More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1068 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1068  small GTP-binding protein domain-containing protein  100 
 
 
649 aa  1288    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.857406  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3531  small GTP-binding protein  70.55 
 
 
654 aa  846    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.000000246563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2250  small GTP-binding protein  46.28 
 
 
689 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.633777 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2387  small GTP-binding protein  46.29 
 
 
688 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.723257  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2299  small GTP-binding protein  46.29 
 
 
688 aa  531  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00736056  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1565  small GTP-binding protein domain-containing protein  45.02 
 
 
688 aa  525  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  43.79 
 
 
654 aa  512  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  43.43 
 
 
662 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1380  ferrous iron transport protein B  43.88 
 
 
663 aa  499  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  42.53 
 
 
664 aa  496  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  42.97 
 
 
663 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2467  ferrous iron transport protein B  43.36 
 
 
657 aa  488  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000331593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  42.81 
 
 
663 aa  485  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  42.68 
 
 
663 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13350  ferrous iron transport protein FeoB  39.94 
 
 
616 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00495766  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0661  small GTP-binding protein  41.1 
 
 
661 aa  456  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.252074  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0773  ferrous iron transport protein B  39.69 
 
 
665 aa  437  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1550  small GTP-binding protein  39.63 
 
 
663 aa  424  1e-117  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000411502  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1182  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.76 
 
 
614 aa  408  1.0000000000000001e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0979811  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0648  small GTP-binding protein  39.56 
 
 
650 aa  405  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  36.45 
 
 
607 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1654  small GTP-binding protein  36.91 
 
 
659 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000471814  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1563  small GTP-binding protein  35.08 
 
 
607 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.657781  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1460  small GTP-binding protein  39.12 
 
 
634 aa  364  3e-99  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1076  ferrous iron transport B-like  41.67 
 
 
487 aa  340  5e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05920  Ferrous iron transport protein FeoB  34.74 
 
 
480 aa  318  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000073202  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1800  Ferrous iron transport B domain protein  39.96 
 
 
488 aa  310  5.9999999999999995e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1828  nucleoside recognition domain protein  39.75 
 
 
488 aa  306  9.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2489  small GTP-binding protein  30.65 
 
 
571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0703  small GTP-binding protein  30.88 
 
 
572 aa  273  9e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.313338  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1872  ferrous iron transport protein B  31.33 
 
 
658 aa  271  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0467  ferrous iron transport protein B  32.61 
 
 
623 aa  268  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1784  GTP-binding protein, HSR1-related  31.6 
 
 
616 aa  261  3e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1194  GTP-binding protein HSR1-related  30.24 
 
 
606 aa  260  5.0000000000000005e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  28.38 
 
 
657 aa  259  9e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  29.93 
 
 
662 aa  259  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  30.4 
 
 
680 aa  254  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0589  ferrous iron transport protein B  31.46 
 
 
637 aa  249  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2779  small GTP-binding protein  29.17 
 
 
620 aa  247  4.9999999999999997e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  27.47 
 
 
662 aa  244  3e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  28.01 
 
 
647 aa  244  5e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  28.21 
 
 
665 aa  244  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  28.16 
 
 
647 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  28.46 
 
 
647 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0198  ferrous iron transport protein B  28.59 
 
 
645 aa  242  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  27.93 
 
 
664 aa  242  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  28.12 
 
 
646 aa  241  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  27.93 
 
 
664 aa  242  2e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  26.86 
 
 
662 aa  238  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  33.64 
 
 
776 aa  238  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  27.17 
 
 
662 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  27.51 
 
 
662 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  27.17 
 
 
662 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  27.17 
 
 
662 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  27.2 
 
 
662 aa  235  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  27.48 
 
 
662 aa  234  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  26.86 
 
 
662 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1713  ferrous iron transport protein B  27.87 
 
 
645 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.340113  normal  0.969498 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  29.73 
 
 
665 aa  234  5e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  27.37 
 
 
662 aa  234  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  29.06 
 
 
664 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  26.86 
 
 
662 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0114  GTP-binding protein HSR1-related  27.37 
 
 
619 aa  232  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  29.14 
 
 
848 aa  231  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0385  hypothetical protein  28.9 
 
 
624 aa  229  1e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  31.52 
 
 
688 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  28.68 
 
 
676 aa  225  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  26.26 
 
 
669 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  32.95 
 
 
770 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  26.33 
 
 
664 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  31.38 
 
 
676 aa  221  3e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1553  small GTP-binding protein  28.52 
 
 
822 aa  221  3.9999999999999997e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00130117  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  29.78 
 
 
668 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  33.14 
 
 
770 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  26.62 
 
 
669 aa  220  6e-56  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  29.74 
 
 
783 aa  220  7e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  30.49 
 
 
720 aa  219  8.999999999999998e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  31.89 
 
 
774 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  30.34 
 
 
649 aa  219  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  29.11 
 
 
716 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  32.53 
 
 
741 aa  218  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0735  ferrous iron transport protein B  28.1 
 
 
648 aa  218  4e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.56734  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  32.46 
 
 
774 aa  217  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  31.52 
 
 
786 aa  217  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  29.55 
 
 
666 aa  217  7e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  29.26 
 
 
662 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  29.4 
 
 
666 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3029  small GTP-binding protein  29.64 
 
 
635 aa  215  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.690914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  30.41 
 
 
747 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2517  ferrous iron transport protein B  32.21 
 
 
764 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.487661  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  30.46 
 
 
743 aa  214  3.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  29.18 
 
 
691 aa  214  4.9999999999999996e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  27.41 
 
 
667 aa  214  5.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  27.41 
 
 
669 aa  213  7.999999999999999e-54  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2414  ferrous iron transport protein B  32.03 
 
 
772 aa  212  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  32.41 
 
 
740 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  32.04 
 
 
740 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  29.55 
 
 
786 aa  211  5e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  32.37 
 
 
728 aa  210  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  27.75 
 
 
712 aa  209  1e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>