More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1293 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1503  ferrous iron transport protein B, putative  99.31 
 
 		 576 aa  1141    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111914  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1293  small GTP-binding protein  100 
 
 		 576 aa  1149    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0042575  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1277  Fe2+ transport system protein B  94.44 
 
 		 576 aa  1092    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000691258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1139  small GTP-binding protein  53.14 
 
 		 610 aa  632  1e-180  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05070  Ferrous iron transporter protein FeoB  50.52 
 
 		 607 aa  597  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000363083  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2489  small GTP-binding protein  52.08 
 
 		 571 aa  587  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  47.49 
 
 		 571 aa  560  1e-158  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0529  small GTP-binding protein  50.43 
 
 		 587 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0703  small GTP-binding protein  46.27 
 
 		 572 aa  523  1e-147  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.313338  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1073  small GTP-binding protein  38.16 
 
 		 650 aa  399  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1194  GTP-binding protein HSR1-related  34.05 
 
 		 606 aa  347  3e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13350  ferrous iron transport protein FeoB  34.24 
 
 		 616 aa  339  7e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00495766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2779  small GTP-binding protein  34.35 
 
 		 620 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1872  ferrous iron transport protein B  33.81 
 
 		 658 aa  316  6e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  32.31 
 
 		 607 aa  312  1e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1550  small GTP-binding protein  32.85 
 
 		 663 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000411502  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0661  small GTP-binding protein  31.28 
 
 		 661 aa  300  7e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.252074  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1182  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.85 
 
 		 614 aa  288  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0979811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1460  small GTP-binding protein  32.48 
 
 		 634 aa  288  2e-76  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1784  GTP-binding protein, HSR1-related  32.27 
 
 		 616 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0589  ferrous iron transport protein B  33.38 
 
 		 637 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0648  small GTP-binding protein  32.47 
 
 		 650 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1654  small GTP-binding protein  31.43 
 
 		 659 aa  280  7e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000471814  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1563  small GTP-binding protein  29.79 
 
 		 607 aa  276  5e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.657781  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  31.05 
 
 		 663 aa  274  3e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  30.75 
 
 		 663 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  30.64 
 
 		 662 aa  273  7e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2299  small GTP-binding protein  30.6 
 
 		 688 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00736056  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0467  ferrous iron transport protein B  31.9 
 
 		 623 aa  272  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0114  GTP-binding protein HSR1-related  31.09 
 
 		 619 aa  272  1e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2387  small GTP-binding protein  30.39 
 
 		 688 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.723257  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  30.59 
 
 		 663 aa  269  8.999999999999999e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2467  ferrous iron transport protein B  30.3 
 
 		 657 aa  269  1e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000331593  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1380  ferrous iron transport protein B  30.18 
 
 		 663 aa  259  8e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  30.71 
 
 		 662 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0385  hypothetical protein  31.04 
 
 		 624 aa  252  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  29.14 
 
 		 664 aa  251  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2250  small GTP-binding protein  29.39 
 
 		 689 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.633777 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  29.77 
 
 		 654 aa  240  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1565  small GTP-binding protein domain-containing protein  28.96 
 
 		 688 aa  233  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  33.33 
 
 		 676 aa  216  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  29.04 
 
 		 587 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  28.67 
 
 		 587 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  28.66 
 
 		 631 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  28.24 
 
 		 668 aa  208  2e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  28.34 
 
 		 646 aa  208  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  28.47 
 
 		 776 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  29.18 
 
 		 647 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  29.46 
 
 		 647 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  29.14 
 
 		 774 aa  207  5e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1068  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.08 
 
 		 649 aa  206  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.857406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  27.61 
 
 		 688 aa  204  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  27.54 
 
 		 783 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  39.13 
 
 		 657 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  28.48 
 
 		 631 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  27.25 
 
 		 665 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1076  ferrous iron transport B-like  32.21 
 
 		 487 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  28.31 
 
 		 647 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  27.31 
 
 		 669 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2809  ferrous iron transport protein B  29.03 
 
 		 597 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.123024 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  28.9 
 
 		 664 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  30.31 
 
 		 786 aa  194  3e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  28.36 
 
 		 715 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0654  ferrous iron transport protein B  31.09 
 
 		 693 aa  190  5e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  29.11 
 
 		 649 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  26.44 
 
 		 669 aa  190  7e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  28.57 
 
 		 753 aa  189  1e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2572  ferrous iron transport protein B  28.23 
 
 		 764 aa  188  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.148151  normal  0.0102392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2670  ferrous iron transport protein B  29.1 
 
 		 764 aa  187  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.360786  normal  0.0737302 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  28.7 
 
 		 778 aa  186  8e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1784  ferrous iron transport protein B  28.41 
 
 		 764 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2878  ferrous iron transport protein B  26.7 
 
 		 606 aa  184  3e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0506695 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  27.99 
 
 		 664 aa  182  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2504  ferrous iron transport protein B  28.91 
 
 		 764 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00112841  hitchhiker  0.00221536 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0661  Fe2+ transport system protein B-like protein  26.75 
 
 		 601 aa  180  5.999999999999999e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  25.97 
 
 		 664 aa  180  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  25.97 
 
 		 664 aa  180  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1597  GTP-binding protein HSR1-related  25.28 
 
 		 617 aa  177  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  26.29 
 
 		 665 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1078  ferrous iron transport protein B  31.15 
 
 		 665 aa  176  7e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.996842  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2849  ferrous iron transport protein B  31.42 
 
 		 618 aa  176  8e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0773  ferrous iron transport protein B  31.73 
 
 		 665 aa  176  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2434  ferrous iron transport protein B  27.19 
 
 		 711 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0984425  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  26.39 
 
 		 716 aa  174  5e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3875  ferrous iron transport protein B  29.22 
 
 		 772 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  28.38 
 
 		 676 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1804  ferrous iron transport protein B  30.49 
 
 		 621 aa  172  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.529813  normal  0.0419932 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1709  ferrous iron transport protein B  28.12 
 
 		 618 aa  172  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3707  ferrous iron transport protein B  29.22 
 
 		 772 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1860  ferrous iron transport protein B  29.98 
 
 		 617 aa  171  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3383  ferrous iron transport protein B  28.63 
 
 		 683 aa  171  4e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.378196 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2451  ferrous iron transport protein B  30.81 
 
 		 621 aa  171  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3704  ferrous iron transport protein B  30 
 
 		 772 aa  170  8e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  28.55 
 
 		 747 aa  169  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  25.71 
 
 		 667 aa  169  1e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3779  ferrous iron transport protein B  29.05 
 
 		 772 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3813  ferrous iron transport protein B  29.05 
 
 		 772 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1922  ferrous iron transport protein B  30.18 
 
 		 617 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05920  Ferrous iron transport protein FeoB  28.37 
 
 		 480 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000073202  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  28.07 
 
 		 766 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>