More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_30716 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  100 
 
 		 534 aa  1110    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  61.5 
 
 		 560 aa  633  1e-180  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  59.49 
 
 		 717 aa  560  1e-158  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  47.24 
 
 		 443 aa  457  1e-127  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  44.77 
 
 		 562 aa  445  1e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  34.29 
 
 		 669 aa  192  9e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  31.18 
 
 		 597 aa  189  1e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  36.36 
 
 		 360 aa  183  7e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  30.12 
 
 		 521 aa  152  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  30.98 
 
 		 544 aa  149  9e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_2179  predicted protein  27.27 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.805213  decreased coverage  0.000732595 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  32.75 
 
 		 268 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  34.07 
 
 		 261 aa  125  2e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  32.69 
 
 		 260 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77411  predicted protein  26.56 
 
 		 653 aa  122  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  32.39 
 
 		 379 aa  121  3e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  31.14 
 
 		 259 aa  120  6e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  33.7 
 
 		 256 aa  116  8.999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  31.88 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  31.52 
 
 		 388 aa  114  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  30.94 
 
 		 384 aa  114  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.67 
 
 		 267 aa  111  3e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  31.34 
 
 		 374 aa  110  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  33.2 
 
 		 254 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01470  GTP-binding protein, putative  32.96 
 
 		 743 aa  103  9e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  29.12 
 
 		 291 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  31.2 
 
 		 261 aa  100  6e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02263  ribosome biogenesis GTPase Lsg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06510)  31.82 
 
 		 650 aa  98.6  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.722478  normal  0.600285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  28.84 
 
 		 314 aa  97.4  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  28.92 
 
 		 282 aa  96.7  9e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1931  GTP-binding protein YlqF  30.91 
 
 		 265 aa  96.3  1e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  29.64 
 
 		 292 aa  95.5  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  29.24 
 
 		 258 aa  92.8  1e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  26.09 
 
 		 323 aa  92  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  28.66 
 
 		 314 aa  90.9  5e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  26.45 
 
 		 312 aa  88.2  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  26.45 
 
 		 312 aa  88.2  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  28.25 
 
 		 278 aa  87.8  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  25.67 
 
 		 369 aa  87.8  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  28.21 
 
 		 276 aa  87.4  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2487  GTP-binding protein HSR1-related  29.64 
 
 		 328 aa  87.4  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000110563 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  28.32 
 
 		 314 aa  87.4  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.44 
 
 		 274 aa  86.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  28.26 
 
 		 314 aa  86.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  27.38 
 
 		 280 aa  86.7  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  28.67 
 
 		 313 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  26.95 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2120  GTPase  28.35 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  25.35 
 
 		 292 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  26.95 
 
 		 318 aa  85.5  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3634  ribosomal biogenesis GTPase  25.36 
 
 		 334 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  28.91 
 
 		 258 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  28.32 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.14 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  28.04 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  28.32 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  28.32 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  28.04 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  26.48 
 
 		 311 aa  84  0.000000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  27.21 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  25.09 
 
 		 296 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  25.09 
 
 		 296 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  25.09 
 
 		 296 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  27.8 
 
 		 313 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  25.09 
 
 		 296 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  25.09 
 
 		 296 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  27.38 
 
 		 280 aa  83.2  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  25.09 
 
 		 296 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  28.01 
 
 		 313 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  25.09 
 
 		 296 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  25.09 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  26.9 
 
 		 292 aa  82  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC03480  GTP-binding protein, putative  25 
 
 		 642 aa  82.8  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.866446  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  25.36 
 
 		 312 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  25.09 
 
 		 296 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  26.52 
 
 		 287 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  27.47 
 
 		 299 aa  82  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  26.82 
 
 		 323 aa  82  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  26.8 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  27.4 
 
 		 287 aa  81.3  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  26.11 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  26.8 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2270  GTP-binding protein  28.15 
 
 		 322 aa  80.5  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193404  hitchhiker  0.000000344964 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  27.66 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  29.92 
 
 		 271 aa  80.5  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  27.3 
 
 		 313 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  27.3 
 
 		 313 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  27.3 
 
 		 313 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  24.91 
 
 		 284 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  27.3 
 
 		 313 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  26.79 
 
 		 279 aa  79.3  0.0000000000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  24.73 
 
 		 296 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  24.45 
 
 		 315 aa  79  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  26.57 
 
 		 299 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  27.7 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  26.33 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  26.33 
 
 		 281 aa  79  0.0000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.47 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  24.81 
 
 		 270 aa  78.6  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  27.05 
 
 		 313 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>