72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0424 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  725    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  49.86 
 
 
365 aa  353  2.9999999999999997e-96  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  33.78 
 
 
372 aa  202  7e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  31.73 
 
 
366 aa  189  8e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  30.29 
 
 
372 aa  187  2e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  30.55 
 
 
379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  30.42 
 
 
375 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  32.26 
 
 
368 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  31.3 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  31.3 
 
 
368 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  31.03 
 
 
368 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  31.03 
 
 
368 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  31.03 
 
 
368 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  31.03 
 
 
368 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  31.03 
 
 
368 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  31.03 
 
 
368 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  31.03 
 
 
368 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  28.68 
 
 
401 aa  182  1e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  30.32 
 
 
368 aa  176  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  29.75 
 
 
366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  29.75 
 
 
366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  31.02 
 
 
369 aa  172  7.999999999999999e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  32.96 
 
 
385 aa  171  2e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  29.89 
 
 
370 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  29.23 
 
 
369 aa  166  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  25.07 
 
 
396 aa  160  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  30.62 
 
 
376 aa  150  5e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.17 
 
 
379 aa  139  8.999999999999999e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  24.59 
 
 
363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  27.03 
 
 
365 aa  137  4e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  24.32 
 
 
363 aa  136  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  25.99 
 
 
357 aa  119  6e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  29.36 
 
 
361 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  22.93 
 
 
710 aa  105  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  25.52 
 
 
391 aa  90.1  5e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  21.84 
 
 
401 aa  86.3  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  20.06 
 
 
604 aa  73.2  0.000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  27.51 
 
 
360 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  29.1 
 
 
439 aa  49.3  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  31.03 
 
 
435 aa  47.8  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2016  GTP-binding protein EngA  30.43 
 
 
435 aa  47  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3731  ribosome-associated GTPase EngA  36.36 
 
 
484 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942199  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0764  GTP-binding protein EngA  29.44 
 
 
437 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000517804  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01058  GTP-binding protein EngA  25.9 
 
 
465 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.189601  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06108  GTP-binding protein EngA  25.9 
 
 
465 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0692336  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  29.55 
 
 
597 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1322  small GTP-binding protein domain-containing protein  24.04 
 
 
438 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21511  GTP-binding protein EngA  30.95 
 
 
461 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4247  GTP-binding protein EngA  30.34 
 
 
498 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1775  GTP-binding protein EngA  34.29 
 
 
465 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1711  GTP-binding protein EngA  34.29 
 
 
465 aa  45.1  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.625328  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1701  ribosome-associated GTPase EngA  27.55 
 
 
444 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0307524  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  25.29 
 
 
281 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  30.57 
 
 
379 aa  44.3  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0193  GTP-binding protein EngA  32.86 
 
 
495 aa  44.3  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  36.11 
 
 
441 aa  44.3  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  32.88 
 
 
440 aa  44.3  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1662  GTP-binding protein EngA  26.55 
 
 
465 aa  43.9  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.908743  normal  0.0937106 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  27.43 
 
 
521 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  24.12 
 
 
281 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1498  GTP-binding protein EngA  28.57 
 
 
462 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2390  GTP-binding protein EngA  26.74 
 
 
441 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000149599  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1438  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.93 
 
 
437 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000421865  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1438  GTP-binding protein EngA  39.68 
 
 
471 aa  43.5  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.432419  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1485  GTP-binding protein EngA  30.71 
 
 
462 aa  43.1  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  41.67 
 
 
462 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1160  GTP-binding protein EngA  30.46 
 
 
439 aa  42.7  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0769833  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2263  GTP-binding protein EngA  28.23 
 
 
506 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2131  GTP-binding protein EngA  37.68 
 
 
441 aa  42.7  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000643599  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2045  GTP-binding protein EngA  26.53 
 
 
464 aa  42.7  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl199  GTP-binding protein EngA  34.18 
 
 
435 aa  42.7  0.01  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.316366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1360  small GTP-binding protein  34.78 
 
 
445 aa  42.7  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.508315  hitchhiker  0.00000394324 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>