280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1164 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  100 
 
 		 366 aa  749    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  84.15 
 
 		 366 aa  623  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  84.15 
 
 		 366 aa  623  1e-177  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  52.99 
 
 		 368 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  52.72 
 
 		 368 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  52.72 
 
 		 368 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  52.72 
 
 		 368 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  52.72 
 
 		 368 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  52.72 
 
 		 368 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  52.72 
 
 		 368 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  52.72 
 
 		 368 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  52.99 
 
 		 368 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  52.72 
 
 		 368 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  52.45 
 
 		 368 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  49.86 
 
 		 369 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  49.86 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  46.38 
 
 		 372 aa  345  5e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  46.51 
 
 		 379 aa  342  4e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  45.58 
 
 		 372 aa  338  9.999999999999999e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  44.44 
 
 		 375 aa  334  1e-90  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  43.19 
 
 		 401 aa  335  1e-90  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  41.13 
 
 		 369 aa  303  2.0000000000000002e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  38.3 
 
 		 385 aa  291  1e-77  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  35.17 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  32.61 
 
 		 363 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  32.35 
 
 		 363 aa  212  7e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.35 
 
 		 379 aa  191  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  32.09 
 
 		 710 aa  189  5.999999999999999e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  31.73 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  31.48 
 
 		 365 aa  185  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  30.08 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  31.06 
 
 		 604 aa  167  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  28.88 
 
 		 376 aa  158  2e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.59 
 
 		 391 aa  155  7e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  29.89 
 
 		 365 aa  153  5e-36  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  30.36 
 
 		 361 aa  145  1e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  29.77 
 
 		 401 aa  132  7.999999999999999e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  33.97 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  26.52 
 
 		 560 aa  60.1  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  28.3 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  33.33 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  34.31 
 
 		 494 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  32.86 
 
 		 463 aa  57  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  34.78 
 
 		 493 aa  57  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  27.07 
 
 		 544 aa  56.6  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  31.08 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1498  GTP-binding protein EngA  36.23 
 
 		 462 aa  55.8  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  28.89 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  28.89 
 
 		 438 aa  55.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  26.7 
 
 		 449 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  26.7 
 
 		 449 aa  55.1  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  36.23 
 
 		 441 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1485  GTP-binding protein EngA  35.51 
 
 		 462 aa  53.9  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  26.44 
 
 		 534 aa  53.5  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  27.67 
 
 		 443 aa  53.5  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  36.23 
 
 		 441 aa  53.5  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  31.1 
 
 		 291 aa  53.5  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  31.44 
 
 		 388 aa  53.1  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  30.93 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  36.23 
 
 		 442 aa  52  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1775  GTP-binding protein EngA  32.62 
 
 		 465 aa  52.4  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01058  GTP-binding protein EngA  32.86 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189601  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  34.74 
 
 		 447 aa  51.6  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  36.23 
 
 		 455 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0061  ribosome small subunit-dependent GTPase A  37.5 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  28.18 
 
 		 597 aa  51.6  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06108  GTP-binding protein EngA  32.86 
 
 		 465 aa  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0692336  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  24.7 
 
 		 281 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  29.94 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  30.61 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  23.72 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  25.53 
 
 		 521 aa  51.2  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  29.44 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  29.38 
 
 		 717 aa  50.8  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  31.74 
 
 		 435 aa  50.4  0.00004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1390  GTP-binding protein EngA  30.87 
 
 		 443 aa  50.4  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1329  GTP-binding protein EngA  30.87 
 
 		 443 aa  50.4  0.00005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  29.63 
 
 		 259 aa  50.1  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10438  conserved hypothetical protein  21.41 
 
 		 634 aa  50.1  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.906693 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  27.75 
 
 		 268 aa  49.7  0.00007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  29.02 
 
 		 441 aa  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  25.61 
 
 		 281 aa  49.7  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  30.14 
 
 		 292 aa  49.7  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4321  GTP-binding protein EngA  29.49 
 
 		 487 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000597657 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1711  GTP-binding protein EngA  31.91 
 
 		 465 aa  49.7  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.625328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  28.66 
 
 		 287 aa  49.7  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2279  GTP-binding protein EngA  30.26 
 
 		 460 aa  49.3  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0830899  normal  0.567814 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28031  predicted protein  26.38 
 
 		 676 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl199  GTP-binding protein EngA  44.87 
 
 		 435 aa  48.9  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.316366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0752  GTP-binding protein EngA  29.38 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00177757 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0591  GTP-binding protein EngA  29.71 
 
 		 472 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  27.56 
 
 		 440 aa  48.9  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0536  putative GTP-binding protein EngA  30.46 
 
 		 473 aa  49.3  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  26.88 
 
 		 285 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2840  small GTP-binding protein  28.1 
 
 		 501 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0118235 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  28.66 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  24.8 
 
 		 516 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0196  ribosomal biogenesis GTPase  28.08 
 
 		 290 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  28.66 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0900  GTP-binding protein EngA  29.49 
 
 		 487 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000256408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>