPase YjeQ, putative  32.28 
 
 		 364 aa  43.1  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.103752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65420  ribosome-associated GTPase  30.26 
 
 		 339 aa  43.1  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.672753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0514  ribosome-associated GTPase  26.67 
 
 		 343 aa  42.7  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.46762 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5681  ribosome-associated GTPase  30.26 
 
 		 334 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>