More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2840 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_2840  small GTP-binding protein  100 
 
 
501 aa  1014    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0118235 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  42.24 
 
 
444 aa  325  1e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.98 
 
 
438 aa  318  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1325  hypothetical protein  42.04 
 
 
441 aa  313  3.9999999999999997e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3381  GTP-binding protein EngA  43.65 
 
 
441 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000285965  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  40.71 
 
 
439 aa  309  6.999999999999999e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2896  GTP-binding protein EngA  41.33 
 
 
453 aa  309  8e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0739755  hitchhiker  0.000158888 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  40.58 
 
 
441 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  41.78 
 
 
438 aa  308  2.0000000000000002e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  40.96 
 
 
440 aa  308  2.0000000000000002e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  42.92 
 
 
439 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  40.53 
 
 
439 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  42.73 
 
 
443 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0751  GTP-binding protein EngA  38.82 
 
 
440 aa  302  8.000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  40.13 
 
 
464 aa  296  4e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  39.65 
 
 
438 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  39.65 
 
 
438 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  39.33 
 
 
494 aa  297  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  39.74 
 
 
449 aa  296  5e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  39.23 
 
 
493 aa  295  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1630  small GTP-binding protein  38.98 
 
 
440 aa  294  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.52918  hitchhiker  0.00197431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3778  small GTP-binding protein  39.91 
 
 
433 aa  294  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0728  small GTP-binding protein  40.89 
 
 
441 aa  293  5e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.390352 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0319  small GTP-binding protein  39.32 
 
 
464 aa  293  6e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.236663 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1617  GTP-binding protein EngA  39.49 
 
 
460 aa  292  8e-78  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1631  GTP-binding protein EngA  39.25 
 
 
436 aa  292  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1414  GTP-binding protein EngA  39.25 
 
 
436 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1386  GTP-binding protein EngA  39.25 
 
 
436 aa  292  1e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.844345  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1386  GTP-binding protein EngA  39.25 
 
 
436 aa  292  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0845142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1525  GTP-binding protein EngA  39.25 
 
 
436 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1667  GTP-binding protein EngA  39.25 
 
 
436 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000514041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1559  GTP-binding protein EngA  39.25 
 
 
436 aa  292  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0922672  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1598  GTP-binding protein EngA  39.25 
 
 
436 aa  292  1e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000589883 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1498  GTP-binding protein EngA  36.07 
 
 
462 aa  291  2e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1227  GTP-binding protein EngA  38.75 
 
 
436 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.718862  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1428  GTP-binding protein EngA  38.14 
 
 
436 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1485  GTP-binding protein EngA  36.16 
 
 
462 aa  289  6e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2155  GTP-binding protein EngA  39.96 
 
 
471 aa  289  7e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.616734  normal  0.133544 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0359  GTP-binding protein EngA  38.8 
 
 
436 aa  289  7e-77  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1654  GTP-binding protein EngA  39.96 
 
 
465 aa  289  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  39.56 
 
 
437 aa  288  1e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0333  GTP-binding protein EngA  37.53 
 
 
453 aa  287  2e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3785  GTP-binding protein EngA  37.92 
 
 
436 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0456792  normal  0.0699486 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  40.62 
 
 
441 aa  288  2e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1620  GTP-binding protein EngA  38.75 
 
 
436 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0192  GTP-binding protein EngA  40.22 
 
 
445 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2632  small GTP-binding protein  38.62 
 
 
434 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2204  GTP-binding protein EngA  39.74 
 
 
465 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.199328  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2159  GTP-binding protein EngA  38.48 
 
 
436 aa  286  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000018961  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0460  GTP-binding protein EngA  38.74 
 
 
436 aa  287  4e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  39.39 
 
 
461 aa  286  5.999999999999999e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5226  ribosome-associated GTPase EngA  38.24 
 
 
435 aa  286  5.999999999999999e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.814163 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2028  GTP-binding protein EngA  38.18 
 
