138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2459 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  100 
 
 
370 aa  766    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  79.4 
 
 
369 aa  630  1e-180  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  68.48 
 
 
368 aa  537  1e-151  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  68.48 
 
 
368 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  68.48 
 
 
368 aa  537  1e-151  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  68.48 
 
 
368 aa  537  1e-151  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  68.48 
 
 
368 aa  537  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  68.48 
 
 
368 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  68.21 
 
 
368 aa  534  1e-151  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  68.48 
 
 
368 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  68.21 
 
 
368 aa  534  1e-151  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  68.48 
 
 
368 aa  535  1e-151  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  67.66 
 
 
368 aa  531  1e-150  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  58.27 
 
 
375 aa  449  1e-125  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  56.18 
 
 
372 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  55.91 
 
 
372 aa  435  1e-121  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  49.86 
 
 
366 aa  394  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  50.64 
 
 
401 aa  394  1e-108  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  51.88 
 
 
379 aa  389  1e-107  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  51.51 
 
 
366 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  51.51 
 
 
366 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  47.06 
 
 
369 aa  340  2e-92  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  41.05 
 
 
385 aa  300  2e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  35.37 
 
 
396 aa  260  3e-68  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  34.14 
 
 
363 aa  209  7e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  33.87 
 
 
363 aa  203  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  33.77 
 
 
710 aa  199  7e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  33.24 
 
 
365 aa  196  4.0000000000000005e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  28.95 
 
 
379 aa  170  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  29.02 
 
 
367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  28.61 
 
 
604 aa  160  3e-38  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  29.62 
 
 
357 aa  160  3e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  28.76 
 
 
376 aa  159  6e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  30.1 
 
 
365 aa  157  2e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  30.25 
 
 
361 aa  143  5e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  32.56 
 
 
401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.31 
 
 
391 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  29.48 
 
 
292 aa  57.4  0.0000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  32.24 
 
 
463 aa  53.9  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  24.6 
 
 
597 aa  52.8  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.6 
 
 
316 aa  50.1  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  22.92 
 
 
669 aa  50.1  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3526  GTP-binding protein EngA  31.16 
 
 
494 aa  49.3  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.928011 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  26.58 
 
 
260 aa  49.7  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1098  GTP-binding protein EngA  29.38 
 
 
441 aa  48.9  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  24.84 
 
 
307 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0591  GTP-binding protein EngA  29.3 
 
 
472 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  22.34 
 
 
521 aa  48.9  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3454  tRNA modification GTPase TrmE  40.85 
 
 
429 aa  49.3  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0577  GTP-binding protein EngA  25.89 
 
 
435 aa  48.9  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.416412  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  27.62 
 
 
281 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  24.6 
 
 
360 aa  48.5  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  28.18 
 
 
281 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  25.68 
 
 
544 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  29.27 
 
 
291 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1204  GTP-binding protein EngA  30.67 
 
 
442 aa  47.8  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.109244  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  20 
 
 
281 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2146  GTP-binding protein EngA  32.37 
 
 
493 aa  47.4  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  26.85 
 
 
283 aa  47.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1900  ribosome-associated GTPase  29.5 
 
 
315 aa  47  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.830511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  25.53 
 
 
281 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0790  ribosome small subunit-dependent GTPase A  29.87 
 
 
360 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  27.85 
 
 
261 aa  46.6  0.0008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0600  GTPase EngC  31.03 
 
 
351 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.580491  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3624  tRNA modification GTPase TrmE  37.68 
 
 
455 aa  45.8  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.473452  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0429  tRNA modification GTPase TrmE  42.03 
 
 
462 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  25.32 
 
 
312 aa  45.8  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02231  ribosomal biogenesis GTPase  27.81 
 
 
288 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  29.11 
 
 
313 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2058  ribosome small subunit-dependent GTPase A  27.33 
 
 
319 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.834521  normal  0.0277453 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3528  GTPase EngC  34.09 
 
 
352 aa  45.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.399096 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0351  GTPase EngC  33.6 
 
 
332 aa  44.7  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00346768  normal  0.500342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0392  tRNA modification GTPase TrmE  42.03 
 
 
460 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1438  GTP-binding protein EngA  28.66 
 
 
471 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.432419  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3005  GTP-binding protein EngA  25.73 
 
 
460 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.325  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  28.06 
 
 
271 aa  45.1  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2864  tRNA modification GTPase TrmE  36.59 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.234827 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1018  GTPase  29.55 
 
 
282 aa  44.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.447609  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3587  small GTP-binding protein  33.78 
 
 
495 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.748458  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  28.24 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2667  tRNA modification GTPase TrmE  34.25 
 
 
428 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0398705  normal  0.380735 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2407  tRNA modification GTPase TrmE  38.03 
 
 
433 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  27.39 
 
 
314 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1702  ribosome small subunit-dependent GTPase A  30.83 
 
 
319 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0297  tRNA modification GTPase TrmE  44.93 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1711  GTP-binding protein EngA  26.83 
 
 
465 aa  45.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.625328  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04708  mitochondrial GTPase (YlqF), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G08680)  41.18 
 
 
354 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.378462  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0822  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.16 
 
 
464 aa  44.3  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.460708  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1230  tRNA modification GTPase TrmE  29.25 
 
 
428 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0196  ribosomal biogenesis GTPase  25.28 
 
 
290 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2448  GTP-binding protein EngA  25.85 
 
 
459 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.14966  normal  0.412824 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0003  tRNA modification GTPase TrmE  37.5 
 
 
419 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal  0.940122 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  20.73 
 
 
281 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2891  tRNA modification GTPase TrmE  29.25 
 
 
428 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3661  ribosomal biogenesis GTPase  27.44 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000313796  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1329  GTP-binding protein EngA  38.16 
 
 
443 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  24.85 
 
 
323 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1390  GTP-binding protein EngA  38.16 
 
 
443 aa  44.3  0.004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  26.42 
 
 
439 aa  43.9  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5023  tRNA modification GTPase TrmE  34.44 
 
 
447 aa  43.9  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0584026  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>