202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1237 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  100 
 
 		 375 aa  773    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  63.61 
 
 		 372 aa  506  9.999999999999999e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  63.61 
 
 		 372 aa  498  1e-140  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  61.66 
 
 		 379 aa  481  1e-135  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  60 
 
 		 401 aa  477  1e-133  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  58.27 
 
 		 370 aa  449  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  56.33 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  56.33 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  56.33 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  56.33 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  56.33 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  56.33 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  56.33 
 
 		 368 aa  422  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  55.53 
 
 		 368 aa  420  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  56.06 
 
 		 368 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  56.06 
 
 		 368 aa  419  1e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  55.56 
 
 		 369 aa  418  1e-116  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  54.86 
 
 		 368 aa  414  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  52.97 
 
 		 369 aa  401  1e-111  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  44.44 
 
 		 366 aa  334  1e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  43.56 
 
 		 385 aa  328  7e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  45.9 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  45.9 
 
 		 366 aa  327  2.0000000000000001e-88  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  40.1 
 
 		 396 aa  283  5.000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  34.59 
 
 		 363 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  34.58 
 
 		 710 aa  211  1e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  34.05 
 
 		 363 aa  207  2e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.96 
 
 		 379 aa  182  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  30.14 
 
 		 367 aa  178  1e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  30.32 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  28.61 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  27.75 
 
 		 376 aa  159  9e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  28.65 
 
 		 357 aa  150  5e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  30.52 
 
 		 604 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  27.45 
 
 		 361 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  27.91 
 
 		 391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  31 
 
 		 401 aa  122  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0059  GTP-binding protein HSR1-related  30.82 
 
 		 260 aa  61.6  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.800533  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1604  GTP-binding protein, HSR1-related  30.92 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000452633  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2924  HSR1-related GTP-binding protein  29.89 
 
 		 299 aa  54.3  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02636  ribosomal biogenesis GTPase  28.4 
 
 		 323 aa  54.3  0.000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000287  50S ribosomal subunit maturation GTPase RbgA  29.09 
 
 		 314 aa  54.3  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.146408  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3634  ribosomal biogenesis GTPase  29.75 
 
 		 334 aa  53.9  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06087  ribosomal biogenesis GTPase  27.38 
 
 		 314 aa  53.5  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2508  ribosomal biogenesis GTPase  28.48 
 
 		 312 aa  53.5  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0716  GTP1/OBG protein  28.38 
 
 		 292 aa  53.1  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00781144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2029  ribosomal biogenesis GTPase  28.48 
 
 		 312 aa  53.1  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.831437  normal  0.492608 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0461  ribosomal biogenesis GTPase  27.71 
 
 		 314 aa  53.1  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.178573  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  26.34 
 
 		 544 aa  53.1  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1301  GTP-binding protein HSR1-related  29.31 
 
 		 299 aa  52.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000833299 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2638  ribosomal biogenesis GTPase  28.48 
 
 		 312 aa  52.8  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00454653  normal  0.052608 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2120  GTPase  29.75 
 
 		 304 aa  52.8  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1486  ribosomal biogenesis GTPase  27.22 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1172  small GTP-binding protein  30.43 
 
 		 438 aa  50.8  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  23.71 
 
 		 669 aa  50.4  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  30.38 
 
 		 315 aa  50.4  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1554  GTP-binding protein  26.95 
 
 		 281 aa  50.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1349  GTP-binding  30.3 
 
 		 319 aa  50.1  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00974199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1993  ribosomal biogenesis GTPase  31.06 
 
 		 314 aa  49.7  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0543739  normal  0.136959 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2510  GTP-binding protein, HSR1-related  27.27 
 
 		 319 aa  50.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271003  normal  0.0153931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0763  GTP-binding protein YlqF  30.38 
 
 		 291 aa  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000221052  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1350  GTP-binding protein HSR1-related  27.27 
 
 		 319 aa  49.7  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0587703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2306  ribosomal biogenesis GTPase  26.63 
 
 		 313 aa  49.7  0.00008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.575224  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10438  conserved hypothetical protein  19.65 
 
 		 634 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.906693 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1889  ribosomal biogenesis GTPase  27.22 
 
 		 313 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  28.12 
 
 		 360 aa  49.7  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1882  ribosomal biogenesis GTPase  27.22 
 
 		 313 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.140157  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2437  ribosomal biogenesis GTPase  27.22 
 
 		 313 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.743849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1855  ribosomal biogenesis GTPase  27.22 
 
 		 313 aa  49.7  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2892  GTPase family protein  28.42 
 
 		 463 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2474  GTP-binding protein HSR1-related  28.66 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.188866  normal  0.279197 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2395  ribosomal biogenesis GTPase  27.22 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.806942 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2453  ribosomal biogenesis GTPase  29.03 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.643671  normal  0.265294 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2377  ribosomal biogenesis GTPase  30.63 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1859  ribosome small subunit-dependent GTPase A  33.6 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1703  ribosomal biogenesis GTPase  28.87 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2590  ribosomal biogenesis GTPase  27.22 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1982  ribosomal biogenesis GTPase  25 
 
 		 318 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1682  GTP-binding protein HSR1-related  25.75 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  28.16 
 
 		 290 aa  48.9  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2186  ribosomal biogenesis GTPase  27.22 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2263  ribosomal biogenesis GTPase  27.22 
 
 		 313 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1095  ribosomal biogenesis GTPase  28.07 
 
 		 283 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00065113  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34264  predicted protein  27.53 
 
 		 597 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.159227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1752  ribosomal biogenesis GTPase  27.22 
 
 		 313 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2407  tRNA modification GTPase TrmE  40.58 
 
 		 433 aa  48.5  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2108  GTP-binding protein EngA  43.28 
 
 		 443 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000750275  normal  0.342829 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2283  ribosomal biogenesis GTPase  25 
 
 		 318 aa  48.1  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0251974 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2146  GTP-binding protein, HSR1-related  28.18 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2557  ribosomal biogenesis GTPase  25.75 
 
 		 327 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1983  GTP-binding protein EngA  33.33 
 
 		 439 aa  47.4  0.0004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1589  ribosomal biogenesis GTPase  26.45 
 
 		 313 aa  47  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.246818 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0596  GTP-binding protein EngA  35.05 
 
 		 467 aa  47  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.115321  hitchhiker  0.00000000000000451977 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28031  predicted protein  24.05 
 
 		 676 aa  47  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  25 
 
 		 281 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0164  tRNA modification GTPase TrmE  34.78 
 
 		 445 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.364073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  21.99 
 
 		 521 aa  46.6  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0773  GTPases  26.47 
 
 		 280 aa  46.6  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.79834e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0291  tRNA modification GTPase TrmE  38.14 
 
 		 449 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0669  ribosomal biogenesis GTPase  27.74 
 
 		 311 aa  46.2  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.378944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>