87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0079 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  93.94 
 
 		 363 aa  705    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  100 
 
 		 363 aa  741    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  46.15 
 
 		 376 aa  351  1e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  47.53 
 
 		 357 aa  343  2e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  38.25 
 
 		 365 aa  285  9e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  39.46 
 
 		 379 aa  278  7e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  34.5 
 
 		 369 aa  216  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  32.35 
 
 		 366 aa  212  7e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  34.77 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  34.77 
 
 		 366 aa  211  1e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  34.05 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  34.5 
 
 		 372 aa  206  6e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  34.95 
 
 		 372 aa  204  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  32.45 
 
 		 391 aa  203  3e-51  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  33.87 
 
 		 370 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  32.88 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  33.15 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  32.71 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  32.71 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  32.71 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  32.71 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  32.71 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  32.71 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  32.71 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  32.44 
 
 		 368 aa  193  4e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  32.3 
 
 		 396 aa  192  9e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  31.72 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  31.72 
 
 		 368 aa  191  1e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  32.13 
 
 		 401 aa  179  7e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  30.03 
 
 		 368 aa  176  4e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  30.29 
 
 		 385 aa  155  9e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  29.74 
 
 		 365 aa  145  8.000000000000001e-34  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  26.93 
 
 		 710 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  24.04 
 
 		 367 aa  133  5e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  26.32 
 
 		 604 aa  132  6e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  25.33 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  25.32 
 
 		 401 aa  92  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05640  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 		 717 aa  67.8  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30716  nuclear/nucleolar GTP-binding protein 2  29.89 
 
 		 534 aa  60.8  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0409155  normal  0.593065 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01666  nucleolar GTPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G08930)  31.03 
 
 		 560 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0645  GTP-binding protein HSR1-related  35.29 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.112449  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0017  GTP-binding protein HSR1-related  32.32 
 
 		 259 aa  53.9  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.437741 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0186  GTP-binding protein HSR1-related protein  30.82 
 
 		 285 aa  53.9  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  30 
 
 		 443 aa  53.5  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0824  GTP-binding protein, HSR1-related  34.65 
 
 		 261 aa  53.9  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0259  GTP-binding protein YlqF  30.72 
 
 		 384 aa  52  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1339  GTP-binding protein HSR1-related  31.37 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2161  GTP-binding protein, HSR1-related  31.71 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0483  GTP-binding protein, HSR1-related  29.81 
 
 		 258 aa  51.2  0.00003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0579  GTP-binding protein HSR1-related  32.03 
 
 		 388 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.133242 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  29.01 
 
 		 310 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0021  GTP-binding protein, HSR1-related  32.72 
 
 		 261 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25133  predicted protein  28.18 
 
 		 562 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  27.18 
 
 		 521 aa  49.7  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  27.47 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  33.13 
 
 		 260 aa  48.9  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  29.11 
 
 		 271 aa  48.9  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  32.48 
 
 		 379 aa  49.3  0.0001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  28.77 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1049  small GTP-binding protein  31.1 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0648076 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3751  GTP-binding protein EngA  29.3 
 
 		 449 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  25.26 
 
 		 360 aa  47  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  29.46 
 
 		 439 aa  46.6  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0536  putative GTP-binding protein EngA  29.06 
 
 		 473 aa  45.4  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  25.6 
 
 		 281 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1961  ribosomal biogenesis GTPase  25 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.648804  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1679  ribosomal biogenesis GTPase  25 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.607688  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  25.6 
 
 		 281 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  24.14 
 
 		 669 aa  45.8  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0223  small GTP-binding protein  27.62 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294804  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0117  tRNA modification GTPase TrmE  35.63 
 
 		 455 aa  44.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3557  tRNA modification GTPase TrmE  35 
 
 		 462 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  27.27 
 
 		 281 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1234  GTP-binding protein EngA  29.02 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0160  GTP-binding protein, HSR1-related  32.2 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.210718  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0158  GTP-binding protein HSR1-related  32.2 
 
 		 262 aa  44.3  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.844156  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0018  tRNA modification GTPase TrmE  26.42 
 
 		 438 aa  44.3  0.004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0705  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.33 
 
 		 298 aa  44.3  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2409  tRNA modification GTPase TrmE  33.62 
 
 		 460 aa  44.3  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.605137  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  27.81 
 
 		 544 aa  43.9  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1268  GTP-binding protein Era  48.21 
 
 		 287 aa  43.9  0.005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1024  GTP-binding protein EngA  26.37 
 
 		 440 aa  43.5  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.127427  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1833  tRNA modification GTPase TrmE  34.34 
 
 		 431 aa  43.5  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0890064  normal  0.0768704 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1406  GTP-binding protein EngA  26.21 
 
 		 439 aa  43.5  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0340673  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0543  GTPase family protein  27.54 
 
 		 316 aa  43.1  0.007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1344  GTP-binding protein Era  32.76 
 
 		 302 aa  42.7  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000010527  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  27.48 
 
 		 452 aa  42.7  0.01  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>