115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0906 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  100 
 
 
385 aa  786    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  44.27 
 
 
379 aa  332  7.000000000000001e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  43.56 
 
 
375 aa  328  7e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  43.68 
 
 
372 aa  322  6e-87  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  44.03 
 
 
372 aa  320  3e-86  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  40.99 
 
 
401 aa  303  5.000000000000001e-81  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  41.05 
 
 
370 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  41.53 
 
 
368 aa  294  2e-78  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  41.02 
 
 
369 aa  292  6e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  38.3 
 
 
366 aa  291  1e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  40.99 
 
 
368 aa  291  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  40.47 
 
 
368 aa  290  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  40.47 
 
 
368 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  40.47 
 
 
368 aa  290  3e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  40.47 
 
 
368 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  40.47 
 
 
368 aa  290  3e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  40.47 
 
 
368 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  40.47 
 
 
368 aa  290  3e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  40.47 
 
 
368 aa  290  3e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  40.47 
 
 
368 aa  290  3e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  40.16 
 
 
366 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  40.16 
 
 
366 aa  281  1e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  38.93 
 
 
369 aa  258  9e-68  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  33.54 
 
 
396 aa  213  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  31.75 
 
 
365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  32.11 
 
 
367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  29.73 
 
 
710 aa  165  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  30.03 
 
 
365 aa  162  7e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  30.03 
 
 
363 aa  160  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  30.29 
 
 
363 aa  155  1e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  29.37 
 
 
376 aa  141  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.2 
 
 
379 aa  139  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  26.45 
 
 
604 aa  129  6e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  25.54 
 
 
361 aa  122  8e-27  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  26.74 
 
 
357 aa  109  7.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  26.36 
 
 
391 aa  105  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  25.09 
 
 
401 aa  92.4  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  31.58 
 
 
463 aa  58.9  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  33.33 
 
 
260 aa  53.1  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  27.07 
 
 
291 aa  52.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  27.01 
 
 
374 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  25.79 
 
 
544 aa  51.6  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  26.14 
 
 
388 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  22.84 
 
 
521 aa  50.4  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  27.27 
 
 
281 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  26.44 
 
 
384 aa  50.1  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  27.49 
 
 
562 aa  50.1  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1485  GTP-binding protein EngA  29.55 
 
 
462 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07630  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  28 
 
 
590 aa  48.9  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.72969  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  25.85 
 
 
281 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  25.29 
 
 
560 aa  48.5  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  24.43 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  31.55 
 
 
379 aa  48.9  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  37.5 
 
 
439 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1775  GTP-binding protein EngA  25.13 
 
 
465 aa  48.1  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  25.52 
 
 
281 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  25.53 
 
 
285 aa  48.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1498  GTP-binding protein EngA  29.09 
 
 
462 aa  47.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09460  predicted GTPase  25.82 
 
 
344 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.131219  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2203  ribosome-associated GTPase EngA  29.05 
 
 
567 aa  47.4  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1662  GTP-binding protein EngA  27.75 
 
 
465 aa  47.4  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0937106 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  47.54 
 
 
447 aa  47  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1711  GTP-binding protein EngA  24.62 
 
 
465 aa  46.6  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.625328  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  25.43 
 
 
292 aa  46.6  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  24.3 
 
 
360 aa  46.6  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2332  ABC transporter ATP-binding and permease protein  26.79 
 
 
593 aa  46.6  0.0008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.83663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  29.89 
 
 
443 aa  46.2  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0625  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.67 
 
 
480 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  32.97 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  32.97 
 
 
294 aa  45.8  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3568  GTP-binding protein EngA  30.77 
 
 
455 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3702  ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC  43.33 
 
 
217 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  26.04 
 
 
534 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  24.56 
 
 
313 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  25.99 
 
 
290 aa  45.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  23.63 
 
 
283 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10530  small GTP-binding protein  27.62 
 
 
438 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01058  GTP-binding protein EngA  25.37 
 
 
465 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189601  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06108  GTP-binding protein EngA  25.37 
 
 
465 aa  45.4  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0692336  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3386  GTP-binding protein EngA  37.37 
 
 
442 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  32.97 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2853  tRNA modification GTPase TrmE  30.69 
 
 
419 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0789426 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  25.85 
 
 
374 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  24.18 
 
 
287 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  25.86 
 
 
323 aa  44.7  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1538  GTP-binding protein EngA  24.25 
 
 
516 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000734498 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.46 
 
 
464 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2008  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 
438 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1726  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 
438 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.138722  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1325  GTP-binding protein EngA  38.96 
 
 
511 aa  43.9  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.359502  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1120  GTP-binding protein EngA  38.36 
 
 
488 aa  44.3  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  27.59 
 
 
284 aa  44.3  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_2271  predicted protein  36.49 
 
 
489 aa  44.3  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0857  GTP-binding protein EngA  29.08 
 
 
487 aa  43.5  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  25.73 
 
 
312 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  26.79 
 
 
262 aa  43.5  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  34.06 
 
 
493 aa  43.5  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  37.93 
 
 
271 aa  43.5  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  26.79 
 
 
262 aa  43.5  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0409  GTP-binding protein EngA  29.8 
 
 
460 aa  43.5  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>