More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0661 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0661  Fe2+ transport system protein B-like protein  100 
 
 
601 aa  1191    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  30 
 
 
571 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0773  ferrous iron transport protein B  30.05 
 
 
665 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  29.55 
 
 
662 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1139  small GTP-binding protein  28.25 
 
 
610 aa  254  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13350  ferrous iron transport protein FeoB  30.81 
 
 
616 aa  253  1e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00495766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2467  ferrous iron transport protein B  30.67 
 
 
657 aa  253  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000331593  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1293  small GTP-binding protein  28.27 
 
 
576 aa  252  2e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0042575  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  30.39 
 
 
664 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0648  small GTP-binding protein  30.11 
 
 
650 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1503  ferrous iron transport protein B, putative  28.27 
 
 
576 aa  250  5e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111914  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1380  ferrous iron transport protein B  30.2 
 
 
663 aa  249  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  29.59 
 
 
654 aa  249  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05070  Ferrous iron transporter protein FeoB  29.63 
 
 
607 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000363083  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2489  small GTP-binding protein  29.81 
 
 
571 aa  248  2e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1277  Fe2+ transport system protein B  27.96 
 
 
576 aa  247  4e-64  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000691258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  28.64 
 
 
663 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1872  ferrous iron transport protein B  30.12 
 
 
658 aa  243  7e-63  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0703  small GTP-binding protein  28.46 
 
 
572 aa  233  8.000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.313338  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1565  small GTP-binding protein domain-containing protein  29.58 
 
 
688 aa  228  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  26.51 
 
 
657 aa  226  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1460  small GTP-binding protein  28.71 
 
 
634 aa  225  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1068  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.34 
 
 
649 aa  224  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.857406  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0661  small GTP-binding protein  29.47 
 
 
661 aa  223  7e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.252074  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2299  small GTP-binding protein  29.13 
 
 
688 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00736056  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1550  small GTP-binding protein  28.64 
 
 
663 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000411502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2387  small GTP-binding protein  29.13 
 
 
688 aa  222  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.723257  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0589  ferrous iron transport protein B  29.64 
 
 
637 aa  222  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  29.46 
 
 
607 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0385  hypothetical protein  28.5 
 
 
624 aa  217  5e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1182  small GTP-binding protein domain-containing protein  30.12 
 
 
614 aa  217  5.9999999999999996e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0979811  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0529  small GTP-binding protein  28.38 
 
 
587 aa  211  4e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1563  small GTP-binding protein  29.67 
 
 
607 aa  210  5e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.657781  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1654  small GTP-binding protein  28.53 
 
 
659 aa  205  2e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000471814  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1713  ferrous iron transport protein B  28.68 
 
 
645 aa  193  7e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.340113  normal  0.969498 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  27.1 
 
 
662 aa  192  1e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0198  ferrous iron transport protein B  27.47 
 
 
645 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1194  GTP-binding protein HSR1-related  26.49 
 
 
606 aa  189  1e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  28.04 
 
 
680 aa  189  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  28.02 
 
 
631 aa  189  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0467  ferrous iron transport protein B  28.9 
 
 
623 aa  189  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0719  ferrous iron transport protein B  27.79 
 
 
829 aa  185  2.0000000000000003e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0311256  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1784  GTP-binding protein, HSR1-related  28.12 
 
 
616 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0114  GTP-binding protein HSR1-related  27.77 
 
 
619 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  29.06 
 
 
713 aa  184  6e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0735  ferrous iron transport protein B  28.05 
 
 
648 aa  183  1e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.56734  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  28.27 
 
 
587 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  24.96 
 
 
647 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  28.46 
 
 
662 aa  181  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  28.08 
 
 
587 aa  181  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  27.38 
 
 
662 aa  180  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  25.66 
 
 
646 aa  179  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  28.22 
 
 
662 aa  179  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0637  ferrous iron transport protein B  26.48 
 
 
739 aa  179  1e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000736261  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  27.38 
 
 
662 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  25.88 
 
 
647 aa  179  2e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  28.52 
 
 
662 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  28.41 
 
 
662 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2524  ferrous iron transport protein B  28.36 
 
 
766 aa  179  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  25.59 
 
 
665 aa  179  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2152  ferrous iron transport protein B  28.36 
 
 
782 aa  178  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.264076  hitchhiker  0.0000442692 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  28.52 
 
 
662 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  28.52 
 
 
662 aa  177  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  28.52 
 
 
662 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  27.58 
 
 
666 aa  177  7e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  28.33 
 
 
662 aa  177  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  28.03 
 
 
741 aa  177  7e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  26.89 
 
 
662 aa  176  8e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  24.85 
 
 
647 aa  176  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  25.52 
 
 
631 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  27.83 
 
 
606 aa  175  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  28 
 
 
776 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1729  ferrous iron transport protein B  26.32 
 
 
717 aa  174  2.9999999999999996e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000105992  normal  0.0580785 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  28.2 
 
 
778 aa  174  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  25.69 
 
 
666 aa  173  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  27.04 
 
 
676 aa  172  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  27.7 
 
 
649 aa  172  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  28.62 
 
 
848 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  26.96 
 
 
728 aa  172  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  28.63 
 
 
740 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  26.73 
 
 
741 aa  171  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0901  ferrous iron transport protein B  27.63 
 
 
708 aa  171  4e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000608812  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1841  ferrous iron transport protein B  26.85 
 
 
769 aa  170  6e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.547404  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0784  ferrous iron transport protein B  25.66 
 
 
711 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.155196 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  28.91 
 
 
740 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  26.72 
 
 
786 aa  169  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  26.21 
 
 
747 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  26.88 
 
 
778 aa  168  2.9999999999999998e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2779  small GTP-binding protein  25.67 
 
 
620 aa  168  2.9999999999999998e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  27.15 
 
 
766 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  27.34 
 
 
766 aa  167  4e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  26.97 
 
 
668 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16120  ferrous iron transporter FeoB  26.46 
 
 
785 aa  166  1.0000000000000001e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000453744 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  27.7 
 
 
774 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  26.07 
 
 
743 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  26.87 
 
 
716 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  27.24 
 
 
778 aa  164  3e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  25.05 
 
 
732 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  24.23 
 
 
665 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1429  ferrous iron transport protein B  28.81 
 
 
697 aa  164  4.0000000000000004e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000934837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>