More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0661 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0648  small GTP-binding protein  52.62 
 
 		 650 aa  643    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  54.03 
 
 		 607 aa  664    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1182  small GTP-binding protein domain-containing protein  60.82 
 
 		 614 aa  739    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0979811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1654  small GTP-binding protein  67.21 
 
 		 659 aa  815    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000471814  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13350  ferrous iron transport protein FeoB  59.51 
 
 		 616 aa  748    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00495766  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0661  small GTP-binding protein  100 
 
 		 661 aa  1326    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.252074  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1550  small GTP-binding protein  63.69 
 
 		 663 aa  850    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000411502  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1563  small GTP-binding protein  47.15 
 
 		 607 aa  556  1e-157  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.657781  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1460  small GTP-binding protein  44.9 
 
 		 634 aa  508  9.999999999999999e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1068  small GTP-binding protein domain-containing protein  41.1 
 
 		 649 aa  444  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.857406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  38.9 
 
 		 662 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  39.26 
 
 		 663 aa  437  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1380  ferrous iron transport protein B  40.42 
 
 		 663 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2467  ferrous iron transport protein B  39.63 
 
 		 657 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000331593  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0773  ferrous iron transport protein B  38.21 
 
 		 665 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  39.81 
 
 		 663 aa  425  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  39.04 
 
 		 663 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  39.5 
 
 		 654 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  37.52 
 
 		 664 aa  403  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3531  small GTP-binding protein  39.78 
 
 		 654 aa  399  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.000000246563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1565  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.88 
 
 		 688 aa  390  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2250  small GTP-binding protein  37.1 
 
 		 689 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.633777 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2299  small GTP-binding protein  37.44 
 
 		 688 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00736056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2387  small GTP-binding protein  37.29 
 
 		 688 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.723257  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  32.84 
 
 		 571 aa  336  7.999999999999999e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05070  Ferrous iron transporter protein FeoB  34.19 
 
 		 607 aa  319  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000363083  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2489  small GTP-binding protein  33.22 
 
 		 571 aa  318  3e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1194  GTP-binding protein HSR1-related  33.23 
 
 		 606 aa  310  8e-83  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0703  small GTP-binding protein  31.86 
 
 		 572 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.313338  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1139  small GTP-binding protein  32.25 
 
 		 610 aa  306  1.0000000000000001e-81  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1503  ferrous iron transport protein B, putative  31.6 
 
 		 576 aa  303  9e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111914  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1293  small GTP-binding protein  31.28 
 
 		 576 aa  300  8e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0042575  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  31.26 
 
 		 662 aa  294  4e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0467  ferrous iron transport protein B  31.8 
 
 		 623 aa  291  3e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1872  ferrous iron transport protein B  32.25 
 
 		 658 aa  290  6e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2779  small GTP-binding protein  32.66 
 
 		 620 aa  290  7e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1277  Fe2+ transport system protein B  30.96 
 
 		 576 aa  289  1e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000691258  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  28.93 
 
 		 657 aa  279  2e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1784  GTP-binding protein, HSR1-related  33.07 
 
 		 616 aa  274  3e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0529  small GTP-binding protein  32.9 
 
 		 587 aa  273  8.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0385  hypothetical protein  31.55 
 
 		 624 aa  270  7e-71  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0589  ferrous iron transport protein B  32.45 
 
 		 637 aa  269  1e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1076  ferrous iron transport B-like  36.4 
 
 		 487 aa  269  1e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1800  Ferrous iron transport B domain protein  36.42 
 
 		 488 aa  259  2e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1828  nucleoside recognition domain protein  36.42 
 
 		 488 aa  258  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05920  Ferrous iron transport protein FeoB  34.48 
 
 		 480 aa  257  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000073202  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1073  small GTP-binding protein  28.29 
 
 		 650 aa  256  1.0000000000000001e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  30.38 
 
 		 669 aa  250  5e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  28.77 
 
 		 647 aa  247  4e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  30.19 
 
 		 669 aa  247  4.9999999999999997e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0114  GTP-binding protein HSR1-related  30.89 
 
 		 619 aa  247  6e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  29.32 
 
 		 647 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  28.92 
 
 		 647 aa  244  5e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  28.84 
 
 		 680 aa  242  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  29.4 
 
 		 662 aa  242  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  29.49 
 
 		 680 aa  237  5.0000000000000005e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3029  small GTP-binding protein  29.98 
 
 		 635 aa  236  7e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.690914 
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  31.27 
 
 		 676 aa  234  3e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  27.58 
 
 		 665 aa  233  6e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  27.67 
 
 		 848 aa  232  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  28.36 
 
 		 664 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  28.55 
 
 		 712 aa  231  3e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  30.16 
 
 		 649 aa  231  4e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0198  ferrous iron transport protein B  28.1 
 
 		 645 aa  230  6e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  27.75 
 
 		 631 aa  229  1e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  26.8 
 
 		 587 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  27.61 
 
 		 646 aa  229  1e-58  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  26.81 
 
 		 587 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  26.98 
 
 		 631 aa  226  8e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  27.7 
 
 		 662 aa  226  1e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  27.41 
 
 		 662 aa  225  2e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1713  ferrous iron transport protein B  27.43 
 
 		 645 aa  225  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.340113  normal  0.969498 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  27.07 
 
 		 662 aa  224  3e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  27.69 
 
 		 721 aa  224  4.9999999999999996e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  27.81 
 
 		 662 aa  223  7e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  27.81 
 
 		 662 aa  223  7e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0292  ferrous iron transport protein B  26.87 
 
 		 784 aa  223  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000454012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  27.7 
 
 		 662 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  27.85 
 
 		 666 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  27.7 
 
 		 662 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  27.81 
 
 		 662 aa  222  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  27.01 
 
 		 665 aa  221  3e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  26.81 
 
 		 662 aa  220  6e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  31.3 
 
 		 776 aa  219  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  27.57 
 
 		 715 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  27.92 
 
 		 664 aa  218  2e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  27.04 
 
 		 662 aa  219  2e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0735  ferrous iron transport protein B  28.32 
 
 		 648 aa  217  5e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.56734  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2584  ferrous iron transporter B  30.91 
 
 		 751 aa  214  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2711  ferrous iron transporter B  30.36 
 
 		 751 aa  214  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  25.78 
 
 		 662 aa  214  5.999999999999999e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  27.43 
 
 		 688 aa  214  5.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  26.65 
 
 		 666 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  29.91 
 
 		 725 aa  211  3e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  28.68 
 
 		 738 aa  211  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3524  ferrous iron transport protein B  27.7 
 
 		 697 aa  211  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000134401  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0316  ferrous iron transport protein B  28.25 
 
 		 725 aa  210  5e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000873753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  30.57 
 
 		 786 aa  210  8e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  28.28 
 
 		 691 aa  210  8e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  27.92 
 
 		 676 aa  210  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>