More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2387 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_2299  small GTP-binding protein  99.71 
 
 
688 aa  1372    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.00736056  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2250  small GTP-binding protein  79.11 
 
 
689 aa  1079    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.633777 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1565  small GTP-binding protein domain-containing protein  96.95 
 
 
688 aa  1340    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0658423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2387  small GTP-binding protein  100 
 
 
688 aa  1375    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.723257  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3681  ferrous iron transport protein B  45.6 
 
 
664 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.10548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2625  ferrous iron transport protein B  43.67 
 
 
663 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1588  ferrous iron transport protein B  43.98 
 
 
663 aa  527  1e-148  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0516402  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3001  ferrous iron transport protein B  44.36 
 
 
662 aa  523  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000135253  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1380  ferrous iron transport protein B  44.51 
 
 
663 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2467  ferrous iron transport protein B  45.18 
 
 
657 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000331593  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1068  small GTP-binding protein domain-containing protein  46.29 
 
 
649 aa  513  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.857406  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1951  ferrous iron transport protein B  43.6 
 
 
654 aa  513  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2444  ferrous iron transport protein B  44.08 
 
 
663 aa  510  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000158903  normal  0.791554 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0773  ferrous iron transport protein B  44.35 
 
 
665 aa  505  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3531  small GTP-binding protein  46.03 
 
 
654 aa  492  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.000000246563  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13350  ferrous iron transport protein FeoB  36.91 
 
 
616 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00495766  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1550  small GTP-binding protein  37.68 
 
 
663 aa  394  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000411502  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1182  small GTP-binding protein domain-containing protein  36.98 
 
 
614 aa  386  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0979811  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0661  small GTP-binding protein  37.29 
 
 
661 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.252074  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1997  small GTP-binding protein  35.01 
 
 
607 aa  379  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1654  small GTP-binding protein  35.22 
 
 
659 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000471814  hitchhiker  0.0000209414 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0648  small GTP-binding protein  37.25 
 
 
650 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1563  small GTP-binding protein  36.27 
 
 
607 aa  360  6e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.657781  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1460  small GTP-binding protein  36.83 
 
 
634 aa  340  4e-92  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1076  ferrous iron transport B-like  40.52 
 
 
487 aa  326  9e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.652309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05920  Ferrous iron transport protein FeoB  38.75 
 
 
480 aa  318  3e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000073202  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1800  Ferrous iron transport B domain protein  36.76 
 
 
488 aa  300  6e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1872  ferrous iron transport protein B  32.44 
 
 
658 aa  296  8e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1828  nucleoside recognition domain protein  36.56 
 
 
488 aa  296  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0467  ferrous iron transport protein B  32.64 
 
 
623 aa  294  3e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1277  Fe2+ transport system protein B  31.74 
 
 
576 aa  289  1e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000691258  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1293  small GTP-binding protein  30.39 
 
 
576 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0042575  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1503  ferrous iron transport protein B, putative  30.09 
 
 
576 aa  266  1e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.111914  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0114  GTP-binding protein HSR1-related  32.79 
 
 
619 aa  265  2e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1784  GTP-binding protein, HSR1-related  31.28 
 
 
616 aa  262  2e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1139  small GTP-binding protein  31.39 
 
 
610 aa  261  4e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0589  ferrous iron transport protein B  31.85 
 
 
637 aa  258  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2489  small GTP-binding protein  32.07 
 
 
571 aa  257  6e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0703  small GTP-binding protein  30.25 
 
 
572 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.313338  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1194  GTP-binding protein HSR1-related  28.8 
 
 
606 aa  251  4e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0385  hypothetical protein  30.34 
 
 
624 aa  246  8e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1668  ferrous iron transport protein B  29.33 
 
 
662 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1569  ferrous iron transport protein B  25.86 
 
 
646 aa  238  4e-61  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2779  small GTP-binding protein  29.57 
 
 
620 aa  234  3e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1140  ferrous iron transport protein B  28.21 
 
 
680 aa  234  5e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000225033  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0188  ferrous iron transport protein B  28.14 
 
 
657 aa  234  6e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000355145  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1508  ferrous iron transport protein B  28.85 
 
 
665 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.225021  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2658  ferrous iron transport protein B  30.3 
 
 
664 aa  231  3e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0434  ferrous iron transport protein B  27.99 
 
 
665 aa  230  6e-59  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0975  ferrous iron transport protein B  27.45 
 
