More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1460 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1460  small GTP-binding protein  100 
 
 
634 aa  1244    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13350  ferrous iron transport protein FeoB  46.06 
 
 
616 aa  552  1e-156  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00495766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  43.95 
 
 
607 aa  534  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0661  small GTP-binding protein  44.9 
 
 
661 aa  525  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.252074  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1654  small GTP-binding protein  44.72 
 
 
659 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000471814  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1550  small GTP-binding protein  44.48 
 
 
663 aa  496  1e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000411502  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1563  small GTP-binding protein  41.71 
 
 
607 aa  487  1e-136  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.657781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1182  small GTP-binding protein domain-containing protein  44.62 
 
 
614 aa  478  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0979811  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0648  small GTP-binding protein  45.05 
 
 
650 aa  468  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  36.73 
 
 
664 aa  386  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1380  ferrous iron transport protein B  36.92 
 
 
663 aa  375  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  36.12 
 
 
663 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  35.7 
 
 
662 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  37.69 
 
 
654 aa  366  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1068  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.12 
 
 
649 aa  363  6e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.857406  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2467  ferrous iron transport protein B  35.82 
 
 
657 aa  363  7.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000331593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0773  ferrous iron transport protein B  34.98 
 
 
665 aa  361  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3531  small GTP-binding protein  40.71 
 
 
654 aa  361  3e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.000000246563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2250  small GTP-binding protein  37.69 
 
 
689 aa  353  4e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.633777 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2387  small GTP-binding protein  36.83 
 
 
688 aa  350  3e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.723257  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2299  small GTP-binding protein  36.5 
 
 
688 aa  350  5e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00736056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  35.06 
 
 
663 aa  349  1e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1565  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.71 
 
 
688 aa  348  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  34.7 
 
 
663 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05070  Ferrous iron transporter protein FeoB  33.72 
 
 
607 aa  320  7e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000363083  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0703  small GTP-binding protein  33.88 
 
 
572 aa  302  1e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.313338  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1277  Fe2+ transport system protein B  33.33 
 
 
576 aa  299  9e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000691258  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1503  ferrous iron transport protein B, putative  32.8 
 
 
576 aa  298  2e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111914  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1139  small GTP-binding protein  33.97 
 
 
610 aa  297  5e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1293  small GTP-binding protein  32.48 
 
 
576 aa  296  1e-78  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0042575  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2489  small GTP-binding protein  34.38 
 
 
571 aa  293  6e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.47 
 
 
571 aa  292  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0385  hypothetical protein  30.83 
 
 
624 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1872  ferrous iron transport protein B  31.26 
 
 
658 aa  279  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0529  small GTP-binding protein  35.85 
 
 
587 aa  276  9e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1194  GTP-binding protein HSR1-related  30.03 
 
 
606 aa  273  8.000000000000001e-72  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0467  ferrous iron transport protein B  31.3 
 
 
623 aa  271  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  31.09 
 
 
662 aa  268  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2779  small GTP-binding protein  30.89 
 
 
620 aa  265  2e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1784  GTP-binding protein, HSR1-related  32.69 
 
 
616 aa  263  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05920  Ferrous iron transport protein FeoB  35.47 
 
 
480 aa  260  5.0000000000000005e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000073202  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1076  ferrous iron transport B-like  37.32 
 
 
487 aa  249  1e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  28.49 
 
 
657 aa  244  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1073  small GTP-binding protein  28.48 
 
 
650 aa  239  2e-61  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0589  ferrous iron transport protein B  29.45 
 
 
637 aa  237  4e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0114  GTP-binding protein HSR1-related  29.28 
 
 
619 aa  236  1.0000000000000001e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3029  small GTP-binding protein  29.97 
 
 
635 aa  236  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.690914 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1800  Ferrous iron transport B domain protein  31.85 
 
 
488 aa  231  3e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  28.15 
 
 
587 aa  231  4e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  27.99 
 
 
587 aa  230  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1828  nucleoside recognition domain protein  31.65 
 
 
488 aa  227  5.0000000000000005e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  29.46 
 
 
848 aa  223  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  27.88 
 
 
647 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  27.1 
 
 
647 aa  220  7.999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0198  ferrous iron transport protein B  26.93 
 
 
645 aa  218  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  32.73 
 
 
741 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  26.85 
 
 
647 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  28.96 
 
 
665 aa  218  4e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  32.91 
 
 
740 aa  218  4e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  32.97 
 
 
740 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  31.85 
 
 
778 aa  216  9.999999999999999e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1713  ferrous iron transport protein B  26.2 
 
 
645 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.340113  normal  0.969498 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  29.33 
 
 
664 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  28.9 
 
 
662 aa  212  2e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  27.89 
 
 
665 aa  212  2e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0661  Fe2+ transport system protein B-like protein  27.69 
 
 
601 aa  211  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  27.16 
 
 
631 aa  211  5e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  30.51 
 
 
680 aa  210  6e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  33.27 
 
 
786 aa  210  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  28.46 
 
 
662 aa  208  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2584  ferrous iron transporter B  29.95 
 
 
751 aa  208  2e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  28.9 
 
 
662 aa  209  2e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2711  ferrous iron transporter B  30 
 
 
751 aa  208  3e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  28.77 
 
 
662 aa  207  4e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  29.23 
 
 
662 aa  207  6e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  28.68 
 
 
662 aa  207  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  28.75 
 
 
662 aa  207  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  28.75 
 
 
662 aa  206  7e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  28.75 
 
 
662 aa  207  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  28.75 
 
 
662 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  28.46 
 
 
662 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  24.64 
 
 
646 aa  205  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  29.29 
 
 
666 aa  205  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  29.3 
 
 
666 aa  205  3e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  30.2 
 
 
669 aa  203  6e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  30.32 
 
 
669 aa  203  9e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56680  ferrous iron transport protein B  31.81 
 
 
766 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  31.88 
 
 
774 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  26.98 
 
 
691 aa  201  3e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  32.03 
 
 
776 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4929  ferrous iron transport protein B  31.35 
 
 
766 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  31.36 
 
 
728 aa  200  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  30.47 
 
 
783 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1841  ferrous iron transport protein B  29.67 
 
 
769 aa  199  2.0000000000000003e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.547404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3122  ferrous iron transport protein B  30.97 
 
 
764 aa  198  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000440223 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  28.8 
 
 
786 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  28 
 
 
716 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0239  ferrous iron transport protein B  30.19 
 
 
816 aa  197  4.0000000000000005e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  26.66 
 
 
784 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  27.25 
 
 
662 aa  196  7e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>