97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0841 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_0841  hypothetical protein  100 
 
 		 365 aa  737    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0079  GTP-binding protein, HSR1-related  38.25 
 
 		 363 aa  285  9e-76  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000212587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0079  GTP-binding protein HSR1-related  37.98 
 
 		 363 aa  281  2e-74  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00226262  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1198  GTP-binding protein HSR1-related  37.81 
 
 		 376 aa  249  4e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0797  GTP-binding protein, HSR1-related  37.06 
 
 		 357 aa  249  6e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1822  GTP-binding protein HSR1-related protein  35.79 
 
 		 379 aa  236  5.0000000000000005e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2459  GTP-binding protein YqeH  33.24 
 
 		 370 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0019503  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0992  GTP-binding protein YqeH  32 
 
 		 369 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3061  GTP-binding protein YqeH  31.5 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.844402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4071  GTP-binding protein YqeH  31.68 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0184971  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4233  GTP-binding protein YqeH  31.68 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4081  GTP-binding protein YqeH  31.68 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4357  GTP-binding protein YqeH  31.68 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.701648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4416  GTP-binding protein YqeH  31.68 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4562  GTP-binding protein YqeH  31.68 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4468  GTP-binding protein YqeH  31.68 
 
 		 368 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0923529  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1164  GTP-binding protein YqeH  31.48 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0914946  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4455  GTP-binding protein YqeH  31.41 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4186  GTP-binding protein YqeH  30.87 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0782  GTP-binding protein YqeH  31.41 
 
 		 368 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0185086  hitchhiker  0.000205366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2017  ribosome biogenesis GTPase YqeH  27.94 
 
 		 396 aa  176  8e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0436  GTP-binding protein HSR1-related protein  31.83 
 
 		 391 aa  170  3e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1740  GTP-binding protein YqeH  30.85 
 
 		 379 aa  169  6e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1689  GTP-binding protein YqeH  31.73 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1654  GTP-binding protein YqeH  31.73 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1585  GTP-binding protein YqeH  31.48 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.595212  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0226  GTP-binding protein YqeH  29.01 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0906  GTP-binding protein YqeH  30.03 
 
 		 385 aa  162  7e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.346468  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1664  GTP-binding protein YqeH  30.79 
 
 		 372 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00606929  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1237  GTP-binding protein YqeH  30.32 
 
 		 375 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000896118  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1404  GTP-binding protein YqeH  27.2 
 
 		 369 aa  152  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000143151  hitchhiker  2.51031e-26 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0424  hypothetical protein  26.76 
 
 		 367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00290695  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl351  GTPase  30.27 
 
 		 365 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  4.213e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0525  ribosome biogenesis GTPase YqeH  27.72 
 
 		 361 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.642642  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_49745  predicted protein  28.84 
 
 		 604 aa  103  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.814694  normal  0.848329 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40200  predicted protein  26.33 
 
 		 710 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00209699  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37471  predicted protein  25.12 
 
 		 401 aa  102  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0357188  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2142  ribosomal biogenesis GTPase  25 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27991  ribosomal biogenesis GTPase  25.43 
 
 		 289 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1586  ribosomal biogenesis GTPase  26.9 
 
 		 281 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0128264 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1409  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  29.2 
 
 		 271 aa  53.1  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.421311  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01215  Myosin-related protein homolog MlpA Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UVC7]  29.67 
 
 		 544 aa  53.1  0.000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00107626  normal  0.249209 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1699  small GTP-binding protein  32.14 
 
 		 371 aa  51.6  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.473033  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0919  ribosomal biogenesis GTPase  31.15 
 
 		 284 aa  50.1  0.00006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.294572  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28889  predicted protein  26.7 
 
 		 521 aa  50.1  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.691875  normal  0.346364 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1114  ribosomal biogenesis GTPase  23.98 
 
 		 287 aa  48.9  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.44359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1848  small GTP-binding protein  30.56 
 
 		 371 aa  48.9  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33865  predicted protein  23.29 
 
