More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1588 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1380  ferrous iron transport protein B  76.32 
 
 		 663 aa  1009    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  96.53 
 
 		 663 aa  1292    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  76.32 
 
 		 662 aa  1026    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2467  ferrous iron transport protein B  72.36 
 
 		 657 aa  927    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000331593  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  63.35 
 
 		 654 aa  833    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  76.47 
 
 		 663 aa  1021    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  100 
 
 		 663 aa  1332    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  55.25 
 
 		 664 aa  737    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0773  ferrous iron transport protein B  72.62 
 
 		 665 aa  953    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2299  small GTP-binding protein  44.13 
 
 		 688 aa  529  1e-149  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00736056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2387  small GTP-binding protein  43.98 
 
 		 688 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.723257  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2250  small GTP-binding protein  43.22 
 
 		 689 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.633777 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1565  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.46 
 
 		 688 aa  513  1e-144  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1068  small GTP-binding protein domain-containing protein  42.81 
 
 		 649 aa  474  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.857406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1076  ferrous iron transport B-like  49.68 
 
 		 487 aa  462  1e-129  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1800  Ferrous iron transport B domain protein  51.74 
 
 		 488 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1828  nucleoside recognition domain protein  51.52 
 
 		 488 aa  441  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13350  ferrous iron transport protein FeoB  40.97 
 
 		 616 aa  438  1e-121  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00495766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  38.89 
 
 		 607 aa  432  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1550  small GTP-binding protein  39.53 
 
 		 663 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000411502  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05920  Ferrous iron transport protein FeoB  44.64 
 
 		 480 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000073202  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0661  small GTP-binding protein  39.04 
 
 		 661 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.252074  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3531  small GTP-binding protein  41.86 
 
 		 654 aa  415  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.000000246563  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1654  small GTP-binding protein  38.19 
 
 		 659 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000471814  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1182  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.91 
 
 		 614 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0979811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0648  small GTP-binding protein  38.91 
 
 		 650 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1563  small GTP-binding protein  36.38 
 
 		 607 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.657781  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1460  small GTP-binding protein  34.81 
 
 		 634 aa  328  3e-88  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0703  small GTP-binding protein  33.12 
 
 		 572 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.313338  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.36 
 
 		 571 aa  299  9e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1872  ferrous iron transport protein B  33.44 
 
 		 658 aa  291  3e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1784  GTP-binding protein, HSR1-related  34.15 
 
 		 616 aa  280  8e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0467  ferrous iron transport protein B  31.1 
 
 		 623 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_002936  DET1503  ferrous iron transport protein B, putative  31.35 
 
 		 576 aa  275  3e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111914  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1293  small GTP-binding protein  31.05 
 
 		 576 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0042575  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1194  GTP-binding protein HSR1-related  30.35 
 
 		 606 aa  269  1e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0114  GTP-binding protein HSR1-related  30.82 
 
 		 619 aa  269  1e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  29.88 
 
 		 662 aa  267  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0589  ferrous iron transport protein B  32.21 
 
 		 637 aa  266  1e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0385  hypothetical protein  31.76 
 
 		 624 aa  264  3e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  29.14 
 
 		 657 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  28.87 
 
 		 680 aa  260  6e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  30.06 
 
 		 646 aa  257  5e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  30.91 
 
 		 776 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2779  small GTP-binding protein  29.75 
 
 		 620 aa  254  4.0000000000000004e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  30.76 
 
 		 741 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  30.32 
 
 		 669 aa  251  3e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  32.19 
 
 		 786 aa  251  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  29.19 
 
 		 669 aa  251  4e-65  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3658  ferrous iron transport protein B  30.6 
 
 		 741 aa  249  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  29.78 
 
 		 647 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  29.46 
 
 		 647 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  29.46 
 
 		 647 aa  248  4e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  28.55 
 
 		 666 aa  247  4e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  31.57 
 
 		 770 aa  247  4e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  30.28 
 
 		 783 aa  247  4.9999999999999997e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  32.68 
 
 		 774 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  30.5 
 
 		 676 aa  245  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  30.94 
 
 		 774 aa  244  3e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  29.48 
 
 		 665 aa  243  6e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  31.74 
 
 		 770 aa  243  9e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1073  small GTP-binding protein  27.93 
 
 		 650 aa  243  1e-62  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  31.98 
 
 		 720 aa  241  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  28.46 
 
 		 662 aa  240  5e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  30.13 
 
 		 740 aa  240  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0107  ferrous iron transport protein B  31.49 
 
 		 778 aa  239  1e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.803376  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  28.94 
 
 		 743 aa  239  1e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  28.31 
 
 		 662 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  28.31 
 
 		 662 aa  238  2e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  28.31 
 
 		 662 aa  238  2e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  28.31 
 
 		 662 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  29.46 
 
 		 786 aa  237  5.0000000000000005e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  30.25 
 
 		 740 aa  237  6e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  28.85 
 
 		 712 aa  237  7e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  30.39 
 
 		 676 aa  236  8e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  29.65 
 
 		 738 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  30.1 
 
 		 747 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  28.15 
 
 		 662 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  28.2 
 
 		 662 aa  236  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0169  ferrous iron transport protein B  29.26 
 
 		 778 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  29.94 
 
 		 666 aa  235  2.0000000000000002e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  28.09 
 
 		 662 aa  234  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  28.93 
 
 		 713 aa  233  6e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  28 
 
 		 662 aa  233  9e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  28.13 
 
 		 662 aa  233  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  29.82 
 
 		 716 aa  233  1e-59  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  30.51 
 
 		 749 aa  232  2e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  27.75 
 
 		 662 aa  232  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2759  ferrous iron transport protein B  28.78 
 
 		 764 aa  231  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.383541  hitchhiker  0.00159456 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1481  ferrous iron transport protein B  29.83 
 
 		 764 aa  231  3e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.725722  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1088  ferrous iron transport protein B  29.82 
 
 		 753 aa  231  3e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.0000362942  hitchhiker  0.0000000000000163165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  27.5 
 
 		 715 aa  231  3e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1294  ferrous iron transport protein B  31.4 
 
 		 844 aa  230  6e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1194  ferrous iron transport protein B  29 
 
 		 714 aa  230  7e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1595  ferrous iron transport protein B  28.3 
 
 		 764 aa  229  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000195581  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1584  ferrous iron transport protein B  28.62 
 
 		 764 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000129381  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  31.03 
 
 		 691 aa  229  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1618  ferrous iron transport protein B  28.62 
 
 		 764 aa  229  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00477082  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22730  ferrous iron transport protein B  31.76 
 
 		 778 aa  228  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.524583  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  26.86 
 
 		 712 aa  227  5.0000000000000005e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>