 
647 aa  229  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0779  ferrous iron transport protein B  28.95 
 
 
688 aa  228  2e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.328587  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0260  ferrous iron transport protein B  27.44 
 
 
647 aa  228  3e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0307  ferrous iron transport protein B  29 
 
 
662 aa  227  7e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4703  ferrous iron transport protein B  29.2 
 
 
662 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.580342  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4542  ferrous iron transport protein B  29.2 
 
 
662 aa  224  4e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5064  ferrous iron transport protein B  29.2 
 
 
662 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.939249  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1458  ferrous iron transport protein B  28.75 
 
 
716 aa  224  4e-57  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.137578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4560  ferrous iron transport protein B  29.2 
 
 
662 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.185124  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4947  ferrous iron transport protein B  29.2 
 
 
662 aa  224  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4932  ferrous iron transport protein B  28.85 
 
 
662 aa  223  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4928  ferrous iron transport protein B  29.05 
 
 
662 aa  224  6e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4965  ferrous iron transport protein B  28.81 
 
 
662 aa  223  7e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2071  ferrous iron transport protein B  31.26 
 
 
774 aa  223  9e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3474  ferrous iron transport protein B  28.66 
 
 
662 aa  221  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0970  ferrous iron transport protein B  30.19 
 
 
666 aa  221  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0839864 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0198  ferrous iron transport protein B  27.4 
 
 
645 aa  220  6e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1653  ferrous iron transport protein B  26.51 
 
 
647 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.888316 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1713  ferrous iron transport protein B  25.35 
 
 
645 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.340113  normal  0.969498 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4642  ferrous iron transport protein B  28.05 
 
 
662 aa  218  2.9999999999999998e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0095  ferrous iron transport protein B  31.86 
 
 
676 aa  216  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3855  hypothetical protein  31.7 
 
 
776 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.107886  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0635  ferrous iron transport protein B  28.91 
 
 
676 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000306814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2325  ferrous iron transport protein B  29.93 
 
 
666 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.907395  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1015  ferrous iron transport protein B  32.81 
 
 
759 aa  214  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.913336 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1933  ferrous iron transport protein B  30.69 
 
 
774 aa  213  9e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.651093  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2126  ferrous iron transport protein B  27.46 
 
 
664 aa  213  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20050  ferrous iron transporter FeoB  28.37 
 
 
749 aa  213  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.558981  normal  0.661098 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2572  ferrous iron transport protein B  28.74 
 
 
664 aa  212  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2626  ferrous iron transport protein B  28.74 
 
 
664 aa  212  2e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.51649  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2157  small GTP-binding protein domain-containing protein  27.83 
 
 
571 aa  212  2e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1481  ferrous iron transport protein B  30.12 
 
 
764 aa  211  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.725722  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0193  Fe2+ transport system protein B  27.3 
 
 
691 aa  211  3e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2669  ferrous iron transport protein B  29.79 
 
 
725 aa  211  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0654  Fe2+ transport system protein B  27.76 
 
 
712 aa  211  4e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3459  ferrous iron transport protein B  28.55 
 
 
715 aa  211  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000760098  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0675  ferrous iron transport protein B  30.19 
 
 
732 aa  210  8e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.183925  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0793  ferrous iron transport protein B  28.61 
 
 
728 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.585929  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3029  small GTP-binding protein  28.8 
 
 
635 aa  208  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.690914 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1951  ferrous iron transport protein B  28.16 
 
 
680 aa  209  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0016959  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0344  ferrous iron transport protein B  28.35 
 
 
724 aa  208  3e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00337716  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2325  ferrous iron transport protein B  27.36 
 
 
848 aa  207  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2074  ferrous iron transport protein B  29.09 
 
 
712 aa  207  4e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1784  ferrous iron transport protein B  30.12 
 
 
764 aa  207  5e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0618  ferrous iron transport protein B  25.57 
 
 
721 aa  207  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0536695  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2470  ferrous iron transport protein B  31.09 
 
 
786 aa  207  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2414  ferrous iron transport protein B  29.1 
 
 
772 aa  207  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331306  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0882  ferrous iron transport protein B  28.35 
 
 
720 aa  206  8e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000109469  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2670  ferrous iron transport protein B  29.25 
 
 
764 aa  206  1e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.360786  normal  0.0737302 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2843  ferrous iron transport protein B  30.63 
 
 
712 aa  206  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0623  ferrous iron transport protein B  28.7 
 
 
783 aa  206  2e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.626283  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>