More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1194 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  100 
 
 
379 aa  755    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  59.84 
 
 
374 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  59.3 
 
 
388 aa  438  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  58.76 
 
 
384 aa  437  1e-121  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  58.22 
 
 
374 aa  431  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0396  GTP-binding protein YlqF  37.94 
 
 
254 aa  144  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.243282  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1645  GTP-binding protein HSR1-related protein  37.27 
 
 
267 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0965414  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3055  GTP-binding protein  35.91 
 
 
258 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.464248 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  30.23 
 
 
268 aa  136  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1931  GTP-binding protein YlqF  36.15 
 
 
265 aa  135  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  31.01 
 
 
259 aa  134  3e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.437741 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  30.92 
 
 
544 aa  131  2.0000000000000002e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  31.78 
 
 
261 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  37.45 
 
 
260 aa  129  6e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  34.73 
 
 
443 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  32.91 
 
 
261 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  33.33 
 
 
256 aa  126  5e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3753  GTP1/OBG protein  31.87 
 
 
276 aa  125  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336118  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  29.75 
 
 
597 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  35.09 
 
 
562 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  28.9 
 
 
521 aa  123  5e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  34.36 
 
 
560 aa  122  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  30.55 
 
 
291 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  32.39 
 
 
534 aa  122  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2401  GTP-binding protein HSR1-related  32.84 
 
 
292 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00457359  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  28.43 
 
 
669 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  32.6 
 
 
296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  29.32 
 
 
292 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3880  ribosomal biogenesis GTPase  32.47 
 
 
296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000579568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3689  ribosomal biogenesis GTPase  32.35 
 
 
296 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0162209  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3597  ribosomal biogenesis GTPase  32.35 
 
 
296 aa  114  3e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00124948  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3851  ribosomal biogenesis GTPase  32.35 
 
 
296 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3976  ribosomal biogenesis GTPase  32.35 
 
 
296 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000127206  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  29.29 
 
 
360 aa  114  3e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3579  ribosomal biogenesis GTPase  31.99 
 
 
296 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000271121  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2490  ribosomal biogenesis GTPase  33.72 
 
 
287 aa  113  6e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000101626  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3885  ribosomal biogenesis GTPase  31.99 
 
 
296 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000521697  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07360  GTP-binding protein HSR1-related  31.43 
 
 
282 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000017476  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1367  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  28.78 
 
 
292 aa  112  8.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1307  ribosomal biogenesis GTPase  31.5 
 
 
296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615833  unclonable  1.55704e-25 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0973  GTP-binding protein YlqF  27.38 
 
 
270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000216329  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  30.22 
 
 
284 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0843  GTP-binding protein HSR1-related  31.56 
 
 
271 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  32.1 
 
 
258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3936  ribosomal biogenesis GTPase  31.5 
 
 
296 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000467955  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0811  ribosomal biogenesis GTPase  32.73 
 
 
287 aa  110  6e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00749287  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  27.37 
 
 
284 aa  110  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  28.3 
 
 
271 aa  109  8.000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
717 aa  109  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  29.2 
 
 
278 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  30.28 
 
 
319 aa  107  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0663  GTP-binding protein, HSR1-related  29.59 
 
 
284 aa  106  7e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.011457  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.34 
 
 
285 aa  105  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  29.55 
 
 
280 aa  105  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1988  ribosomal biogenesis GTPase  29.26 
 
 
288 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0973  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.56 
 
 
282 aa  105  2e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000015477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  30.26 
 
 
283 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  30.55 
 
 
277 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1203  GTP-binding protein HSR1-related  29.74 
 
 
283 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000139155  normal  0.179888 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1204  GTP-binding  28.9 
 
 
305 aa  101  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185511  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1707  GTP-binding protein, HSR1-related  32.03 
 
 
277 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.12169  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  28.41 
 
 
314 aa  100  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1327  ribosomal biogenesis GTPase  31.02 
 
 
294 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.575844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1302  ribosomal biogenesis GTPase  31.02 
 
 
294 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00764479  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  25.71 
 
 
313 aa  99  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  28.48 
 
 
310 aa  98.6  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1785  GTP-binding  29.7 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.417498 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1416  ribosomal biogenesis GTPase  29.24 
 
 
283 aa  97.8  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00443588  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  25.71 
 
 
313 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  25.71 
 
 
313 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  26.07 
 
 
313 aa  97.4  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  26.76 
 
 
313 aa  97.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1354  GTP-binding protein HSR1-related protein  25.47 
 
 
274 aa  97.1  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  26.76 
 
 
313 aa  97.1  5e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  26.76 
 
 
313 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  26.76 
 
 
313 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  26.76 
 
 
313 aa  96.7  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0169  ribosomal biogenesis GTPase  27.88 
 
 
323 aa  96.3  7e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000316145  normal  0.720532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  25.8 
 
 
312 aa  96.3  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1293  GTP-binding protein HSR1-related  33.46 
 
 
280 aa  96.3  8e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000027879  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1013  ribosomal biogenesis GTPase  30.85 
 
 
283 aa  96.3  9e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  26.82 
 
 
307 aa  95.9  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  25.98 
 
 
314 aa  94.7  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  27.1 
 
 
312 aa  94.7  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  25.36 
 
 
312 aa  94.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  26.77 
 
 
281 aa  94  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  25.09 
 
 
313 aa  93.6  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  28.52 
 
 
299 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  29.5 
 
 
314 aa  92.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  26.82 
 
 
314 aa  92.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  33.53 
 
 
281 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  26.88 
 
 
369 aa  92  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_77411  predicted protein  25.39 
 
 
653 aa  91.7  2e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  33.53 
 
 
281 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  24.56 
 
 
313 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  29.67 
 
 
298 aa  90.9  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  29.15 
 
 
317 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  28.52 
 
 
299 aa  91.3  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0663  ribosomal biogenesis GTPase  30.65 
 
 
279 aa  91.3  3e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.5554  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0913  GTPase  30.88 
 
 
279 aa  90.9  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000773459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>