 		 369 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.837548 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4089  ribosomal biogenesis GTPase  23.78 
 
 		 281 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1194  GTP-binding protein HSR1-related  30.43 
 
 		 379 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2458  ribosomal biogenesis GTPase  24.36 
 
 		 288 aa  47.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01210  conserved hypothetical protein  23.53 
 
 		 669 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  36.51 
 
 		 662 aa  47  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4128  ribosomal biogenesis GTPase  22.56 
 
 		 281 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04795  GTP-binding protein EngA  23.53 
 
 		 434 aa  46.6  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1490  GTP-binding protein  25.42 
 
 		 278 aa  46.2  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000659617  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_2182  predicted protein  27.81 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0661  Fe2+ transport system protein B-like protein  42.11 
 
 		 601 aa  45.4  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_35887  predicted protein  43.08 
 
 		 664 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3374  ribosomal biogenesis GTPase  23.17 
 
 		 285 aa  44.7  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2546  small GTP-binding protein  29.36 
 
 		 370 aa  45.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.120198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2048  GTP-binding protein, HSR1-related  25.82 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000391161  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0683  GTP-binding protein Era  33.87 
 
 		 310 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl538  GTPase  26.16 
 
 		 315 aa  44.7  0.003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000607031  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1400  hypothetical protein  31.53 
 
 		 370 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0773  ferrous iron transport protein B  37.29 
 
 		 665 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0789  small GTP-binding protein  36.84 
 
 		 443 aa  44.3  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000826073  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5165  tRNA modification GTPase TrmE  36.17 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5337  tRNA modification GTPase TrmE  36.17 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5594  tRNA modification GTPase TrmE  36.17 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0320926 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5181  tRNA modification GTPase TrmE  36.17 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0853003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5635  tRNA modification GTPase TrmE  36.17 
 
 		 458 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5277  tRNA modification GTPase TrmE  36.17 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5734  tRNA modification GTPase TrmE  36.17 
 
 		 458 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5671  tRNA modification GTPase TrmE  36.17 
 
 		 458 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0819  tRNA modification GTPase TrmE  31.43 
 
 		 452 aa  43.9  0.004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0801  small GTP-binding protein  35.14 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.911521  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  38.98 
 
 		 664 aa  43.5  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42327  predicted protein  27.91 
 
 		 443 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.812568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0776  GTP-binding protein YlqF  25.29 
 
 		 290 aa  43.9  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.119569  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0838  ribosome biogenesis GTP-binding protein YlqF  24.69 
 
 		 293 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2233  GTP-binding protein Era  39.71 
 
 		 319 aa  43.5  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.085201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2550  GTP-binding protein Era  33.82 
 
 		 326 aa  43.5  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.512596  normal  0.0657743 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1013  ribosomal biogenesis GTPase  34.43 
 
 		 283 aa  43.5  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.132908  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1068  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.34 
 
 		 649 aa  43.1  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.857406  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2275  GTP-binding protein Era  33.82 
 
 		 326 aa  43.5  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0826196 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0392  GTP-binding protein EngA  31.91 
 
 		 494 aa  43.1  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0196  ribosomal biogenesis GTPase  21.64 
 
 		 290 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1152  GTP-binding protein Era  33.87 
 
 		 313 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1227  GTP-binding protein HSR1-related  24.85 
 
 		 279 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.240539  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1054  ribosomal biogenesis GTPase  27.27 
 
 		 315 aa  43.1  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0999  GTP-binding protein Era  33.87 
 
 		 313 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17106  normal  0.215056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1075  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.18 
 
 		 206 aa  43.1  0.008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.550394 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1018  GTPase  29.7 
 
 		 282 aa  43.1  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.447609  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2599  tRNA modification GTPase TrmE  39.66 
 
 		 437 aa  42.7  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.157289 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2547  tRNA modification GTPase TrmE  38.36 
 
 		 455 aa  42.7  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5298  tRNA modification GTPase TrmE  38.57 
 
 		 471 aa  42.7  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.414752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>