 
455 aa  286  8e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.89204  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3776  GTP-binding protein EngA  37.04 
 
 
456 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0350234  normal  0.961635 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2292  GTP-binding protein EngA  39.52 
 
 
465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0406895  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0644  GTP-binding protein EngA  38.18 
 
 
455 aa  285  2.0000000000000002e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.768693  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  40.09 
 
 
438 aa  285  2.0000000000000002e-75  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  37.8 
 
 
467 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0885  GTP-binding protein EngA  38.61 
 
 
452 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3505  GTP-binding protein EngA  38.03 
 
 
459 aa  283  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0442058  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1879  GTP-binding protein EngA  39.91 
 
 
437 aa  283  6.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  37.53 
 
 
460 aa  282  8.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  35.73 
 
 
455 aa  282  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0692  GTP-binding protein EngA  39.19 
 
 
470 aa  282  1e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1009  GTPase  37.69 
 
 
442 aa  282  1e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.369054  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0121  GTP-binding protein EngA  38.61 
 
 
452 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2340  GTP-binding protein EngA  40.35 
 
 
453 aa  281  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.160254  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0118  GTP-binding protein EngA  38.61 
 
 
452 aa  281  2e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.132129 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3149  GTP-binding protein EngA  37.69 
 
 
441 aa  281  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.421281  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1166  GTP-binding protein EngA  37.01 
 
 
490 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.000230797  normal  0.345653 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0799  GTP-binding protein EngA  37.47 
 
 
436 aa  281  2e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.940642  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03881  GTP-binding protein EngA  38.14 
 
 
456 aa  280  6e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1043  GTP-binding protein EngA  37.83 
 
 
436 aa  279  8e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.617691  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1609  GTP-binding protein EngA  38.94 
 
 
449 aa  279  8e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0528486 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1937  GTP-binding protein EngA  38.94 
 
 
449 aa  279  8e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4514  GTP-binding protein EngA  37.16 
 
 
477 aa  279  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.194124 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  38.16 
 
 
440 aa  279  1e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3566  ribosome-associated GTPase EngA  38.22 
 
 
454 aa  278  1e-73  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.173152  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1561  GTP-binding protein EngA  38.74 
 
 
453 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.53751  normal  0.168181 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2225  GTP-binding protein EngA  38.43 
 
 
438 aa  277  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1758  small GTP-binding protein  38.36 
 
 
448 aa  277  3e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1224  ribosome-associated GTPase EngA  40.66 
 
 
447 aa  277  3e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2103  GTP-binding protein EngA  36.81 
 
 
441 aa  277  4e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1809  small GTP-binding protein  38.44 
 
 
446 aa  276  4e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000018958  normal  0.445899 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06890  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  39.33 
 
 
444 aa  277  4e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.632761 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3302  GTP-binding protein EngA  36.17 
 
 
474 aa  276  4e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.316901  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  37.83 
 
 
567 aa  276  6e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04431  GTP-binding protein EngA  37.74 
 
 
456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0422674  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3126  GTP-binding protein EngA  38.88 
 
 
454 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1686  GTP-binding protein EngA  37.79 
 
 
460 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0325003  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1395  GTP-binding protein EngA  38.82 
 
 
441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1177  GTP-binding protein  39.04 
 
 
441 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1291  GTP-binding protein EngA  37.72 
 
 
436 aa  275  2.0000000000000002e-72  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0244351  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1726  GTP-binding protein EngA  37.53 
 
 
456 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  39.42 
 
 
442 aa  274  3e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04111  GTP-binding protein EngA  36.96 
 
 
457 aa  273  5.000000000000001e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1337  small GTP-binding protein  38.33 
 
 
438 aa  273  5.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0503171  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2169  GTP-binding protein EngA  37.24 
 
 
479 aa  273  6e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414386  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2314  GTP-binding protein EngA  37.39 
 
 
439 aa  273  8.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09700  small GTP-binding protein domain/GTP-binding conserved hypothetical protein  37.95 
 
 
438 aa  272  9e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.253075  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>