More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1550 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_1550  small GTP-binding protein  100 
 
 
663 aa  1318    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000411502  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1654  small GTP-binding protein  60.28 
 
 
659 aa  763    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000471814  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1182  small GTP-binding protein domain-containing protein  61.58 
 
 
614 aa  736    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0979811  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0661  small GTP-binding protein  63.69 
 
 
661 aa  850    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.252074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13350  ferrous iron transport protein FeoB  60.59 
 
 
616 aa  743    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00495766  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  52.42 
 
 
607 aa  645    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0648  small GTP-binding protein  54.25 
 
 
650 aa  652    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1563  small GTP-binding protein  46.49 
 
 
607 aa  545  1e-153  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.657781  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1460  small GTP-binding protein  44.48 
 
 
634 aa  480  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1380  ferrous iron transport protein B  40.32 
 
 
663 aa  426  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  39.84 
 
 
663 aa  423  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2467  ferrous iron transport protein B  40.41 
 
 
657 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000331593  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  40.03 
 
 
662 aa  421  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  39.53 
 
 
663 aa  420  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1068  small GTP-binding protein domain-containing protein  39.63 
 
 
649 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.857406  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  39.67 
 
 
663 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2250  small GTP-binding protein  38.52 
 
 
689 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.633777 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2299  small GTP-binding protein  37.98 
 
 
688 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00736056  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1565  small GTP-binding protein domain-containing protein  38.31 
 
 
688 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0773  ferrous iron transport protein B  38.91 
 
 
665 aa  397  1e-109  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2387  small GTP-binding protein  37.68 
 
 
688 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.723257  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  40.41 
 
 
654 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  37.21 
 
 
664 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3531  small GTP-binding protein  40.54 
 
 
654 aa  389  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.000000246563  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  34.59 
 
 
571 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2489  small GTP-binding protein  34.76 
 
 
571 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05070  Ferrous iron transporter protein FeoB  33.73 
 
 
607 aa  315  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000363083  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1503  ferrous iron transport protein B, putative  33.17 
 
 
576 aa  307  4.0000000000000004e-82  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111914  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1293  small GTP-binding protein  32.85 
 
 
576 aa  304  3.0000000000000004e-81  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0042575  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0703  small GTP-binding protein  32.72 
 
 
572 aa  302  1e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.313338  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1277  Fe2+ transport system protein B  33.17 
 
 
576 aa  301  3e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000691258  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1139  small GTP-binding protein  31.95 
 
 
610 aa  299  1e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0467  ferrous iron transport protein B  32.97 
 
 
623 aa  295  2e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1872  ferrous iron transport protein B  34.21 
 
 
658 aa  288  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1194  GTP-binding protein HSR1-related  30.73 
 
 
606 aa  281  3e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2779  small GTP-binding protein  31.22 
 
 
620 aa  276  1.0000000000000001e-72  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1073  small GTP-binding protein  29.41 
 
 
650 aa  266  1e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  30.37 
 
 
662 aa  266  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0385  hypothetical protein  31.57 
 
 
624 aa  265  1e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0529  small GTP-binding protein  32.88 
 
 
587 aa  261  3e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  30.73 
 
 
657 aa  258  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1784  GTP-binding protein, HSR1-related  32.29 
 
 
616 aa  256  9e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0114  GTP-binding protein HSR1-related  31.39 
 
 
619 aa  254  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05920  Ferrous iron transport protein FeoB  33.77 
 
 
480 aa  246  9.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000073202  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  31.71 
 
 
680 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  28.59 
 
 
664 aa  240  6.999999999999999e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  29.93 
 
 
680 aa  240  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1076  ferrous iron transport B-like  34.18 
 
 
487 aa  239  1e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0589  ferrous iron transport protein B  31.64 
 
 
637 aa  239  2e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1657  ferrous iron transport protein B  28.31 
 
 
631 aa  238  4e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000909964  hitchhiker  0.000224716 
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  30.79 
 
 
676 aa  237  6e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  26.88 
 
 
715 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1800  Ferrous iron transport B domain protein  34.19 
 
 
488 aa  234  5e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  29.47 
 
 
665 aa  234  5e-60  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1828  nucleoside recognition domain protein  34.19 
 
 
488 aa  233  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0856  hypothetical protein  32.32 
 
 
649 aa  234  6e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.935712  normal  0.465758 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  29.33 
 
 
662 aa  233  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  28.72 
 
 
662 aa  232  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  29.33 
 
 
662 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  28.72 
 
 
662 aa  231  4e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  29.33 
 
 
662 aa  231  4e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  28.72 
 
 
662 aa  231  4e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  29.49 
 
 
662 aa  230  6e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  28.73 
 
 
662 aa  229  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  28.57 
 
 
662 aa  229  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2723  ferrous iron transport protein B  28.57 
 
 
631 aa  227  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000251574  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0110  ferrous iron transport protein B  29.94 
 
 
668 aa  226  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0260348  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  28.24 
 
 
662 aa  225  2e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  27.53 
 
 
662 aa  224  3e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1631  ferrous iron transport protein B  26.31 
 
 
587 aa  224  3e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000698683  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0970  ferrous iron transport protein B  28.97 
 
 
669 aa  224  4e-57  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.245644  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1913  ferrous iron transport protein B  26.62 
 
 
587 aa  223  6e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000339722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  29.25 
 
 
664 aa  224  6e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1125  ferrous iron transport protein B  29.26 
 
 
669 aa  223  7e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00490528  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0465  ferrous iron transport protein B  32.84 
 
 
770 aa  223  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0754  ferrous iron transport protein B  33.14 
 
 
786 aa  221  3e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0018483  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1818  Fe2+ transport system protein B  33.02 
 
 
770 aa  221  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.375819  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  33.52 
 
 
776 aa  220  5e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3293  ferrous iron transport protein B  30.99 
 
 
741 aa  220  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.608312  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  28.06 
 
 
665 aa  219  1e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  29.58 
 
 
676 aa  219  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1343  ferrous iron transport protein B  27.38 
 
 
662 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.547756  normal  0.129294 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  27.59 
 
 
664 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  27.59 
 
 
664 aa  218  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3368  ferrous iron transport protein B  30.59 
 
 
740 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3268  ferrous iron transport protein B  29.05 
 
 
747 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.309598  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  27.98 
 
 
721 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  29.43 
 
 
728 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3412  ferrous iron transport protein B  30.4 
 
 
740 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0873  ferrous iron transport protein B  28.12 
 
 
667 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00101727  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3765  ferrous iron transport protein B  28.51 
 
 
743 aa  213  7e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  30.26 
 
 
783 aa  213  7.999999999999999e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0895  ferrous iron transport protein B  28.12 
 
 
669 aa  213  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00236216  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  27.45 
 
 
691 aa  212  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0198  ferrous iron transport protein B  26.78 
 
 
645 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2567  ferrous iron transport protein B  31.25 
 
 
753 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1785  ferrous iron transport protein B  27.6 
 
 
713 aa  212  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.84236  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  27.6 
 
 
647 aa  212  2e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4105  ferrous iron transport protein B  29.7 
 
 
738 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281443  normal  0.296674 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  29.88 
 
 
712 aa  211  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>